在肠道和大自然中分解糖苷

时间:2021年11月18日
来源:Nature Communications

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筑波大学的研究人员研究了被称为c -糖苷的含糖分子的分解过程,并确定了存在于肠道和土壤细菌中的c -糖苷去糖基化酶。结构和生化分析揭示了这些酶在c -糖苷代谢中的结构和功能,并阐明了这一过程在肠道和土壤微生物中的共性。

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很少有工具在坏掉的时候更有用了,但c -糖苷就是这种情况,这种分子存在于许多植物、食物和药物中。要被身体使用,c -糖苷必须被分解。日本的研究人员发现了这一过程如何发生的新见解。

在发表在《自然通讯》杂志上的一项研究中,筑波大学的研究人员对c -糖苷代谢的机制有了新的了解。c -糖苷含有一个通过碳-碳键连接的糖基。

人类经常摄入水果和蔬菜中的c -糖苷。c -糖苷的分解通过C-C键的裂解发生在大肠中,这是人体利用这些分子所必需的。然而,这一过程中涉及的催化机制尚不完全清楚。筑波大学的研究人员研究了c -糖苷在人体和自然界中的代谢机制和成分。

资深作者Michihiko Kobayashi说:“通过同化筛选和基因组挖掘,我们能够识别肠道细菌和土壤细菌中存在的多种c -糖苷去糖基化酶。”

研究团队利用生化技术鉴定了c -糖苷去糖基化酶(CGDs)在c -糖苷代谢中的作用和特异性。结构分析揭示了来自肠道和土壤细菌的CGDs的独特结构,阐明了其结构与功能之间的关系。

作者Takuto Kumano解释说:“我们发现肠道和土壤细菌的CGDs都是选择性C-C键切割反应的催化剂。”“根据我们的分析,我们提出了c -糖苷分解过程中涉及酸/碱催化的C-C键裂解机制。”

研究人员观察到肠道细菌中CGDs的结构与土壤细菌中CGDs的结构不同。然而,c -糖苷代谢反应的性质在土壤和肠道微生物中似乎是共同的。

糖苷在自然界中随处可见,并存在于某些治疗药物中,例如,心力衰竭。进一步了解参与c -糖苷代谢的酶将提供更多的见解,了解身体如何分解这些分子使用,以及这一过程如何被用于激活含有c -糖苷的药物。


文章标题

C-Glycoside metabolism in the gut and in nature: Identification, characterization, structural analyses and distribution of C-C bond-cleaving enzymes

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