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英国伦敦大学学院（UCL）的研究人员近日发文称，针对个体患者来定制全基因组测序分析可以使罕见病的诊断率翻一番。
英国伦敦大学学院（UCL）的研究人员近日在《Nature Communications》杂志上发文称，针对个体患者来定制全基因组测序分析可以使罕见病的诊断率翻一番。
2018年，英国卫生部宣布了一项NHS基因组医学服务，允许罕见病患者读取他们的整个遗传密码，以便提供急需的诊断。然而，对这些数据的解释可能颇具挑战性。许多患有复杂而罕见的遗传病的人至今仍没有得到分子答案。
伦敦大学学院的研究人员希望为此类患者提供更好的诊断。为此，他们测试了如何通过由专科医生、生物信息学家和科学家组成的基因组医学团队来提高NHS诊断实验室的能力，而不仅仅是依靠标准的半自动数据分析。
研究团队重新评估了未确诊的病例，以便找出有望指导个性化分析的线索。随后，他们采用了更多的生物信息学方法，利用先进的计算机技术来鉴定患者DNA中的遗传改变，这些改变可能导致疾病，但在常规检测中被忽略了。
这项研究包括102名未确诊的患者，他们疑似患有原发性的线粒体疾病，包括一组无法治愈的遗传疾病，与一系列的健康问题、严重残疾和寿命缩短有关。这些患者已经通过NHS的10万人基因组计划进行了全基因组测序。
在采用个性化的分析方法后，诊断率从16.7%提高到31.4%。研究人员还在另外3.9%的患者中检测到潜在的致病变异。
共同通讯作者、伦敦大学学院皇后广场神经学研究所的Robert Pitceathly博士表示：“NHS已在先进的基因技术上投入了大量资金。因此，英国已经在全基因组测序诊断的前沿确立了自己的地位。然而，一些罕见遗传病的患者在基因组分析后仍然没有得到分子诊断。”
“我们相信，投资于专业的基因组医学团队是至关重要的，这有助于获得多学科的专业知识，并最大限度提高诊断率。平均而言，我们研究中的患者要等待30多年才能得到诊断——我们现在有能力解决这类病例，但需要足够的人力规划来支持NHS诊断实验室实现这一目标。”
对于患者而言，诊断结果很重要，因为他们能够根据这个结果来制定生育计划，选择人工受精和参与临床试验。Pitceathly博士称：“在这项研究中，每一个新的基因诊断都对患者的医护产生直接影响，包括针对心脏问题、听力损失和糖尿病进行额外的检查，以及参加临床试验。”
Rachel North是参与这项试验的患者之一，她认为诊断结果“改变了生活”。从那以后，她开始接受疾病并发症（比如骨质疏松）的筛查，这些疾病都得到了治疗。
“在过去的20年里，我去过很多家医院，花了很长时间来寻找病因。我从来没有想过有一天我会得到诊断，”Rachel说。
她还谈到：“我很担心我12岁的儿子，担心我的病情会不会影响到他。因此，得知这是一种罕见的隐性遗传病，对我来说是一种解脱，消除了对未知的恐惧。有了诊断结果，我可以研究我的病情，并非常积极地进行管理。”
作者之一、大奥蒙德街儿童医院代谢医学科的James Davison博士表示：“为患有罕见、复杂疾病的儿童和成人做出诊断的过程可能是一个非常漫长的过程，而基因组医学为实现这一目标提供了一种变革性的强大工具。”
“这项研究强调了临床医生和遗传科学家之间的合作在解释基因组测序结果方面的重要性，有望最大限度地提高诊断的机会，从而帮助指导医疗管理和治疗选择。”
原文检索
Macken, W.L., Falabella, M., McKittrick, C. et al. Specialist multidisciplinary input maximises rare disease diagnoses from whole genome sequencing. Nat Commun 13, 6324 (2022). https://doi.org/10.1038/s41467-022-32908-7
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