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本研究揭示了蝙蝠白鼻病（White-nose syndrome, WNS）的病原体并非单一物种，而是由两种宿主特异性的隐存种Pseudogymnoascus destructans（Pd-1和Pd-2）共同引起。通过5,479份欧亚大陆菌株的基因组分析，研究人员发现两物种存在显著遗传分化（FST中位数0.79）和宿主偏好性（Pd-1主要感染Myotis myotis/blythii，Pd-2偏好M. daubentonii），并通过群体遗传学追溯北美疫情源头至乌克兰波迪利亚地区。该成果发表于《Nature》，为病原体多样性研究提供了范式，强调需将病原遗传变异纳入疾病防控策略。
蝙蝠白鼻病（White-nose syndrome, WNS）是近二十年对蝙蝠种群威胁最严重的疾病之一，由真菌病原体Pseudogymnoascus destructans（P. destructans）引发。此前研究多聚焦于环境因素或宿主特性对疾病的影响，却忽视了病原体本身的遗传变异。更矛盾的是，该病在欧亚大陆仅引起轻微症状，而在北美却导致大规模死亡，这种地理差异的机制长期未明。随着全球洞穴探险活动增加，病原跨洲传播风险加剧，但缺乏对病原多样性的认知严重制约了防控策略的制定。
为破解这些谜团，由Nicola M. Fischer和Sébastien J. Puechmaille领衔的国际团队开展了一项跨大陆研究。他们建立了包含5,479份菌株的参考库（覆盖27国264个地点），结合群体基因组学与生态学分析，最终在《Nature》发表突破性发现：引发WNS的并非单一物种，而是两个具有宿主特异性的隐存真菌物种。
研究主要采用四项关键技术：1) 基于18个微卫星位点的群体遗传分析（5,479株菌株）；2) 纳米孔长读长结合Illumina短读长测序（12株代表性菌株）；3) 全基因组比较（包括664个保守BUSCO基因和10 kb窗口系统发育分析）；4) 空间贝叶斯推断（SPASIBA）溯源北美疫情。
Two sympatric clades cause the disease
微卫星分型揭示P. destructans存在两个遗传簇（Pd-1和Pd-2），二者在欧亚大陆广泛同域分布（23个地点共存），且能从同一拭子中分离。北美疫情菌株均属于Pd-1分支，证实为单次克隆引入事件。
Genomic divergence between clades
全基因组分析显示两簇分化显著：BUSCO基因序列差异达5倍（簇间0.14% vs 簇内0.022-0.026%），全基因组FST中位数0.88。结构变异分析发现14.4%的基因簇（1,316个）为簇特异性，且严格隔离模型支持两簇75万代前分化。
Host specialization drives ecological niche
宿主偏好性分析表明，Pd-1主要感染鼠耳蝠复合体（Myotis myotis/blythii，占87%），而Pd-2偏好水鼠耳蝠（M. daubentonii，占39%）。尽管二者生存环境相似（温度7-8°C，湿度6-8 g/m3），但实验室培养显示Pd-2菌落色素沉积显著差异（P<0.001）。
Population structure and origin
通过DAPC（判别分析主成分）和EEMS（有效迁移表面估计）发现，Pd-1在欧洲存在三条遗传边界（巴尔干半岛、波兰-斯洛文尼亚线、法国-伊比利亚线）。溯源分析将北美菌株的起源锁定乌克兰波迪利亚地区（6×109倍似然比），该地拥有世界级超长洞穴系统，与纽约州洞穴探险活动存在历史关联。
这项研究从根本上改写了白鼻病的病原认知框架：两种隐存种的存在解释了欧亚-北美疾病表型差异，宿主特异性则提示不同蝙蝠类群面临差异化风险。研究首次证实P. destructans存在广泛重组（两簇均含MAT1-1和MAT1-2交配型），但严格的生殖隔离使其保持基因组独立性。从应用角度看，发现第二种病原体（Pd-2）的潜在入侵风险，为全球生物安全敲响警钟——正如两栖动物壶菌病（Batrachochytrium）的历史教训所示，忽视病原多样性可能导致灾难性后果。
研究团队特别指出，公民科学网络（数百志愿者同步采样）对实现大陆尺度监测具有不可替代的作用。该成果为"One Health"理念提供了经典案例，强调未来疾病防控必须整合病原体遗传学、宿主生态学和人类活动三维数据。
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