整合基因组决定因素可提高少突单核细胞慢性粒单核细胞白血病的诊断准确性 现已上市可供购买

摘要

最近对单核细胞计数阈值的更新将寡单核细胞性慢性粒单核细胞性白血病（OM-CMML）认定为CMML的早期形式。然而，如果不考虑生物学和基因组因素，这些变化的临床有效性仍然不确定。在这项研究中，我们使用无监督聚类方法分析了911名患者（249例为OM-CMML，359例为显性CMML，303例为骨髓增生异常综合征），以评估基因组决定因素在细化CMML诊断中的作用。我们的研究结果表明，CMML的分子特征（如TET2突变的纯合子形式或SRSF2-TET2突变）与特定的转录组类型、单核细胞偏态、典型单核细胞增多以及OM-CMML向显性CMML进展的更高风险相关。我们开发了一个加权基因组模型和诊断工作流程，证明将基因组特征与骨髓中单核细胞的频率结合起来可以更准确地预测OM-CMML向显性CMML的进展。这些发现支持将基因组决定因素和我们的临床适用诊断工作流程整合到CMML诊断框架中，以提高诊断准确性。

意义：

通过对大量患者进行全面的临床和基因组分析，结合免疫表型和转录细胞学研究，本研究表明，在OM-CMML的诊断标准中纳入基因组决定因素可以提高诊断准确性，并有助于更精准地识别早期CMML，从而避免误诊。

数据可用性

本研究的数据支持资料可向 corresponding author G. Montalban-Bravo 请求获取。请联系 [e-mail]。描述如何运行我们的分析并重现结果的代码和文档是开源的，可在 GitHub 仓库中获取：https://github.com/ChongWuLab/OM-CMML-replication-codes。此处分析的 BM CD34⁺ 细胞的批量 RNA-seq 数据已存储在 Gene Expression Omnibus 中，访问编号为 GSE314218。处理后的 RNA-seq 数据也可根据请求提供给 corresponding author。