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最近发现B细胞特异性的激活诱导的胞苷脱氨酶(AID-)可能也与RNA编辑因子一样,与DNA直接相互作用。Nature上的最新报道发现AID能将脱氧胞苷脱氨,研究者认为这个过程可能与抗体基因的多样化有关。
AID对于三种类型的抗体基因多样化都是必需的,这三种类型是体细胞超突变(SHM-somatic hypermutation)-抗原结合可变区中单个碱基对的改变;从上游V假基因序列进行序列拷贝的基因转变(gene conversion)和类转变重组(CSR-class-switch recombination)在同一类序列中进行序列重组产生抗体亚型。但是AID对这些过程的作用还不清楚,也引起了很多注意。
AID与一个特异性编辑APOB mRNA的胞苷脱氨酶APOBEC1同源。以前人们猜想可能AID也是某一个酶的RNA编辑因子,但Neuberger and colleagues却发现SHM,基因转变和CSR可能都起始于AID与DNA相结合,将脱氧胞苷脱氨,进而将U转变为G的一个错配损伤。
研究者检测了4-5种损伤的修复方法,发现通过碱基外切修复都不能完全的修复这些损伤。首先错配不能被完全修复,DNA复制产生了C-T或G-A的转变。其次碱基外切修复将尿密啶切除,复制导致C或G被另外三种碱基中的一个取代。第三点U-G损伤经历的错配修复可能与致错多聚酶有关,与SHM的第二个时相很符合。第四点,通过上游V假基因进行的模板介导的修复能导致基因转变。最后损伤如果发生在转变位点,另一个位点有关的修复会产生CSR。
研究者在大肠杆菌中表达AID,发现细菌对抗抗生素的能力上升了,就是说基因突变率增加了,突变的倾向也是C-T和G-A,这说明AID确实具有对脱氧胞苷的脱氨能力。
这个研究强烈支持了DNA脱氨酶对抗体多样性可能有作用,但AID对抗体基因的具体作用还是需要深入研究的。
相关文章及链接:
ORIGINAL RESEARCH PAPERS
Petersen-Mahrt, S. K., Harris, H. S. & Neuberger, M. S. AID mutates E. coli suggesting a DNA deamination mechanism for antibody diversification. Nature 418, 99-103 (2002) | Article | PubMed |
FURTHER READING
Kinoshita, K. & Honjo, T. Linking class-switch recombination with somatic hypermutation. Nat Rev Mol Cell Biol 2, 493-503 (2001) | Article | PubMed |
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