编辑推荐:
Cell出版社旗下的老牌发育生物学杂志Developmental Cell,创刊于2001年,该期刊在细胞生物学类期刊中影响因子排在第九位,在发育生物学同类期刊中排在第二位。近期来自第二军医大,以及中科院营养科学研究所的研究人员分别在此期刊上,报道了长链非编码RNA(lincRNA),以及Wnt经典信号通路新调控因子的作用新机制。
生物通报道:Cell出版社旗下的老牌发育生物学杂志Developmental Cell,创刊于2001年,该期刊在细胞生物学类期刊中影响因子排在第九位,在发育生物学同类期刊中排在第二位。近期来自第二军医大,以及中科院营养科学研究所的研究人员分别在此期刊上,报道了长链非编码RNA(lincRNA),以及Wnt经典信号通路新调控因子的作用新机制。
第二军医大学发育生物学研究所刘厚奇教授研究组发现了一个lincRNA:linc-RoR可能是连接miRNAs网络和核心转录因子,如OCT4,SOX2,和Nanog的一种关键竞争性内源RNA。
这项成果无论是对于干细胞自我更新研究,还是miRNAs的研究都具有重要意义,因此现任美国耶鲁大学医学院耶鲁干细胞中心主任的华裔科学家林海帆也在这一期刊上,围绕这项研究展开了探讨,他表示,“这项研究指出了长链非编码RNA(lincRNA)在转录后基因调控层面的又一新作用,研究人员指出linc-RoR能通过靶向miR-145,维持人类胚胎干细胞的自我更新能力,调控核心多能因子Oct4, Nanog和Sox2。”
在这篇文章中,研究人员发现linc-RoR与miRNA应答元件具有相同核心转录因子,并且linc-RoR能防止自我更新人类胚胎中这些核心转录因子出现miNRA介导的抑制作用。因此研究人员指出,linc-RoR与核心转录因子和miRNA一道,形成了一个调控胚胎干细胞维持和分化的反馈环路。
另外一篇文章中,上海生科院营养科学研究所宋海云研究组与瑞士苏黎世大学Basler研究组合作,利用转基因果蝇库进行遗传学筛选,从中发现了Wnt/Wingless信号通路的新调节因子并揭示了其中的调控机理。
研究人员对发现的候选基因进行了验证,确定了三个新调节因子。博士生黄大舜和尹定子对其中一个调节因子Nek2的调控机理进行了深入研究,发现Nek2通过磷酸化修饰关键蛋白Dishevelled影响信号的传递。
有趣的是,Nek2对Dishevelled的磷酸化有双重作用:对其N端的修饰能增强Dishevelled活性和促进信号传递;在信号强度超过一定阈值后通过对其C端的多重磷酸化介导Dishevelled的降解和抑制信号通路的过度激活。通过这种双重调控,既能在信号通路开启时快速传递信号,又能防止信号通路不适当地持续激活,从而保证Wingless信号通路对下游基因表达的精细调控。最后,黄大舜还找到了与Nek2有冗余功能的基因dco,在同时降低Nek2和dco的功能时,会严重阻碍Wingless信号通路下游基因的表达和果蝇的器官发育。(生物通:万纹)
原文摘要:
Repressing the Repressor: A lincRNA as a MicroRNA Sponge in Embryonic Stem Cell Self-Renewal
Large intergenic noncoding (linc) RNAs constitute a new dimension of posttranscriptional gene regulation. In this issue of Developmental Cell, Wang et al., 2013 find that linc-RoR maintains human embryonic stem cell self-renewal by functioning as a sponge to trap miR-145, thus regulating core pluripotency factors Oct4, Nanog, and Sox2.
Systematic Screening of a Drosophila ORF Library In Vivo Uncovers Wnt/Wg Pathway Components
We created a site-directed UAS-ORF library of 655 growth-regulating genes in Drosophila. This library represents a large collection of genes regulating cell cycle, cell size, and proliferation and will be a valuable resource for studying growth regulation in vivo. By using misexpression of genes, we prevent problems arising from genetic redundancy and can uncover novel gene functions. To validate the usefulness of this library, we screened for Wingless (Wg) pathway components. We used a combination of experimental and bioinformatic approaches to predict candidates and identified three serine/threonine kinases as regulators of Wg signaling. We show that one of these, Nek2, optimizes pathway response by direct phosphorylation of Dishevelled. In addition, we describe functional relations for roughly 5% of all Drosophila genes and identify a large number of genes that regulate cell size, proliferation, and final organ size upon misexpression.
生物通 版权所有