揭示少突胶质细胞沉默元件:解析常染色体显性遗传性白质脑病(ADLD)致病机制的关键突破

时间:2025年2月6日
来源:Nature Communications

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为探究非编码调控元件对疾病表型组织特异性的影响,研究人员针对常染色体显性遗传性白质脑病(ADLD)展开研究。他们发现了一个少突胶质细胞沉默元件,其缺失可致 ADLD。这为理解疾病发病机制及遗传检测提供重要依据。

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在神经科学领域,许多神经系统疾病的发病机制一直是科研人员努力攻克的难题。常染色体显性遗传性白质脑病(Autosomal Dominant Leukodystrophy,ADLD)是一种致命的成人发病的进行性神经系统疾病,主要病理特征是中枢神经系统(CNS)广泛脱髓鞘 。大多数 ADLD 病例由涉及层粘连蛋白 B1 基因(LMNB11)的串联基因组重复引起,少数由该基因上游的基因组缺失导致。然而,LMNB1 在多种细胞类型中都有表达,为何其异常会特异性地影响中枢神经系统,引发脱髓鞘表型,这一直是个未解之谜。此外,携带 LMNB1 基因重复的个体并非都表现出疾病症状,这背后的机制也不清楚。为了解开这些谜团,来自美国匹兹堡大学等多个研究机构的研究人员开展了深入研究,相关成果发表在《Nature Communications》上。
研究人员主要运用了以下关键技术方法:首先,通过全基因组阵列比较基因组杂交(aCGH)技术,对多个家族进行检测,识别出基因组重复和缺失情况。其次,利用 CRISPR/Cas9 技术,在多种细胞系和小鼠模型中进行基因组编辑,构建相关模型以研究基因表达变化。再者,借助 RNA 干扰(RNAi)技术,敲低特定基因表达,探究其对 LMNB1 表达的影响。最后,运用生物信息分析方法,如 Orca 预测模型,分析 3D 基因组结构变化。

研究结果如下:

  1. 大串联基因组重复不一定导致 ADLD:研究人员在三个独立的多代家族中发现,涉及 LMNB1 的大串联基因组重复(命名为 LN - Dups)并不一定会引发 ADLD。这些家族中的个体,尽管携带 LMNB1 基因重复,但磁共振成像(MRI)检查未显示出白质脑病的变化。这表明,仅仅拥有额外的 LMNB1 基因拷贝不足以导致 ADLD,重复的大小、方向等因素在预测致病性时需要被考虑。
  2. LMNB1 在 ADLD 患者组织中差异表达:分析 ADLD 患者的成纤维细胞和脑样本发现,ADLD - Dup 成纤维细胞中 LMNB1 表达增加,而 ADLD 缺失患者的成纤维细胞中未增加。在 ADLD 患者的脑样本中,额叶白质(疾病中脱髓鞘的部位)的 LMNB1 表达比年龄和性别匹配的对照组增加了约 4 - 7 倍,而额叶灰质中的表达无显著变化。这表明,在 ADLD 患者中,可能存在一种特定的转录调控机制,使 LMNB1 在白质中过度表达。
  3. 少突胶质细胞并非唯一受 LMNB1 过表达影响的细胞:研究人员通过实验发现,在小鼠模型中,不仅少突胶质细胞(OLs)会受到 LMNB1 过表达的影响,施万细胞(负责外周髓鞘形成)过表达 LMNB1 也会导致外周神经髓鞘化异常,出现年龄依赖性脱髓鞘。然而,在 ADLD 患者中,外周神经传导未出现缺陷。这提示在 ADLD 患者中,OLs 的特异性参与更可能是由于 LMNB1 在中枢神经系统的靶向过表达。
  4. 存在调控 LMNB1 表达的组织特异性沉默元件:通过分析 LMNB1 结构变异,研究人员提出存在一个假定的组织特异性沉默元件,该元件在 OL 谱系细胞中下调 LMNB1 表达。在 ADLD - Dup 和 ADLD - Del 中,该沉默元件的缺失或破坏会导致 LMNB1 过表达,而 LN - Dups 由于包含该沉默元件,LMNB1 基因仍受抑制,不会在 OLs 中特异性过表达。研究人员通过 CRISPR/Cas9 介导的基因组删除实验,在小鼠细胞系和小鼠模型中验证了这一假设。
  5. 沉默元件的作用机制:进一步研究发现,沉默元件中的 CTCF 结合位点在介导 Lmnb1 沉默中起重要作用。CTCF1 和 CTCF2 位点的缺失会导致 Oli - neu 细胞中 Lmnb1 表达增加。此外,PRC2 复合体与 CTCF2 结合,在 OL 特异性 Lmnb1 沉默中发挥作用。在 OLs 中,19kb 沉默元件区域富含 H3K27me3,PRC2 复合体的敲低会导致 Lmnb1 表达增加。

研究结论表明,ADLD 是由 LMNB1 在 OLs 中的转录靶向过表达引起的,这一过程由与 OL 特异性沉默元件的相互作用丧失所介导,而非仅仅是 LMNB1 基因拷贝数的增加。该研究为解释 ADLD 的组织特异性和发病机制提供了统一的框架,有助于理解其他致病性结构变异的潜在影响,对遗传检测具有重要意义。同时,研究结果还表明 OLs 是 ADLD 疾病过程的主要驱动细胞类型,这为设计以降低 LMNB1 水平为策略的治疗方法提供了重要方向,有望减少对其他细胞类型的潜在副作用。此外,该研究还揭示了沉默元件在组织特异性和疾病发生中的作用,为进一步研究非编码调控元件的功能提供了新的视角。

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