CuXS@SRB生物纳米杂交材料用于超灵敏电化学检测辅酶F420:甲烷生成古菌的特异性生物标志物

时间:2026年2月9日
来源:Biosensors and Bioelectronics

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甲烷生成古菌的辅酶F420电化学传感检测研究开发了一种基于CuS@SRB生物纳米杂交材料的快速电化学传感器,实现0.01-1000 nM超宽量程检测(限值2.8 pM),并成功将F420浓度与古菌丰度(10⁰-10⁷ CFU/mL)直接关联,应用于真实水体环境检测。

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Xueqi Hu|You Xu|Xiaoling Liu|Mengna Dong|Airong Zhang|Jiawei Dai|Zhuo Huang|Davide Raffaele Ceratti|Hongfang Liu|Guangfang Li
能源转换与储存材料化学国家重点实验室(教育部),华中科技大学材料化学与服务失效湖北省重点实验室,中国武汉430074

摘要

产甲烷古菌在全球甲烷排放以及油气田设备腐蚀过程中起着至关重要的作用。实时检测产甲烷古菌对于预测甲烷(CH4)排放和提供微生物腐蚀的早期预警至关重要。传统的检测方法通常需要较长的处理时间且结果不够准确,而本文开发了一种基于产甲烷古菌特异性辅酶F420的快速电化学生物纳米杂交传感器,该方法通过在孵育培养过程中在电活性硫酸盐还原菌(SRB)表面原位生长硫化铜(CuxS)纳米颗粒来实现。在0.01-1000 nM的宽范围内,电还原电流密度与F420浓度之间存在负线性关系,检测限低至2.8 pM(信噪比=3)。该生物纳米杂交传感器对pH变化、温度变化和其他化学物质的干扰表现出很强的鲁棒性。我们通过CuxS中的Cu+与辅酶F420中的氮中心之间的路易斯酸碱相互作用解释了其优异的电化学传感性能。该纳米杂交传感器能够直接定量检测M. maripaludis的数量,范围为100-107 CFU/mL,检测限为1.8 CFU/mL,在实际池塘环境中的回收率为96.65-103.90%。本研究通过利用电活性微生物构建高性能生物纳米杂交电化学传感器,为产甲烷古菌的快速检测开辟了新的途径,该方法在甲烷排放、碳循环分析和微生物腐蚀早期预警系统中具有广泛的应用前景。

引言

甲烷(CH4)是仅次于二氧化碳(CO2)的第二大温室气体,其在20年内的全球变暖潜力是CO2的84倍(Thanigaivel等人,2022年;Wen和Song,2022年;Zhang,2022年;Orege等人,2022年;Li等人,2023年)。大量的甲烷排放来源于自然生态系统,如湖泊、湿地、稻田和陆地渗漏系统。仅湖泊的甲烷排放就约占全球总甲烷排放量的四分之一(Cavicchioli等人,2019年;Ahila等人,2014年;Hinrichs等人,1999年;Jiang等人,2008年),这与产甲烷古菌的代谢活动密切相关(Juottonen等人,2006年)。产甲烷古菌通过涉及氢、甲基或乙酸的独特代谢途径将复杂的有机物质转化为甲烷(Greening等人,2016年)。此外,这些古菌还以引起腐蚀而闻名,尤其是在油气田中,它们通过直接从金属中捕获电子来维持自身的代谢(Wu等人,2024年)。鉴于它们在甲烷生成和金属腐蚀中的核心作用,实时监测产甲烷古菌的数量和生理状态对于温室气体风险评估以及建立微生物诱导腐蚀的早期预警系统至关重要。
目前,产甲烷古菌的定量检测主要依赖于针对16S rRNA基因或mcrA功能基因的定量实时荧光PCR(qPCR)(Aydin等人,2015年)。尽管这种方法具有高度特异性和灵敏度,但它存在一些固有的缺点:操作繁琐、成本高昂,并且无法区分活细胞、死细胞或休眠细胞,从而导致潜在的假阳性或假阴性结果(Ottesen等人,2006年)。许多研究表明,微生物中特征性辅因子或功能酶的浓度与其数量和代谢活性密切相关。原则上,可以通过靶向这些生物标志物来实现活微生物的定量分析(Liu等人,2023年;Li等人,2015年;Bai等人,2021年)。辅酶F420是8-羟基-5-脱氨烟酰胺的衍生物,在所有已知的产甲烷古菌中含量较高,但在非产甲烷微生物中也存在微量(Gorris和van der Drift,1994年;Schauer和Ferry,1986年;Greening等人,2016年)。在依赖氢的产甲烷途径中(占自然界甲烷产量的70%以上),F420作为关键的低电位电子载体参与CO2的逐步还原过程,使其成为产甲烷古菌的独特生物标志物(DiMarco等人,1990年)。一些研究利用F420的自荧光特性或F420H2还原形式与氢化酶之间的竞争反应来推断产甲烷系统中的原位氢分压(Purwantini和Mukhopadhyay,2009年)。据我们所知,目前尚无全面的研究利用测量的F420浓度作为环境栖息地中产甲烷古菌数量和代谢活性的直接定量指标。
电化学生物传感器由于其高灵敏度、快速响应和现场检测能力,在活微生物和功能分子的检测方面显示出巨大潜力(Kilic等人,2023年;Patel等人,2022年)。最近,使用电活性细菌作为生物模板和信号放大单元的仿生混合策略在电化学生物传感领域引起了广泛关注(Price和Boyd,2020年;Yu等人,2019年;Gao等人,2022年)。在自然厌氧生态系统中,SRB和产甲烷古菌在硫酸盐-甲烷转化区常常表现出竞争-共生关系(Yang等人,2008年)。本研究提出了一种在含有Desulfovibrio属 SRB的微生物反应介质中制备硫化铜包覆的硫酸盐还原菌(CuxS@SRB)纳米杂交体的创新方法。我们利用SRB代谢产生的硫化物作为硫源,SRB作为生物模板,并在SRB孵育培养过程中逐渐形成的还原微环境,具体来说,我们观察到在向微生物介质中引入适量Cu2+后,原位生长CuxS(x=1-2)纳米颗粒,成功获得了CuxS@SRB生物纳米杂交体。这种生物纳米杂交体对辅酶F420表现出高度敏感的电化学线性响应,同时具有优异的选择性、重现性和长期稳定性。这使我们能够基于F420的定量结果建立电化学信号与产甲烷古菌数量之间的关联。这种新方法可以有效检测实际环境中的活跃产甲烷古菌种群。总之,我们通过原位表征、电化学阻抗谱分析、吸附动力学实验和密度泛函理论(DFT)计算揭示了F420与生物纳米杂交体之间的特定化学吸附作用。

材料与方法

详细的实验步骤见补充材料。

CuxS@SRB纳米杂交体的合成

如图1所示,CuxS@SRB-1纳米杂交体是通过原位生物矿化方法合成的。SRB带负电荷的细胞壁(Zeta电位约为-52.80 mV)促进了Cu2+离子的静电吸附,从而启动了纳米片的成核和生长。随着吸附的进行,部分电荷得到中和(图S1)。扫描电子显微镜(SEM)显示,经过7天孵育后获得的CuxS@SRB-1呈现出准连续的结构。

结论

总之,本研究报道了一种基于CuxS@SRB活生物纳米杂交体的超灵敏电化学传感器,用于选择性检测辅酶F420,这是一种作为产甲烷古菌特异性生物标志物的独特氧化还原辅因子。通过利用天然电活性的SRB作为可再生的硫源和生物模板,CuS/Cu2S异质纳米颗粒通过静电自组装原位锚定在细菌包膜上,形成了均匀的结构。

CRediT作者贡献声明

Xiaoling Liu:数据可视化、验证、数据管理。Mengna Dong:数据可视化、验证、数据管理。Xueqi Hu:初稿撰写、研究、数据管理。Davide Raffaele Ceratti:方法论设计、撰写及审稿编辑。You Xu:撰写及审稿编辑。Guangfang Li:撰写及审稿编辑、数据可视化、项目管理、资金争取。Zhuo Huang:撰写及审稿编辑、数据可视化、项目管理、资金争取。Hongfang Liu:

未引用的参考文献

Greening等人,2016年。

利益冲突声明

作者声明他们没有已知的可能会影响本文研究的财务利益或个人关系。

数据可用性

数据可应要求提供。

利益冲突声明

作者声明他们没有已知的可能会影响本文研究的财务利益或个人关系。

致谢

本工作得到了国家关键研发计划(2022YFE0117000)的支持。作者感谢所有为这项工作提供资助的机构。

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