生育三烯酚作为ICAM-1、VCAM-1和E-选择素的多靶点抑制剂:通过AutoDock和GNINA对接方法结合分子动力学模拟进行比较

时间:2026年5月29日
来源:Computational Biology and Chemistry

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哈齐拉·瓦蒂卡·阿卜达(Hazirah Watikah Abdah)、西蒂·阿兹玛·朱索(Siti Azma Jusoh)、努尔·赛菲卡·法尔哈娜·祖尔卡尼恩(Nur Syafiqah Farhanah Dzulkharnien)、努鲁尔·伊扎蒂·哈纳菲(Noorul Izzat

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哈齐拉·瓦蒂卡·阿卜达(Hazirah Watikah Abdah)、西蒂·阿兹玛·朱索(Siti Azma Jusoh)、努尔·赛菲卡·法尔哈娜·祖尔卡尼恩(Nur Syafiqah Farhanah Dzulkharnien)、努鲁尔·伊扎蒂·哈纳菲(Noorul Izzati Hanafi)、艾哈迈德·梅尔扎·穆罕默德·纳西尔(Ahmad Merza Mohd Nasir)、苏海拉·阿卜德·穆伊德(Suhaila Abd Muid)、努尔·爱丽泽扎·穆罕默德·卡西姆(Noor Alicezah Mohd Kasim)
  • β-生育三烯酚异构体在AutoDock Vina模型中表现出最强的结合亲和力,针对VCAM-1蛋白。
  • α-生育三烯酚在AutoDock Vina模型中对E-选择素(E-selectin)和ICAM-1蛋白的结合亲和力最高。
  • GNINA模型显示,β-生育三烯酚异构体对ICAM-1蛋白的结合亲和力最强。
  • 研究发现VCAM-1蛋白存在结构上的局限性,这些局限性影响了人工智能辅助的评分结果,为未来的柔性对接研究提供了参考依据。
  • 分子动力学模拟表明,GLU87和ASP178残基通过形成氢键在β-生育三烯酚与VCAM-1的相互作用中起着关键作用。

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