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从病毒载量和每日接触率数据中解析SARS-CoV-2传播异质性的驱动因素
SARS-CoV-2的传播具有高度过度离散性(overdispersion),少数个体导致了大多数传播,尽管这种异质性的驱动因素尚不清楚。本文中,研究人员通过将已发表的病毒载量(viral load)估计和接触调查数据整合到一个数学模型中来估计继发感染分布(s
来源:PLOS Computational Biology
时间:2026-09-02
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ASPIRE:基于有限RNA测序数据与最小基因集的精确可变剪接预测
可变剪接(alternative splicing,AS)是真核生物中增加蛋白质多样性并调控关键细胞过程的基本生物学机制。剪接失调与包括癌症、神经系统疾病和自身免疫病在内的多种疾病相关。因此,准确预测诸如百分比剪接入(percent spliced in,PS
来源:PLOS Computational Biology
时间:2026-09-02
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病毒进化背景下促进疫苗民族主义的经济因素
摘要:现代世界日益增强的相互联系要求采取全球公平的解决方案来应对大流行挑战。然而,近几十年来出现了一种趋势,即高收入国家诉诸“疫苗民族主义”,囤积疫苗生产,损害低收入国家的利益。此外,从长远来看,疫苗民族主义可能对囤积国自身不利,因为COVID-19期间不公平
来源:PLOS Computational Biology
时间:2026-09-02
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GPCR-GO:关系感知图学习用于预测G蛋白偶联受体的基因本体论术语
G蛋白偶联受体(G protein-coupled receptors, GPCRs)是核心膜受体和主要治疗靶点。然而,预测GPCR功能仍然困难,因为实验注释的受体稀少、功能标签呈长尾分布,且结构信息未被充分利用。在此,研究人员提出了GPCR-GO,一种关系感
来源:PLOS Computational Biology
时间:2026-09-02
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男男性行为者中HIV消除前景:一项关于建模研究的系统综述
男男性行为者(MSM)在全球范围内仍不成比例地受到HIV影响。本研究系统综述了评估MSM中HIV消除前景的数学建模研究,按地理设置、干预类型、消除定义及模型特征进行归纳。研究人员检索了Embase与PubMed中2016年7月1日至2025年9月1日发表的使用
来源:PLOS Computational Biology
时间:2026-09-02
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模型上下文协议:生物信息学互操作性革命的非预期催化剂
从早期仅含数十条蛋白质序列的首个蛋白质数据库起步,生物信息学随测序技术进步而爆发式增长,但快速发展带来关键挑战:各研究组从零发明自有数据库、术语与格式,形成碎片化生态并引发棘手集成难题。典型者如缺乏形式化规范的FASTQ格式存在多种不兼容质量评分编码变体,通用
来源:PLOS Computational Biology
时间:2026-09-02
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维护工作在前:纤维素连接细胞壁构建与蔗糖转运
植物固定碳并将其转化为糖类。这些糖类需要从源组织(主要是叶片)运输到库组织(如茎、根、种子和生殖器官)。韧皮部(phloem)作为专门的维管组织,负责糖类的长距离运输。维持韧皮部流是碳水化合物分配(carbohydrate partitioning)的关键:如
来源:Journal of Experimental Botany
时间:2026-09-02
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从个体层面登记数据映射空间同事连接模式以指导区域性流行病干预措施
摘要翻译:
传染病建模中一个关注点是如何准确地纳入人群混合模式,因为该模式决定了感染通过何种类型和频率的接触传播,进而影响干预措施有效性的估计。尽管基于日记调查的综合混合模式合成已是一种成熟框架,但其对地理信息的捕捉仍不充分或稀疏。本文提出了一种可推广的工
来源:PLOS Computational Biology
时间:2026-09-02
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malariasimple:用于疟疾传播快速模拟的R软件包
基于过程的疟疾传播模型是评估干预策略、量化不确定性以及为疟疾控制政策提供信息的重要工具。以malariasimulation为代表的基于个体模型(individual-based model, IBM)计算需求高,这限制了其在大规模模拟运行应用中的实用性。本文
来源:PLOS Computational Biology
时间:2026-09-02
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交叉桥模型预测运动中肌肉短程刚度
肌肉骨骼模拟可深入揭示肌肉骨骼系统特性如何影响日常运动的生物力学。其中一项特性是肌肉对拉伸的初始抵抗,即短程刚度(short-range stiffness, SRS),它是响应外部扰动稳定运动的关键。现有肌肉骨骼模拟采用缺乏激活依赖刚度特性的现象学Hill型
来源:PLOS Computational Biology
时间:2026-09-02