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多组学整合解析结直肠癌术前血清CEA状态相关的瘤内微生物-免疫-代谢协变网络及候选机制轴
摘要背景与目的癌胚抗原(CEA)是结直肠癌(CRC)临床管理中使用最广泛的血清标志物之一,但患者之间CEA状态差异的瘤内生态学基础仍不清楚。本研究旨在整合瘤内微生物组、转录组和代谢组数据,以解析与术前血清CEA状态相关的多组学特征。方法本研究纳入63例未经术前抗肿瘤治疗并接受根治
来源:BMC Microbiology
时间:2026-10-28
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新型国产血清学试剂盒检测幽门螺杆菌感染的诊断性能评估:与三种商业ELISA试剂盒的比较
摘要背景幽门螺杆菌(H. pylori)感染是全球最常见的慢性传染病之一。准确诊断仍是一项挑战,因为现有方法各有利弊。本研究评估了一种新型国产血清学试剂盒(Sina Biotech)检测抗幽门螺杆菌IgG抗体的诊断性能,并与三种商业ELISA试剂盒及两种金标准方法(快速尿素酶试验
来源:BMC Microbiology
时间:2026-10-28
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中国东部地区2型糖尿病患者人芽囊原虫定植的流行病学及亚型特征分析
摘要
背景
人芽囊原虫是一种普遍存在的肠道原生生物,其临床相关性尚存争议。中国东部地区关于2型糖尿病(T2DM)患者中人芽囊原虫定植的流行病学数据仍然缺乏。本研究旨在调查中国浙江省T2DM患者和非糖尿病对照组中人芽囊原虫定植的流行率、亚型分布、遗传特征及相关因素。
方法
在这
来源:BMC Microbiology
时间:2026-10-28
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虹鳟鱼骨骼肌出生后生长的单细胞转录组图谱揭示了两种与增生和肥大相关的肌肉干细胞命运
摘要背景在脊椎动物中,骨骼肌在出生后通过不同的策略生长。虽然哺乳动物主要依靠出生后的肌纤维肥大,但许多硬骨鱼在幼年期仍保留通过增生产生新肌纤维的独特能力。与鱼类从增生-肥大到肥大肌肉生长模式的转换相关的分子机制仍知之甚少。结果我们构建了来自幼年虹鳟鱼(Oncorhynchus m
来源:BMC Genomics
时间:2026-10-28
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水稻种子萌发过程中碳代谢动态演替的整合多组学分析
摘要种子萌发标志着植物生命周期中从休眠储备到活跃生长的转变。碳(C)代谢的高效动员和转化直接决定了萌发效率、幼苗建植活力以及后续作物生产力。本研究以沪旱香软61(HHXR61)种子为材料,采用靶向代谢组学、转录组学和酶活性测定等整合多组学技术,系统研究了水稻种子吸胀萌发过程中0小
来源:BMC Genomics
时间:2026-10-28
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猪卵巢发情前期向发情期转变的单核RNA测序分析揭示ERBB4、SLC1A5及TGF-β信号通路作为候选分子特征
摘要
背景
在猪卵巢从发情前期向发情期转变的过程中,卵巢经历快速的多种细胞重塑,但与这一过程相关的细胞类型特异性转录程序尚未完全明确。在此,我们旨在单细胞水平上解析猪卵巢在发情前期和发情期阶段依赖的细胞状态及细胞间信号传导事件。
结果
我们构建了覆盖发情前期和发情期的猪卵巢单
来源:BMC Genomics
时间:2026-10-28
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基于全基因组重测序的大足黑山羊遗传结构解析与SNP指纹图谱构建
摘要背景大足黑山羊(DZ)是中国西南地区的本土品种,以其高繁殖力和卓越的环境适应性而闻名。然而,其特定的遗传结构及其独特性状的基因组基础在很大程度上仍未被探索。本研究旨在表征DZ的遗传多样性和种群结构,并开发一套基于单核苷酸多态性(SNP)的稳健指纹图谱系统,以支持对这一宝贵遗传
来源:BMC Genomics
时间:2026-10-28
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基于严格无泄漏协议下TabNet与经典模型在miRNA疾病分类中的性能与可解释性对比研究
摘要背景与目标RNA测序(RNA-seq)数据的分类是计算生物医学领域的一个基本挑战:原始读数计数具有高维、过度离散和异方差性,在应用机器学习模型之前需要进行仔细的预处理。现有的RNA-seq分类深度学习方法在很大程度上忽视了基因组表达数据的表格性质,并且提供的嵌入可解释性有限。
来源:BMC Bioinformatics
时间:2026-10-28
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桃转录因子PpMYB10.1单倍型变异与等位基因特异表达影响核周果肉花色苷积累差异
桃转录因子(transcription factor, TF)PpMYB10.1的单倍型(haplotype)变异导致核周果肉颜色差异。桃品种间核周花色苷(anthocyanin)积累差异显著。PpMYB10.1是核周果肉着色的关键调控因子。不同的PpMYB1
来源:Scientia Horticulturae
时间:2026-10-28
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羟基化单萜类中α-松油醇激活番茄细菌防御并驱动茉莉酸依赖的自我放大免疫及田间病害保护
羟基化单萜类(hydroxylated monoterpenes, HMTPs)在抗性番茄与Pseudomonas syringae互作期间释放,并赋予抗菌抗性,但其整合入免疫信号的过程仍知之甚少。研究人员在此显示,HMTPs作为内源信号参与番茄经典防御通路,
来源:Plant Stress
时间:2026-10-28