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基于全基因组重测序的大足黑山羊遗传结构解析与SNP指纹图谱构建
摘要背景大足黑山羊(DZ)是中国西南地区的本土品种,以其高繁殖力和卓越的环境适应性而闻名。然而,其特定的遗传结构及其独特性状的基因组基础在很大程度上仍未被探索。本研究旨在表征DZ的遗传多样性和种群结构,并开发一套基于单核苷酸多态性(SNP)的稳健指纹图谱系统,以支持对这一宝贵遗传
来源:BMC Genomics
时间:2026-10-28
基于严格无泄漏协议下TabNet与经典模型在miRNA疾病分类中的性能与可解释性对比研究
摘要背景与目标RNA测序(RNA-seq)数据的分类是计算生物医学领域的一个基本挑战:原始读数计数具有高维、过度离散和异方差性,在应用机器学习模型之前需要进行仔细的预处理。现有的RNA-seq分类深度学习方法在很大程度上忽视了基因组表达数据的表格性质,并且提供的嵌入可解释性有限。
来源:BMC Bioinformatics
桃转录因子PpMYB10.1单倍型变异与等位基因特异表达影响核周果肉花色苷积累差异
桃转录因子(transcription factor, TF)PpMYB10.1的单倍型(haplotype)变异导致核周果肉颜色差异。桃品种间核周花色苷(anthocyanin)积累差异显著。PpMYB10.1是核周果肉着色的关键调控因子。不同的PpMYB1
来源:Scientia Horticulturae
羟基化单萜类中α-松油醇激活番茄细菌防御并驱动茉莉酸依赖的自我放大免疫及田间病害保护
羟基化单萜类(hydroxylated monoterpenes, HMTPs)在抗性番茄与Pseudomonas syringae互作期间释放,并赋予抗菌抗性,但其整合入免疫信号的过程仍知之甚少。研究人员在此显示,HMTPs作为内源信号参与番茄经典防御通路,
来源:Plant Stress
小麦SR蛋白家族全基因组鉴定及TaSR30/TaSR45在热胁迫耐受中的功能解析
全基因组调查(genome-wide survey)鉴定出60个TaSR基因和七个亚家族。TaSRs表现出保守的结构/基序(motifs),且许多TaSRs与TaU1-70K(U1小核核糖核蛋白,U1 snRNP)发生相互作用。热胁迫(heat stress)
来源:Plant Physiology and Biochemistry
二甲双胍通过靶向GPD2介导的代谢可塑性抑制葡萄糖驱动的肝细胞癌进展
葡萄糖代谢对癌细胞的存活与增殖至关重要。肝细胞癌(HCC)细胞展现出独特的代谢适应性,使其能够在营养受限的条件下支持肿瘤进展。本研究探讨了葡萄糖可用性及GPD2介导的代谢适应对HCC进展的影响,以及葡萄糖转运抑制剂和二甲双胍如何调控这些过程。研究人员采用MTT
来源:Scientifica
美国国家代表性人群中仅基于24小时膳食回顾的素食状态评定与自我认同之间存在显著不一致:基于NHANES 2007—2010的流行病学分析
目的:定义和概念越灵活,研究结果越不可能是真实的。流行病学研究中的素食状态评估是持续存在争议的问题,报告的素食患病率因所采用评估方法而高度可变。目前尚无对这些潜在素食状态评估方法的系统比较。方法:研究人员使用美国国家健康与营养检查调查(National Hea
基于非对称流场流分离(AF4)的纳米沉淀组成异质性解析:脂质组成与表面活性剂分配对颗粒形成的影响
脂质纳米颗粒(lipid nanoparticles, LNPs)是有吸引力的药物递送平台,但传统批式表征的一个根本局限在于其无法解析纳米沉淀过程中多分散粒径分布下的组成异质性。在此,研究人员系统考察了两个关键处方参数——表面活性剂分配(surfactant
来源:Nano Today
轮状病毒剂量-反应评估的更新:纳入宿主免疫力的单次击中模型再分析
摘要专业翻译 轮状病毒(Rotavirus, RV)喂养试验数据提示试验受试者中存在部分免疫个体。本研究通过引入正式的免疫力参数更新了轮状病毒的剂量-反应(dose-response)模型。分析结果表明,先前报道的轮状病毒单次击中概率(single-hit p
来源:Microbial Risk Analysis
Rieske二加氧酶(ROs)的理性工程改造:基于结构解析拓展毒性芳香族化合物生物降解的底物谱与催化效率
毒性芳香族化合物日益加剧的污染、持久性与难降解性,亟需能够优于天然微生物代谢的高效生物催化解决方案。Rieske(2Fe-2S)型二加氧酶(Rieske (2Fe-2S)-type dioxygenases, ROs)是一类有前景的酶,已知可通过羟化芳香环降解
来源:FEBS Letters
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