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  • 面向生物系统的多实验方程学习:提升代理模型在参数空间中的泛化能力与可解释性

    为解决代理基模型(ABM)计算量大、难以分析,且传统方程学习(EQL)方法泛化性差的问题,研究人员开展了多实验方程学习(ME-EQL)主题的研究。他们提出了两种新方法:逐个多实验方程学习(OAT ME-EQL)和嵌入结构多实验方程学习(ES ME-EQL),并利用包含空间结构的生-死-迁移ABM进行验证。结果表明,两种方法均能显著降低从ABM数据中恢复参数的相对误差,其中OAT ME-EQL在参数空间上展现出更好的泛化性。这项研究增强了从复杂生物系统数据中学习得到的模型的泛化能力和可解释性。

    来源:PLOS Computational Biology

    时间:2026-04-23

  • 跨物种聚光灯:揭示注意力的共同动态本质

    本研究为克服传统持续性注意力任务(CPT)在跨物种比较中的局限性,开发了一种自然化的虚拟现实(VR)感知决策任务,让小鼠、猴子和人类在相同环境下完成。研究人员通过分析行为轨迹提取速度与准确性参数,利用隐马尔可夫模型(HMM)推断出四种注意力状态,发现三者的注意力动态(状态持续时间与转换)具有惊人的相似性,且波动主要由内部生成。这项工作为在自然行为中量化持续性注意力提供了可跨物种推广的新方法,有助于理解注意相关疾病(如ADHD)的机制。

    来源:PLOS Computational Biology

    时间:2026-04-23

  • 流感病毒缺陷干扰颗粒与I型干扰素应答的时空动力学建模:揭示空间结构环境下的免疫逃逸机制

    为解决缺陷干扰颗粒(DIPs)在空间结构环境中如何与I型干扰素(IFN)互作以调控病毒感染这一难题,研究人员开展了流感A病毒体外感染的空间显式随机建模研究。结果表明,即使存在长程IFN扩散,少量病毒/DIPs的长程扩散即可逃逸免疫 containment,且IFN产生在中等DIP比例时达峰。该模型为理解病毒感染异质性与免疫应答提供了新视角。

    来源:PLOS Computational Biology

    时间:2026-04-23

  • 澳大利亚COVID-19疫情响应的集成预测:2020–2022年回顾性评估与公共卫生决策支持

    为支持澳大利亚COVID-19大流行响应,研究团队开展了为期两年半的集成预测(Ensemble forecasts)研究。该研究通过整合多个模型对8个州及领地的日新增病例进行预测,发现集成预测性能优于任何单一模型,为公共卫生决策提供了关键数据支持。

    来源:PLOS Computational Biology

    时间:2026-04-23

  • 利用蛋白质设计实验结果指导生物分子能量函数开发:基于Rosetta的“设计-失败-重训”范式

    本研究针对Rosetta等经典力场能量函数在蛋白质设计(尤其是疏水核心堆积)中存在“空间位阻冲突(steric clashing)”低估的物理缺陷,创新性地利用深度突变扫描(DMS)实验数据识别设计失败模式,并据此重训能量函数参数,显著提升了模型对天然构象的还原能力,为生物大分子力场开发提供了“从设计失败中学习”的新范式。

    来源:PLOS Computational Biology

    时间:2026-04-23

  • 靶向碳封存的巴氏芽孢八叠球菌诱导微生物碳酸盐沉淀(MICP)评估:基于响应面法的工艺优化与机制解析

    本文报道了加拿大康考迪亚大学研究团队的一项创新性研究。为应对气候变化及二氧化碳(CO2)排放问题,该团队利用巴氏芽孢八叠球菌(Sporosarcina pasteurii)介导的微生物诱导碳酸盐沉淀(MICP)技术,针对碳捕获与封存(CCS)开展了系统优化。研究采用响应面法(RSM),明确了CO2、尿素和钙浓度对CO2封存效率与碳酸钙(CaCO3)沉淀的影响,并探究了镍(Ni)、锌(Zn)金属辅因子的作用。结果表明,在优化条件下(20% v/v CO2、50 g/L尿素、13 g/L CaCl2·2H2O),CO2封存率高达94.3%,钙沉淀率达82.3%。此研究为开发高效的MICP生物反应器用于碳封存与矿物碳酸化提供了关键工艺参数和理论依据,前景广阔。

    来源:Bioresource Technology Reports

    时间:2026-04-23

  • 亚得里亚海海洋螨类DNA条形码研究揭示庞塔拉赫螨科(Pontarachnidae)隐存多样性并描述斯洛文尼亚新物种

    本研究针对地中海海域庞塔拉赫螨科(Pontarachnidae)海洋螨类分类不清、DNA条形码数据匮乏的问题,通过采集亚得里亚海与第勒尼安海标本,利用线粒体COI基因进行分子鉴定。研究新增81条DNA条形码,发现斯洛文尼亚海岸存在6个MOTUs(含1新种Litarachna cursusmaritima sp. nov.),揭示了L. communis与P. punctulum存在隐存谱系,为海洋 meiofauna 多样性评估提供了关键分子基础。

    来源:The European Zoological Journal

    时间:2026-04-23

  • 泰国湾海域褐条石鲈(Lutjanus vitta)的遗传多样性、种群结构与历史扩张:基于线粒体控制区的分析

    本研究旨在阐明泰国湾内近海石油平台与近岸海域褐条石鲈(Lutjanus vitta)之间的遗传连通性,以评估平台在渔业资源管理与保护中的潜在生态作用。研究人员对来自北部、中部、南部多个石油平台及两个近岸地点(Samaesarn与Songkhla)的褐条石鲈样本进行了线粒体控制区(Control Region, CR)测序与遗传学分析。研究结果显示,各地理种群间存在高单倍型多样性但无显著的种群遗传结构,表明泰国湾内的褐条石鲈是一个单一的泛化种群,并存在历史扩张迹象。该研究为理解高流动性鱼类在人工结构物与自然栖息地间的基因流动提供了重要证据,并为未来石油平台退役决策与区域海洋保护区的设立提供了科学依据。

    来源:Diversity

    时间:2026-04-23

  • 综述:天然含硫化合物抗糖尿病活性的QSAR研究

    这篇综述(Review)系统总结了天然含硫化合物(尤其来自Salacia属植物和Allium属蔬菜)的结构多样性及其在抗糖尿病、调血脂、抗氧化和心血管保护等方面的药理活性。通过整合传统药用知识、现代药理实验及计算化学(如QSAR/PASS)预测,文章揭示了硫糖(thiosugars)、硫磺盐(sulfonium salts)及有机多硫化合物(polysulfides)等可通过多靶点(multi-target)机制,特别是抑制α-葡萄糖苷酶(α-glucosidase)、调节氧化应激(oxidative stress)和炎症通路,来改善糖脂代谢紊乱,为开发针对2型糖尿病(T2D)等代谢综合征的功能食品和新型疗法提供了有前景的化学骨架。

    来源:Diabetology

    时间:2026-04-23

  • 基于主成分分析的哥伦比亚U-13、U-15、U-17年龄段女子足球运动员身体素质和身体成分模式研究

    为解决青少年女子足球运动员身体发育与运动表现关系不清、缺乏多变量综合分析的问题,研究人员采用主成分分析(PCA),对哥伦比亚U-13、U-15、U-17三个年龄组的68名运动员进行了身体成分与身体素质测试。研究发现,年龄是影响变向能力、速度及特定身体成分指标的关键因素,主成分1和2可显著区分不同年龄组的运动表现模式。该研究为针对不同年龄段青少年女足运动员制定个性化的训练方案和选材策略提供了数据支持。

    来源:Physiologia

    时间:2026-04-23


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