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通过转录组推断翻译效率可优化非典型新抗原的优先级排序及癌症患者的分类
摘要准确评估蛋白质翻译对于理解疾病变异的功能至关重要,但mRNA与蛋白质之间的差异限制了基于转录组学的临床肿瘤学应用。虽然核糖体分析可以直接测量翻译情况,但其临床应用却受到成本和复杂性的制约。像Translatomer这样的深度学习模型能够从RNA-seq数据中推断翻译效率,但这
来源:npj Precision Oncology
时间:2026-06-19
一个基于网络的半监督深度学习平台,用于自动评估和监测感染性角膜炎
摘要感染性角膜炎是全球导致角膜失明的主要病因之一。准确的严重程度评估至关重要,但目前仍受限于裂隙灯检查及眼前段光学相干断层扫描检测的主观性和局限性。本研究提出了“智能定量角膜炎图像分析平台”,这是一种基于网络的深度学习系统,可通过对AS-OCT数据中的病灶进行分割、参数化处理、分
来源:npj Digital Medicine
利用PEAL这一无损的一次性联邦学习方案,解锁多机构在疾病进展研究方面的深度见解
摘要对电子健康记录数据进行的多站点分析为研究现实环境中的疾病进展提供了独特的机会。然而,隐私问题、通信成本以及各站点间的差异性给纵向数据分析带来了巨大挑战。我们提出了PEAL算法(一种用于纵向数据的隐私保护型高效聚合算法),它是一种新的联邦学习算法,可用于构建包含样条基项的非线性
综述:肺腺癌演变的多组学图景:解析由代谢重编程驱动的免疫逃逸及其在联合治疗中的意义
摘要肺腺癌从侵袭前病变(非典型腺瘤性增生/原位腺癌)发展为侵袭性腺癌的过程是一个复杂、多维度且动态变化的过程。虽然这一转变背后的基因组驱动因素已被广泛研究,但代谢重编程如何重塑肿瘤免疫微环境以实现免疫逃逸的机制仍是一个重要的知识空白。本文结合基因组学、代谢组学、单细胞RNA测序以
来源:Cell Death Discovery
综述:前列腺癌的糖生物学研究进展:最新综述
前列腺癌是男性常见恶性肿瘤,目前临床亟需改善早期诊断和开发针对晚期疾病的新疗法。尽管对前列腺癌基因组和蛋白质组的认知已取得巨大进展,但对其完整糖组(glycome)和糖蛋白质组(glycoproteome)特征的解析仍相对滞后。糖生物学近期在医学领域尤其是转化
来源:Oncogene
LCAL4-FUS协同作用激活MMP13并驱动乳腺癌溶骨性骨转移
晚期乳腺癌(BC)患者常发生骨转移,导致严重骨骼并发症及预后显著下降,但乳腺癌骨转移的分子机制尚未得到充分阐明。本研究发现长链非编码RNA LCAL4在骨转移性乳腺癌中特异性上调,并可作为不良生存的独立预测因子。在体内心脏注射和胫骨注射小鼠模型中的功能获得和功
发育过程中动态变化且不发生趋同的精神分裂症风险CNV模型转录组特征
精神分裂症是一种复杂的精神障碍,具有显著的遗传异质性和临床异质性。尽管已经鉴定出许多与精神分裂症高风险相关的罕见拷贝数变异(copy number variations,CNVs),但这些变异在基因内容或功能上并无明显重叠。研究人员提出假设:精神分裂症相关CN
来源:Molecular Psychiatry
综述:靶向糖酵解可塑性克服癌症干细胞治疗抵抗:机制与临床展望
癌症干细胞(CSCs)是肿瘤中具有高度耐受性的亚群,介导多药耐药、转移及临床复发。其核心特征之一是显著的代谢可塑性,这种动态防御机制促进细胞在糖酵解、氧化磷酸化(OXPHOS)及替代营养分解代谢之间快速切换,使CSCs能够突破微环境限制。本综述系统阐释糖酵解适
来源:Cells
巨噬细胞微环境(Macrophage Niche)的重建揭示肾脏驻留巨噬细胞(Renal-resident Macrophage, RM)与肾小管上皮细胞的动态转录及细胞间通讯网络
肾驻留巨噬细胞(Renal-resident macrophage, RM)是维持肾脏稳态与修复的关键调节因子,然而RM微环境(niche)在急性耗竭后再生的分子机制尚不清楚。研究人员建立了可诱导的人CD59-中间溶血素(human CD59-intermed
综述:超越硫化氢与半胱氨酸代谢:重构胱硫醚γ裂解酶作为透明细胞卵巢癌中缺氧诱导因子-1α潜在翻译调节因子的角色
传统上,转硫化(TSS)途径的关键酶胱硫醚β合成酶(CBS)与胱硫醚γ裂解酶(CTH,亦称CSE或CGL)因参与同型半胱氨酸向半胱氨酸的连续转化及内源性硫化氢(H2S)的生成而被广泛认知。然而,越来越多的证据表明,这些酶可能具备超越代谢调控的非经典(“兼职”)
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