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基于机器学习的精神分裂症转录组生物标志物识别与诊断模型构建及验证
摘要背景精神分裂症(SCZ)是一种严重的神经发育性精神疾病,其特征是临床异质性显著,这使得客观诊断变得具有挑战性。本研究旨在利用机器学习方法识别与SCZ相关的特征基因,并评估这些基因的诊断潜力,同时评估模型的稳健性和跨数据集的通用性。方法从Gene Expression Omni
来源:Hereditas
时间:2026-11-04
整合序列-结构-功能预测流程解析尿路致病性大肠杆菌UTI89全蛋白组并揭示宿主-微生物及微生物-噬菌体互作通路
高通量测序技术的快速发展大幅增加了已知蛋白质序列的数量,但其结构与功能的实验表征仍相对滞后。该知识缺口阻碍了对这些蛋白质生物学机制的理解,限制了高通量实验的解读,并凸显现代生物学中的一项重大挑战:根据蛋白质序列推断其结构与功能信息。多数计算方法依赖与注释良好蛋
来源:PLOS Genetics
幼婴存在与母婴行为冲突预测野生山魈(Mandrillus sphinx)胎仔丢失:繁殖节奏的适应性生理约束
雌性适合度(female fitness)取决于繁殖节奏(reproductive pace)与后代存活(offspring survival),二者均由在当前繁殖与未来繁殖之间平衡资源分配(resource allocation)的能力决定。研究人员利用来自
来源:PLOS Biology
人海马体支持听觉编码与多感觉整合的长轴分工与半球侧化
海马体接收来自多个感觉系统的汇聚输入,然而在人类中其研究几乎仅局限于视觉模态。研究人员考察了海马体如何参与视觉之外模态的感觉加工,以及如何将这些模态与视觉信息进行多感觉整合。被试反复观看短时长自然电影片段,每段以四种格式呈现:仅听觉、仅视觉、一致的视听组合,以
基于2243个基因座系统发育基因组学框架揭示双星藻纲(Zygnematophyceae)深部遗传结构及其陆生植物近缘藻类的古老辐射
解析陆生植物(embryophytes)与藻类最后共同祖先的性质,有助于追溯植物登陆所伴随的适应性变化。为此,最接近陆生植物的链型藻类(streptophyte algae)近缘类群携带关键信息。尽管其简单体型最初令人意外,但所有主要系统发育基因组学(phyl
面向多样陆地脊椎动物的开源自由活动眼动系统揭示蜥蜴状态依赖性视觉获取机制
: 眼跳(saccade)等注视转移行为是视觉探索与加工的基础,然而实证认知长期受限于少数模式物种,制约了对跨动物类群视觉获取普遍规律的理解。研究人员提出一种通用、低成本、开源的框架,用于小型自由活动动物的眼动测量。该系统依托摄影测量(photogrammet
铜绿假单胞菌短尾噬菌体A1002成熟颗粒的冷冻电镜结构揭示分裂式喷嘴与双蛋白链状纤维的独特尾部架构
噬菌体疗法在对抗耐药细菌方面具有独特优势。然而,针对铜绿假单胞菌(P. aeruginosa)——全球七大病原体之一——的噬菌体高分辨率结构研究,尤其短尾噬菌体(podophage),仍严重受限,直接阻碍基于结构的新型抗菌药物开发。本研究利用冷冻电镜(cryo
ARTC5介导的PON2 R101 ADP-核糖基化与Furin切割偶联调控其酶活性、细胞迁移及铜绿假单胞菌感染
氧化应激(oxidative stress)在慢性伤口愈合和细菌感染中发挥关键作用。人对氧磷酶2(PON2;paraoxonase 2)通过水解群体感应分子N-(3-oxo)-dodecanoyl-homoserine lactone并限制氧化损伤参与宿主防御
来源:International Journal of Biological Macromolecules
宿主遗传-瘤胃微生物组-代谢组互作调控荷斯坦公牛精液品质的多组学解析
精液品质是奶牛繁殖性能的关键决定因素,然而其微生物、代谢与遗传基础仍不清楚。研究人员整合了55头按精液品质记录划分为相对高质(RSQH)与相对低质(RSQL)组的荷斯坦公牛的瘤胃微生物组、代谢组与全基因组变异数据,以探究与繁殖力相关的宿主-微生物组-代谢组互作
来源:mSystems
深海化能自养遗传潜力超越硝化微生物:东北太平洋DIC固定途径与MAGs代谢多样性
摘要:微生物化能自养具有维持深海生态系统、促进全球碳封存并改善当前不平衡海洋碳收支的潜力。然而,对其机制的认识仍在逐步深入,尤其是对硝化作用以外生物的认识。在此,研究人员对来自东北太平洋的28个宏基因组开展基于基因和基因组解析的联合分析,以研究海洋化能自养菌的
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