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面向植物病毒序列—宿主—表型—靶点—抗病毒证据整合与AI辅助优先排序的关联数据库
研究植物病毒依赖于分类学、核酸序列、宿主与病害记录、分子靶点及抗病毒实验等证据,但这些数据分散于独立资源中,难以进行集成检索与比较。PlantVirDisConDB(植物病毒病害关联数据库)可免登录公开访问,并通过人工校对的植物病毒记录将上述数据关联。截至20
来源:Nucleic Acids Research
时间:2026-11-03
线性RNA病毒基因组中自切割核酶(self-cleaving ribozymes)的保守分布及其对翻译起始(translation initiation)的功能性招募
小型自切割核酶(small self-cleaving ribozymes)是发现于类病毒因子(viroid-like agents)中的催化性RNA,这些复制性环状RNA(circRNAs)被认为是前biotic RNA世界的遗迹。然而在过去十年中,小型核酶
多组学图谱mV2G:面向组织特异性变异到基因优先排序的统一框架
多组学变异到基因(Variant-to-Gene,V2G)图谱mV2G是一个综合性质的知识图谱,其通过整合多样的功能基因组学证据,对组织特异性的V2G关联进行优先排序。尽管全基因组关联研究(Genome-Wide Association Studies,GWA
tModBase v2.0:面向tRNA化学修饰的扩展型数据库与检索增强生成驱动的智能助理tModBot
转运RNA(tRNA)的化学修饰对tRNA稳定性、密码子解码、翻译保真度以及tRNA来源小RNA(tsRNA)生物发生具有关键作用。此类修饰的改变与应激反应、生理调控及人类疾病相关,因此需要将修饰信息同实验证据与生物学背景进行系统整合。研究人员此前建立tMod
TCR基序图谱:识别病毒、癌症和自身免疫表位的TCR特异性数据库
T细胞识别由T细胞受体(T细胞受体,TCR)与表位之间的结合所引发。许多机器学习方法已被提出用于模拟TCR–表位识别特异性,但其中大多数作为黑箱运作。为使TCR–表位识别特异性可视化,研究人员开发了TCR基序图谱(TCR Motif Atlas,https:/
THEOBROMA:整合113万个天然产物的开放聚合数据库——逐化合物许可审计、三层分类与立体化学感知去重
天然产物仍是药物发现中药理活性化合物最丰富的来源之一。现有的开放聚合器(open aggregator)在数据库粒度(database granularity)上归属许可,这一选择带来的后果已随领域扩张而日益显现:2024年9月Natural Products
从内质网与线粒体到线粒体相关膜(MAMs):心血管疾病中铁死亡的整合调控与治疗靶点
铁是细胞氧化还原稳态的中心调节因子,支持关键生理过程。鉴于其关键生物学重要性,铁稳态在全身和细胞水平均受到严格调控。铁死亡(ferroptosis)是一种代谢调控的、铁依赖性的细胞死亡形式,其特征是铁催化氧化还原反应驱动的磷脂氢过氧化物(PL-OOH)积累,最
来源:Redox Report
全球公共奶酪微生物组标准化再分析揭示广泛细菌类群与地理群落结构
奶酪微生物组(cheese microbiome)因公共测序数据集(public sequencing datasets)高度碎片化且方法学异质性而难以实现全球比较。本研究中,研究人员从233个BioProjects中系统整理了14,203条测序记录,并保留来
来源:International Journal of Molecular Sciences
植物G-四链体基序的位置与链特异性关联不同功能特征的比较基因组学分析
摘要:假定的G-四链体序列(putative G-quadruplex sequences, PQS)已在个别植物物种中被发现与转录调控相关联,但目前仍缺乏跨植物界的系统性比较视角。本研究分析了跨越超过12亿年进化分歧的70种植物物种(从藻类到被子植物)中转录
硒代L-甲硫氨酸联合阿昔替尼与帕博利珠单抗在初治转移性透明细胞肾细胞癌中的TGF-β1抑制、细胞因子调控及临床疗效研究
摘要专业翻译 转移性透明细胞肾细胞癌(metastatic clear cell renal cell carcinoma, ccRCC)在很大程度上仍无法治愈,帕博利珠单抗联合阿昔替尼的疗效可能受到缺氧相关信号、免疫抑制性细胞因子以及涉及TGF-β1/HIF
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