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稀疏通量向量的动态平衡用于高效模拟培养动态和代谢网络简化
•提出了一种新的公式化方法,使用大通量模型来模拟培养动态。•动态通量向量平衡(Dynamic Flux Vector Balancing, DFVB)采用稀疏基阵进行通量平衡的重新表述。•DFVB大大减少了模拟时间,并能够实现有意义的网络简化。•细胞培养模型可以更稳健地进行校准,
来源:Computational Biology and Chemistry
时间:2026-11-03
识别并验证与结核病离子稳态相关的诊断基因特征,以及对SLC24A2的探索性分析
• 开发了一种基于离子稳态的结核病诊断模型,为早期和准确的临床诊断提供了新型非侵入性工具。 • SLC24A2在结核病患者中高表达,并表现出稳定的诊断性能。 • 计算预测和分子对接表明,骨化三醇可以靶向并结合SLC24A2。 引言 结核病(
Col23a1 作为一种存在于细胞外基质(ECM)中的信号分子,在锑诱导的肺纤维化过程中驱动依赖于 DDR1-p38/ERK 通路的细胞外基质重塑(EMT)过程
摘要锑(Sb)的暴露会导致肺纤维化,但其分子机制尚不清楚。通过使用慢性Sb暴露小鼠模型结合单细胞RNA测序,我们发现Col23a1是在II型肺泡上皮细胞(AEC II)中高表达且特异性表达的胶原蛋白,其表达与上皮-间质转化(EMT)相关。进一步分析表明,Col23a1在细胞外基质
来源:Chemico-Biological Interactions
基于分子描述符的QSAR建模用于预测氨基甲酸酯衍生物的乙酰胆碱酯酶抑制活性
摘要背景乙酰胆碱酯酶(AChE)的抑制仍然是治疗阿尔茨海默病症状的重要策略。定量结构-活性关系(QSAR)建模有助于识别与AChE抑制活性相关的分子特征。方法分析了41种具有报道的AChE抑制活性的氨基甲酸酯衍生物,使用了1,420个DRAGON分子描述符。通过逐步向前选择方法开
Torijaponanes A–N是一种具有多种结构类型的倍半萜类化合物,来自日本独脚金(Torilis japonica)。这些化合物通过抑制NF-κB和MAPK的活性表现出抗炎作用
•分离出了14种具有不同碳骨架的新的倍半萜类化合物。•化合物1是首次从Torilis属中发现的carabrane型倍半萜。•八种倍半萜类化合物对NO的释放抑制效果优于DXM。•化合物7能够抑制IL-6、TNF-α、iNOS、IL-1β的mRNA表达。•化合物7通过调节NF-κB/
来源:Bioorganic Chemistry
发现一种具有强效体内抗黑色素瘤效果的4-芳氨基喹啉类化合物
```html • 简化的两步合成方法便于制备。 • 结构的活性关系(SAR)研究显著增强了抗
一项纵向的多代研究揭示,在独眼眼镜蛇(Naja kaouthia)的毒液中,低分子量毒素逐渐占据主导地位的发展趋势
• 这种动物的毒液在其发育过程中存在差异。 • 随着年龄的增长,活动能力和高分子量蛋白质的含量
来源:Biochimie
酮体代谢的调节:控制酮体生成和酮体分解的生化机制
• 酮体(KBs)既可作为替代燃料,也可作为信号代谢物。 • 酮体生成也发生在肝外组织中,但程
Fe₃O₄固定的磷掺杂氧化石墨烯的界面工程:在微生物电解池中实现优异的生物电催化生物氢生成性能
•Fe₃O₄/GOP阳极在膜电极(MECs)中的性能优于铂阳极,在0.240 m³ m⁻³ d⁻¹的H₂产率下表现出更优异的性能。•通过低成本(LOM)途径实现了198 mV的过电势(OER)和42.9 mV的塔费尔斜率(Tafel slope)。•该阳极能够富集Geobacte
来源:Biochemical Engineering Journal
机器学习衍生血液转录组生物标志物在帕金森病中的跨队列普遍性评估
• 使用11个分类器进行无泄漏嵌套机器学习流程,并在GSE99039数据集(n = 438)上重复5折交叉验证 •
来源:Biochemical and Biophysical Research Communications
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