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  • 综述:单细胞DNA甲基化测序:技术、计算方法及其在精准肿瘤学中的应用

    癌症是一种具有本质异质性的疾病,其特征是由特定遗传与表观遗传改变(如异常DNA甲基化)定义的恶性亚克隆。传统批量测序方法对大量细胞群体进行聚合分析,产生的平均甲基化组信号会掩盖驱动肿瘤发生、转移及治疗抵抗的罕见但具临床意义的表观遗传模式。单细胞DNA甲基化(s

    来源:Molecular Oncology

    时间:2026-07-12

  • 评估昆虫病原真菌与根瘤菌共接种对植物生长及根系形态影响的方法学框架

    昆虫病原真菌(entomopathogenic fungi, EPF)日益被认为是具有多重功能的生物投入品(bioinputs),但仍需要稳健的方法学途径来评估其与既有微生物接种剂的相容性及其对植物表现的影响。本研究提出了一个综合性框架,用于评估大豆(Glyc

    来源:Plants

    时间:2026-07-12

  • 综述:超选择性动脉内碘油注射(SIALI)引导下富血供肝脏肿瘤热消融:技术操作、机构差异及已发表证据的叙述性综述

    目的:经皮热消融是肝脏肿瘤的成熟治疗手段,但标准影像下肿瘤显影困难会限制其疗效。本研究旨在阐述超选择性动脉内碘油注射(SIALI)技术、不同机构的操作差异,并汇总SIALI引导下肝脏恶性肿瘤热消融的已发表临床证据。方法:采用叙述性综述设计,系统检索PubMed

    来源:Cancers

    时间:2026-07-12

  • 在全基因组选择中,用于染色体窗口内伪函数模型维度联合建模的可逆跳跃方法

    摘要背景随着大规模基因分型技术的发展以及单核苷酸多态性(SNP)标记的广泛可用,基因组选择已成为动植物育种中的重要手段。然而,该技术面临三个常见问题:多重共线性、标记维度过高以及计算成本高昂。为解决这些问题,人们通常采用混合模型或贝叶斯推断方法。近期,基于分箱的基因组窗口方法也被

    来源:BMC Genomics

    时间:2026-07-12

  • 用于法医外周血鉴定的高效14重cSNP SNaPshot检测方法

    摘要分析犯罪现场发现的体液痕迹时,不仅需要DNA谱型,还需要确定这些痕迹的成分,尤其是在混合痕迹中。先前的研究已经表明,可以通过mRNA生物标志物来区分法医体液。在本研究中,我们筛选了位于四种外周血mRNA生物标志物(CD3G、ANK1、SPTB和GYPA)上的14个cSNP,并

    来源:BMC Genomics

    时间:2026-07-12

  • D3aist:基于数据的空间转录组学中异常相互作用的检测方法

    摘要组织具有复杂的空间结构,这种结构决定了细胞的功能与相互作用,而传统的转录组学方法无法捕捉这一特征。空间转录组学能够在分析基因表达的同时保留细胞的位置信息,从而实现组织结构的高分辨率绘制。在分子层面解析的空间转录组学数据中,每个转录本的检测结果都与空间坐标和基因身份相关联,这类

    来源:BMC Genomics

    时间:2026-07-12

  • 贝叶斯优化颜色滤波器:一种用于从三维点云图像中快速分割植物表型的高效方法

    多光谱三维(3D)成像为植物表型分析提供了巨大的应用潜力,但植物器官的人工分割仍然是育种计划中的瓶颈。研究人员针对蚕豆(Vicia faba L.)点云开发了一种基于颜色的滤波工作流程,通过贝叶斯优化(Bayesian optimization)对光谱指数和宽

    来源:The Plant Phenome Journal

    时间:2026-07-12

  • Invas:一种考虑倒序的转录组组装方法

    摘要基因内倒位会改变基因内的序列方向,从而产生标准转录本组装工具无法识别的非共线剪接连接点,这会导致转录本重建不完整以及定量结果出现偏差。在此,我们介绍了Invas——一种基于批量短读长测序数据的倒位识别框架。该框架能够将全基因组测序的断裂点与转录组测序数据相结合,找回未映射的读

    来源:Nature Communications

    时间:2026-07-12

  • 单细胞多组学技术揭示了调控不同EMT肿瘤状态的转录网络

    摘要上皮间质转化(EMT)是一种动态过程,在此过程中细胞会失去上皮特征并获得间质特性。在癌症中,EMT与肿瘤的起始、进展、侵袭、转移以及治疗抵抗密切相关。EMT并非简单的二元状态转换,而是一个包含具有不同功能特性的多种肿瘤状态的连续谱。然而,调控这些EMT状态之间转换的转录因子目

    来源:Nature Communications

    时间:2026-07-12

  • 针对哥斯达黎加猪群中BVDV-2a的监测与分子检测,一种广谱常规RT-PCR检测方法的验证

    摘要

    来源:Viruses

    时间:2026-07-12


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