AGBT 2023：空间生物学成为关注热点，新品迭出

时间：2023年2月22日

来源：生物通

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作为全球基因组学研究界公认的盛会，AGBT大会为交流DNA测序技术的最新进展、基因组学研究的实验和分析方法提供了一个绝佳的平台。在此次大会上，空间生物学成为人们关注的热点。

2023年度基因组生物学技术进展大会（AGBT）于2月初在美国佛罗里达州好莱坞举行。作为全球基因组学研究界公认的盛会，AGBT大会为交流DNA测序技术的最新进展、基因组学研究的实验和分析方法提供了一个绝佳的平台。在此次大会上，空间生物学成为人们关注的热点。

空间生物学领域的先锋NanoString和10x Genomics都在今年的AGBT大会上展示了其第二个空间平台。对于这两家公司来说，第一个平台的推出是为了发现，以较低分辨率观察组织切片上的大量基因。如今，第二个互补平台的推出是为了更深入挖掘具体问题，可以更详细地观察较少基因。

NanoString公司之前推出了GeoMx数字空间分析平台，其目的是全面观察所有基因。如今，它又推出了CosMx SMI单细胞空间原位分子成像系统。它能够对组织切片中1,000多种RNA分子进行单细胞和亚细胞水平的超高分辨率成像。NanoString的想法是用GeoMx获得一幅整体画面，再用CosMx进行更深入的挖掘。

据介绍，CosMx SMI系统的检测靶标范围有望在明年从目前的 1,000 种 RNA 和 60 多种蛋白拓展至 6,000 种 RNA 和 120 种蛋白。研究人员能够在单细胞和亚细胞分辨率下对这些靶标进行表达定量分析和可视化观察，从而在原生环境下对单个细胞进行全面分析。

10x Genomics公司很早就推出了其空间平台Visium。目前，这个平台已被广泛采用，许多文献中的结果都是在Visium平台上产生的。不过，Visium的分辨率不太高，并非单细胞。因此，10x Genomics推出了Xenium原位分析平台，它能够深入分析400个靶标，未来也许能增加到1,000个。

据10x的首席技术官Michael Schnall-Levin博士介绍，Xenium的核心来自公司几年前收购Readcoor和Cartana公司时获得的技术。他回忆道，当时10x Genomics一直在考虑建立自己的高分辨率、单细胞空间仪器。公司从Readcoor和Cartana那里获得了一些组件，并将它们重新打造成Xenium。

Resolve Biosciences虽然是一家小公司，但却是AGBT大会的金牌赞助商。这家公司的核心技术是分子制图（Molecular Cartography），也就是组合式单分子荧光原位杂交（smFISH），能够让研究人员了解肿瘤细胞的基因表达，同时更好地了解细胞的生存环境。

据悉，在过去的两年里，Molecular Cartography技术在神经学、肿瘤学、发育生物学及其他多个领域揭示了许多重要见解。这项技术已应用在50多种组织类型上，并被15篇手稿和同行评审的文献所引用。在此次大会上，Resolve Biosciences宣布将扩展其端对端的Meridian服务计划。

此外，在AGBT大会上，Akoya Biosciences公司也展示了他们最新的PhenoCycler-Fusion系统。以往，Akoya一直被认为是一家蛋白质空间公司，但PhenoCycler-Fusion的推出让其进入了转录组学领域。Akoya指出，它的系统比其他系统周转更快，而且具备多组学（RNA和蛋白质）成像能力。

PhenoCycler-Fusion平台能够对整张组织切片进行多重的空间表型分析。它能在短短几分钟内对多个生物标志物和数百万个细胞进行成像，实现无偏向的空间表型分析。Akoya的首席商务官Niro Ramachandran博士预测，未来几年内，所有空间平台都将具有多组学能力，能够运行100-1,000重检测，并支持单细胞（或亚细胞）分析。