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在 2022 年,一场突如其来的全球猴痘(mpox)疫情打破了平静。这场疫情由猴痘病毒(MPXV)IIb 分支 B.1 谱系引发,主要通过性接触网络传播,给全球公共卫生带来了巨大挑战。纽约市(NYC)成为美国首个且疫情规模最大的地区,面对这一严峻形势,深入了解 MPXV 在纽约市的传播动力学变得至关重要。此前,虽然有研究对其他性传播病原体的传播网络有所了解,但对于 MPXV 在纽约市的传播情况,仍存在诸多未知。比如,MPXV 是如何传入纽约市的?其传播过程有何特点?与其他性传播疾病(如 HIV)的传播网络又有怎样的关联?这些问题都亟待解决,因为只有弄清楚这些,才能制定出更有效的防控策略,保障公众健康。来自多个研究机构的研究人员共同开展了这项研究,其中第一作者 Jonathan E. Pekar 来自英国爱丁堡大学(University of Edinburgh)等机构 。研究成果发表在《Nature Medicine》杂志上,为我们深入理解猴痘病毒传播提供了关键线索。
在 2022 年,一场突如其来的全球猴痘(mpox)疫情打破了平静。这场疫情由猴痘病毒(MPXV)IIb 分支 B.1 谱系引发,主要通过性接触网络传播,给全球公共卫生带来了巨大挑战。纽约市(NYC)成为美国首个且疫情规模最大的地区,面对这一严峻形势,深入了解 MPXV 在纽约市的传播动力学变得至关重要。此前,虽然有研究对其他性传播病原体的传播网络有所了解,但对于 MPXV 在纽约市的传播情况,仍存在诸多未知。比如,MPXV 是如何传入纽约市的?其传播过程有何特点?与其他性传播疾病(如 HIV)的传播网络又有怎样的关联?这些问题都亟待解决,因为只有弄清楚这些,才能制定出更有效的防控策略,保障公众健康。
来自多个研究机构的研究人员共同开展了这项研究,其中第一作者 Jonathan E. Pekar 来自英国爱丁堡大学(University of Edinburgh)等机构 。研究成果发表在《Nature Medicine》杂志上,为我们深入理解猴痘病毒传播提供了关键线索。
研究人员运用了多种关键技术方法。在基因组分析方面,他们收集了 2022 年 4 月至 2023 年 4 月纽约市 757 例、美国其他地区 1127 例以及全球其他地区 2160 例的 MPXV 基因组数据,并进行了系统的处理和分析。通过构建系统发育树,对病毒的进化关系和传播路径进行推断。在流行病学分析上,利用病例数据和疫苗接种数据,结合不同模型,如 EpiNow2 和基于基因组的方法,来推断有效再生数()和疫情的增长速率,以此评估疫情的发展趋势。此外,还基于男男性行为者(MSM)的性接触网络进行了疫情模拟,探究传播机制。
下面来看具体的研究结果:
猴痘在纽约市的出现:纽约市猴痘疫情在 2022 年夏季迅速增长,病例数在 7 月下旬达到峰值,早于美国其他地区和全球。纽约市对猴痘感染病例的测序比例较高,有助于进行精细的系统发育地理分析。研究推断,MPXV 可能在纽约市和美国其他地区隐匿传播了 1 - 2 个月,全球 MPXV 传入纽约市始于 4 月,6 月中旬达到高峰,且纽约市向美国其他地区有较多的病毒输出。
MPXV 传播簇:研究人员识别出 84 个纽约市 MPXV 传播簇,多数传播簇可通过至少一个突变可靠识别。通过分析,发现黑人或非裔美国人个体加入 MPXV 传播簇的几率增加,而白人个体和近期有国外旅行史的个体几率降低。传播簇成员身份与性别、性取向、年龄或疫苗接种状态无显著关联。
MPXV 与 HIV 传播簇的关联:MPXV 和 HIV 传播簇大小分布均高度右偏,且均符合无标度分布,表明二者传播动力学可能相似。研究还发现,感染 MPXV 的个体中,有相当比例同时感染 HIV,且 MPXV 感染与 HIV 诊断之间存在显著关联,同时感染两种病毒的个体多属于更紧密连接的性网络。
纽约市猴痘疫情的下降:通过多种方法推断有效再生数()和增长速率,发现疫情在 7 月底达到高峰时,在 6 月下旬达到峰值后开始下降,在疫苗接种剂量较少时,就已降至 1 以下,这表明疫苗接种对疫情下降的影响有限。
重尾性接触网络驱动疫情动态:基于 MSM 性接触网络的模拟显示,重尾性接触网络可解释疫情在产生实质性免疫之前的下降。高度连接的个体在疫情早期易感染,其感染导致性网络中密集连接部分的早期饱和,进而促使疫情以较低的累积发病率结束。
研究结论和讨论部分指出,纽约市长期的分子监测为研究 MPXV 和 HIV 传播网络之间的关联提供了契机。研究发现,早期引入纽约市的 MPXV 导致的传播簇更大,通过重尾性接触网络传播可以解释纽约市的疫情趋势。MPXV 和 HIV 虽然都通过重尾性接触网络传播,但由于自然史和进化史的差异,传播网络有所不同。尽管疫苗接种对 2022 年纽约市猴痘疫情的遏制作用有限,但可能在预防社区传播反弹方面起到了一定作用。
这项研究的意义重大,它为我们深入理解猴痘病毒在纽约市的传播机制提供了关键信息,有助于公共卫生部门制定更具针对性的防控策略。同时,研究结果也为未来研究性传播病原体的传播动力学提供了重要参考,推动了相关领域的进一步发展。
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