Nature解决难题：超灵敏游离 RNA（cfRNA）检测方法

时间：2025年4月18日

来源：Nature

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为解决游离 RNA（cfRNA）检测敏感性不足的问题，研究人员开展了 RARE-seq（随机引物和 cfRNA 片段亲和捕获测序富集分析）方法的优化研究。结果显示该方法比全转录组 RNA 测序（RNA-seq）灵敏度高约 50 倍，在多种疾病诊疗中展现潜力，意义重大。

敏感的游离 RNA（cfRNA）检测方法有助于进行非侵入性基因表达分析和疾病监测。

这里介绍了 RARE-seq（随机引物和 cfRNA 片段亲和捕获测序富集分析），这是一种针对 cfRNA 分析优化的方法。研究表明血小板污染会严重干扰 cfRNA 分析，并开发出克服该问题的方法。在分析验证中，发现 RARE-seq 检测肿瘤来源的 cfRNA 的灵敏度比全转录组 RNA 测序（RNA-seq）高约 50 倍，检测限为 0.05%。

为探究临床实用性，研究人员对 369 名癌症患者、非恶性疾病患者和对照组的 437 份血浆样本进行分析。结果显示，在 cfRNA 中检测非小细胞肺癌表达特征的灵敏度随疾病分期增加（I 期 20 例中有 6 例（30%）；II 期 8 例中有 5 例（63%）；III 期 15 例中有 10 例（67%）；IV 期 96 例中有 80 例（灵敏度 83%，特异性 95%）），且 RARE-seq 比基于肿瘤未知的循环肿瘤 DNA（ctDNA）分析更灵敏。在对酪氨酸激酶抑制剂产生耐药性的 EGFR 突变非小细胞肺癌患者中，检测到了组织学转化和基于突变的耐药机制。

最后，研究还证明了 RARE-seq 在确定肿瘤起源组织、评估良性肺部疾病和追踪 mRNA 疫苗反应方面的潜在用途。这些结果突出了超灵敏 cfRNA 分析的潜在价值，并为多种临床应用提供了概念验证。