-
基于全基因组测序解析阿拉伯马的基因组多样性、结构与遗传变异频率数据库构建
为解析阿拉伯马种群遗传结构、评估其多样性及潜在选择信号,并构建可用于育种和疾病研究的实用基因组资源,研究人员对来自波兰、美国、埃及和叙利亚的120匹代表性个体进行了高深度全基因组测序。研究首次成功建立了包含1,170万个单核苷酸多态性位点(SNPs)及其频率的公开数据库,揭示了4个群体间清晰的遗传分化,并识别了6,210个潜在的固定选择区域。该数据库为马属基因组学研究、遗传病筛查和育种管理提供了重要的基础资源,具有显著的科学和实用价值。
来源:BMC Genomics
时间:2026-04-22
-
Sylvioidea鸣禽性染色体易位与进化阶层的比较基因组学解析
本研究针对Sylvioidea鸣禽性染色体演化机制不清的问题,通过全基因组数据分析,揭示了Nicatoridae与Cisticolidae两非姐妹群中Chr Z–4A保守连锁及Chr 4片段独立易位事件,证实了重组抑制与进化阶层的谱系差异,为理解复杂基因组中性染色体演化的重复性与独立性轨迹提供了关键证据。
来源:BMC Genomics
时间:2026-04-22
-
大麦过氧化物酶基因家族的群体与泛基因组分析揭示其进化动态及功能分化意义
本研究为揭示基因家族扩张在作物适应性进化中的作用,科研人员聚焦全球重要禾谷类作物大麦,系统解析了其过氧化物酶(POD)基因家族的扩张模式与进化规律。结果表明,扩张的HvPOD基因在系统发育上成簇分布,具有保守的外显子-内含子结构,并呈现组织特异性表达谱及在非生物胁迫下的差异调控,暗示其在生长发育和胁迫响应中的功能分化。群体遗传学分析发现该家族存在轻微的驯化瓶颈,野生与栽培大麦间存在明显的单倍型分化。对76个基因组的进一步分析将HvPOD基因集划分为核心与非核心基因,发现核心基因承受更强的纯化选择,这与必需功能的保守性一致。该研究阐明了大麦POD基因家族的进化历史与功能多样性,为未来大麦遗传改良提供了重要的遗传学见解。
来源:BMC Genomics
时间:2026-04-22
-
针对无花果果实采后烟霉病病原菌纤细枝孢菌的基因组解析:菌株SHK1100的测序、组装与功能注释
本研究针对因纤细枝孢菌(Cladosporium tenuissimum)侵染导致的无花果果实采后烟霉病,通过对其日本分离株SHK1100进行基因组测序与分析,构建了高质量基因组草图。该研究完成了菌株的基因组组装、完整性评估与功能基因预测,为深入理解该类真菌的致病机理和次级代谢产物合成提供了关键的遗传资源基础。
来源:BMC Genomic Data
时间:2026-04-22
-
水稻OsEXO70基因家族全基因组鉴定及其在盐胁迫下的表达模式分析
本研究系统鉴定了水稻OsEXO70基因家族成员,解析其表达模式及在盐胁迫下的调控作用,为揭示水稻抗盐机制及抗逆育种提供了理论依据与基因资源。
来源:BMC Genomics
时间:2026-04-22
-
基于Transformer的泛特异性MHC-I肽结合预测模型TransBindpMHCI:助力肿瘤新抗原鉴定与个性化疫苗设计
肿瘤新抗原的鉴定因数据规模、预测精度和跨物种兼容性等限制而面临挑战。为此,研究人员开发了基于Transformer的泛特异性MHC-I肽结合预测模型TransBindpMHCI。该模型利用140余万条质谱筛选的MHC呈递肽进行建模,直接捕获肽生成与呈递的真实过程。其双层Transformer编码器架构显著提升了肽-MHC结合模式的特征提取能力,同时降低了计算复杂度。模型还将预测范围扩展至8-15个氨基酸的肽段,并实现了对人类和小鼠MHC-I分子的跨物种兼容。综合评估表明,TransBindpMHCI在准确性、计算效率和泛化能力上均优于现有方法,能鉴定出免疫原性更强的肿瘤新抗原,为推进肿瘤新抗原验证与个性化疫苗设计带来了重要希望。
来源:BMC Bioinformatics
时间:2026-04-22
-
生殖细胞导向的外泌体递送实现鸟类体内遗传修饰
本研究针对鸟类早期胚胎(蛋壳硬、卵黄不透明)难以进行遗传操作的问题,探索了以鸡PGC(原始生殖细胞)来源的exosomes(外泌体)作为纳米载体递送质粒DNA。研究发现该策略可实现体内生殖系靶向递送,为禽类基因组工程提供了新方法。
来源:Journal of Nanobiotechnology
时间:2026-04-22
-
γ射线辅助内生真菌生物合成氧化锌纳米颗粒:一种针对革兰氏阳性菌的高效抗菌与抗生物膜新策略
随着抗生素滥用导致耐药菌问题日益严峻,开发新型绿色抗菌剂迫在眉睫。本研究利用罗勒内生真菌Aspergillus tamarii的生物活性代谢物,结合γ射线辐照,成功实现了氧化锌纳米颗粒(ZnO NPs)的绿色合成。所得纳米颗粒对枯草芽孢杆菌和金黄色葡萄球菌展现出优异的抗菌和抗生物膜活性,其作用机制与破坏细菌细胞膜通透性相关。该研究为开发低成本、环境友好的新型纳米抗菌材料提供了新思路。
来源:Microbial Cell Factories
时间:2026-04-22
-
镁锰双单原子掺杂碳点纳米酶:超强SOD活性与荧光成像协同治疗急性肝损伤
针对急性肝损伤中ROS介导的氧化应激与炎症难题,本研究构建了兼具超氧化物歧化酶(SOD)活性(>20000 U/mg)与荧光示踪(量子产率>16%)的Mg/Mn双单原子碳点(MgMn@CD)纳米酶。该材料通过清除ROS、修复线粒体功能及抑制细胞死亡通路,展现了优异的肝保护效果,为肝损伤诊疗提供了新策略。
来源:Journal of Nanobiotechnology
时间:2026-04-22
-
空气污染驱动的肝细胞癌关键调控因子:通过整合生物信息学和网络毒理学进行鉴定
本研究探究七种常见空气污染物(苯、甲苯、SO₂、NO₂、NO、CO、O₃)与肝细胞癌(HCC)发生发展的分子机制。通过多数据库分析、PPI网络可视化、GO/KEGG富集分析筛选出55个交叉基因,经五种算法筛选出8个核心基因(ESR1、MMP9、RELA、PARP1、DNMT1、CDK1等),TCGA验证显示其表达水平与HCC显著相关,ROC曲线证实诊断价值,KM生存分析表明其中6个基因与患者预后相关,并通过分子对接揭示污染物与核心基因的潜在相互作用。
来源:Toxicology and Environmental Health Sciences
时间:2026-04-22