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靶向富集:让测序经费花在刀刃上[心得点评]
以外显子组为例,它仅占基因组的1%到2%,但却含有85%的已知致病突变。这么看来,与全基因组测序(WGS)相比,外显子组测序相当于减少了98%的测序工作。不用说,靶向测序集合(panel)更是大大减轻你的负担。在此,我们看看研究人员是如何开展靶向富集的,以及他们研究时的考虑因素。
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癌症与免疫系统初探2:T细胞库和抗体库
人体免疫系统提供一种保护作用,来对抗各种各样的病原体以及肿瘤。这种保护是通过B 细胞和T 细胞表面与致病性或病原体来源的抗原结合的巨大的受体库来介导的。T 细胞通过表达异二聚体(αβ 或γδ)细胞表面受体(T 细胞受体,或TCR)来介导细胞免疫,这需要异源细胞呈递与MHC结合的肽段抗原。
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PacBio将推出新的应用程序,协助稀有变异等分析
随着新一代测序的日渐普及,大家手头的数据越来越多,不过,数据分析也成了更大的难题。为了帮助大家应对挑战,Pacific Biosciences公司将推出三款新的应用程序,可用于稀有变异、结构变异和微生物WGS的分析。
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Illumina 靶向测序定制Panel 服务全线开放
Illumina 针对广大客户的需求,在固定内容的试剂盒或靶向集合之外,另推出Panel 定制服务。仅需提供目标区域,即可经由自助在线定制工具或Illumina专业设计服务,获得个性化的定制Panel。
来源:Illumina
时间:2017-04-28
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从ccfDNA中挖掘深度信息,你需要这个一体化方案[新品推荐]
由于ccfDNA通常以低浓度存在,带稀有突变或被片段化,故整个流程必须灵敏可靠。QIAGEN为研究人员从ccfDNA中挖掘深度信息提供了必需的一切:一个完整且简化的流程,覆盖采集、稳定、分离、分析和数据解释。快看QIAGEN的解决方案!
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多项独立研究证实了QIAGEN测序平台的性能
QIAGEN的新一代测序系统GeneReader NGS System与其他测序仪不同,致力于提供从样品制备到数据解读的完整流程,为各类实验室带来有意义的NGS数据解读结果。最近,QIAGEN宣布有5项新的独立研究发表,证实了GeneReader系统的分析性能和简便易用。
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癌症研究经验谈3:三位大师畅谈高通量测序对临床研究的影响
测序技术已大大超出了Carlos Bustamante、Stephen Kingsmore和John Mattick三位博士的预期。如果你在他们的职业生涯的早期询问他们,是否有一天我们能在一天内测序人类全基因组,他们的反应将分别是:“疯言疯语!”,“绝对不可能。”以及“做梦也不敢想。”
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在miRNA测序中,别让接头二聚体和污染性RNA偷走了您的序列……[新品推荐]
尽管NGS是发现新miRNA的默认工具,但市面上的文库制备试剂盒很繁琐,会引入偏向。因此,qPCR一直是定量miRNA表达的首选技术。如今,QIAseq miRNA Library Kit重新定义了小RNA测序产品,包含了其他测序试剂盒没有的一些独特功能。
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Science最新报道:单细胞测序助跑癌症精准分型
麻省综合医院(MGH)、MIT布罗德研究所、哈佛大学近日在Science杂志上发表了一篇文章(3月31日),使用单细胞RNA测序技术,并结合癌症基因组图谱分析了星形细胞瘤和少突神经胶质瘤两种脑神经胶质瘤的细胞组成。通过细致全面的基因表达分析,结果显示两种肿瘤可能源自同一种神经前体细胞可以通过基因突变类型和微环境组成对该两种肿瘤进行区分。
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新型经济快捷的基因组测序技术
美国贝勒医学院、德克萨斯儿童医院、麻省理工大学、以及哈佛大学共同组成的研究小组,开发出一种新的基因组测序方法,可以完全从0开始创建人类参考基因组,费用低于1万美元。