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50小时快速诊断新生儿遗传病[创新技巧]
美国儿童慈善医院(Children's Mercy Hospital)的研究人员首次应用全基因组信息来诊断危重婴儿。研究小组介绍了STAT-Seq这种全基因组测序方法,从血液样品到结果返回给医生,仅需50个小时。
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MiSeq测序仪获FDA采购应用并将全面升级[新品推荐]
日前,MiSeq测序仪可谓双喜临门,不仅获得美国食品药品监督管理局(FDA)的认同,更将全面强势升级。作为中国区第一家引进MiSeq的公司——上海派森诺生物科技有限公司,日前已实现MiSeq 测序仪硬件和软件升级,只待最新试剂盒的推出,即可实现全面升级。
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别让样品制备拖了测序的后腿
炙手可热的第二代测序技术NGS在研究界可谓是家喻户晓,NGS在降低DNA分析成本的同时大大提高了通量,但其样品制备依然繁琐。不过,我们绝不能让NGS文库制备拖了后腿。一款趁手的好工具不仅能帮我们省时省力,更能为实验结果保驾护航。本文就为您介绍了目前市面上的一些样品制备产品。
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美国FDA采购Illumina公司1700万美元MiSeq测序仪及试剂用于病原体鉴定
FDA在项目中选择MiSeq®系统,探索NGS作为加强食品安全的机制。利用MiSeq,他们能从以往的病原体采集物以及全国各地农产品中采集而来的细菌中产生高质量的全基因组序列数据。测序数据将实时上传到美国国家生物技术信息中心(NCBI)的相关数据库中,从而加强数据库的来源追踪查询能力。
来源:Illumina
时间:2012-09-24
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单分子测序揭示艾滋病毒可变剪切新模式
HIV-1病毒的基因组比已知任何其他病毒基因组都复杂。二代测序平台的读长短,往往只能通过猜测和推断来分析病毒转录组的剪切位点。PacBio单分子测序产生的读长长,能够一次性完成对cDNA的通读,直接识别剪切位点。研究人员利用PacBio平台对HIV-1病毒转录组可变剪切进行了研究,发现了可变剪切的新模式,文章发表在Nucleic Acids Research杂志上。
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Life Tech正式发售Ion Proton系统[新品推荐]
Life Technologies公司于上周四宣布正式发售Ion Proton™ 系统。该平台的速度、易用以及经济实惠将让基因组测序变的普及。如今,所有的科学家和医学研究人员都有机会实现基因组规模的测序,势必带来生命科学和临床研究的新一轮突破。
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Life Tech:让读长更长,准确性更高
Life Technologies公司近日宣布了Ion AmpliSeq技术的又一次性能提升。全新的3.0版本Torrent Suite软件能为短的和长的均聚物区域带来99.99%以上的准确性,并将正确检出的插入缺失和均聚物序列频率提高2倍。
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Illumina:个人基因组测序服务只需2周
Illumina近日宣布推出快速的个人基因组测序服务(IGS),其周转时间低至2周。今年6月,Illumina曾推出快速周转的全基因组测序服务,由HiSeq平台的技术创新来实现。如今,CLIA认证实验室也融合了这些进展,让IGS服务以同样快速的周转时间实现。
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罗氏454追踪“超级细菌”传播途径[创新技巧]
研究人员利用454对第一位病人咽喉、支气管肺泡灌洗液、腹股沟、尿液中的分离的细菌进行深度测序,发现尿液中有原始的NTUH-K2044型菌株,其他部位的菌株共含有7个不同突变,其中支气管肺泡灌洗的菌株和咽喉部位的菌株共有3个突变,咽喉部位含有额外1个突变,腹股沟的菌株含有完全不同三个突变。
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乱花渐欲迷人眼,RNA-seq工具面面观
如今人们进行转录组分析大多是在第二代测序平台上进行RNA-seq,将样品中的RNA反转录为cDNA,构建测序文库,再进行测序分析。随着RNA-seq技术的逐渐普及,自然也出现了许多RNA-seq分析工具,面对如此多的选择您是否已经眼花缭乱了呢?本文就为您从头至尾进行了一番梳理。