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直接甲基化测序区分病原菌表观遗传学差异
在2012年7月美国微生物学会(ASM)大会上,美国农业部的研究团队发布了他们的*新研究,利用PacBio RS测序技术比较了两次大肠杆菌疫情中爆发株的基因组,揭示了这种重要食源性致病菌的基因组多样性和毒力演化。研究显示单分子测序技术可以直接进行甲基化测序,帮助研究人员同时进行结构变异和表观遗传学研究。
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单分子测序轻松升级参考基因组
随着二代测序技术的发展,人们对越来越多的物种进行了基因组测序,但大部分物种的基因组还存在大量缺口,给基因组信息解读造成了不小的困难。美国Baylor医学院的研究人员正在进行一项重要研究,利用单分子测序技术对模式生物的基因组草图进行升级。研究显示,该技术大大提高了基因组的完整性,降低了后续实验和分析的难度,远优于传统方法。
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Ion Proton测序仪即将上市 业内人士看好[新品推荐]
Life Technologies公司新一代Ion Proton测序仪将于本月上市。最先推出的是Ion Proton I芯片,适合外显子组测序。而在今年底或明年初,Life Tech将继续推出Ion Proton II芯片,用于全基因组测序。一些业内人士纷纷表示看好Ion Proton。
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华大科技率先成功推出TruSeq微量转录组技术服务
该技术在国内首次通过TruSeq RNA试剂盒成功实现转录组的微量建库,总RNA建库起始量低至200ng,突破了微量或珍贵样品进行常规转录组建库风险高、成功率低的瓶颈,实现了高效、稳定的微量转录组测序,将有助于更好地推动功能基因组学研究。
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单分子测序助力髓母细胞瘤外显子组测序研究
麻省理工和哈佛医学院近期在Nature杂志上发表了一项髓母细胞瘤外显子组测序的研究,科学家们利用单分子测序成功对外显子测序数据中的变异位点进行了验证分析。研究显示,PacBio RS测序技术能对基因组中的低频变异进行高效释读,且能够有效弥补Sequenom和Sanger方法的缺陷,可以寻找除已知位点以外的其他漏检稀有突变。
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单分子测序解决“极端”基因组组装难题
极地微生物生存在正常生物无法生存的环境中,具有很大的研究价值。然而,极地微生物基因组中的GC含量普遍较高,这种“极端”基因组给测序和信息解读造成了极大困难。研究人员在PacBio单分子测序技术的帮助下首次完成了一种分离自南极的高GC含量基因组菌株的基因组de novo测序。
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康宁推出一系列产品,简化NGS样品制备[新品推荐]
康宁公司近日宣布,它近日推出了新的Axygen® 品牌的IMAG™手持式磁珠分离设备,用于新一代测序。这种新型的磁珠分离设备彻底改变了生物学研究所用的手动磁珠分离过程。其应用包括核酸纯化、细胞分析、抗体纯化和蛋白纯化。IMAG磁珠分离设备可将整个分离过程的时间和劳动减少50%以上。
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第三代测序系统PacBio RS新升级--长片段数据产量大幅提升[创新技巧]
PacBio公司于2012年8月发布了*新升级的磁珠上样模块,配套试剂盒MagBead Kit及新版系统软件(V1.3.2),可大大提高长片段在单分子孔中的Loading效率,从而成倍提高长片段读序的数据产量。
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快速高效的新一代测序文库制备[新品推荐]
默克密理博近日推出了PureGenome™试剂盒及试剂,用于快速高效的新一代测序样品制备。有了这些试剂,文库制备可简化成2步,在2小时内完成,接着是一个简短的富集步骤,从而减轻了测序过程的瓶颈。
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罗氏454测序用于灵芝基因组图谱绘制[创新技巧]
灵芝(Ganoderma lucidum)在中国被称为“不朽的蘑菇”, 用于中医药中已有超过2000年历史,从中也可以提炼出多种有价值的生物活性成分,其药理活动的广泛认可,已被列入美国草药药典。最近中国的一个研究小组在Nature上发表文章1,报道完成了灵芝G. lucidum 260125-1菌株 43.3 Mb的基因组图谱。