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PacBio碱基修饰分析标识微生物、病原菌的表观遗传学标志
Pacific Biosciences的用户现在可以使用公司最新发布的碱基修饰分析方法在微生物和致病菌中(如大肠杆菌Escherichia coli和沙门氏菌Salmonella)研究甲基化及其它表观遗传学事件。
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新技术攻克单分子测序大问题
来自冷泉港实验室(CSHL)的一位定量生物学家及其同事开发出了一种混合错误校正新方法,攻克了PacBio单分子测序的重大问题,可将长读序的准确度提高到99.9%。这一研究成果发布在7月1日的《自然生物技术》(Nature Biotechnology)杂志上。
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Life Tech扩大突变筛查产品线[新品推荐]
Life Technologies公司近日宣布,它将扩大Ion AmpliSeq™产品线,推出Comprehensive Cancer Panel和Inherited Disease Panel。这些独一无二的分析板,再加上Ion AmpliSeq Designer V1.2、Ion AmpliSeq Library Kit 2.0和新的Ion Reporter™软件,为研究人类疾病遗传基础的科学家奉上了一个完整的解决方案。
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454用于西红柿基因组测序[创新技巧]
最近,西红柿基因组学会完成了一个农业种植西红柿品系Solanum lycopersicum的基因组图谱,以及一个野生型西红柿品系S. pimpinellifolium的基因组图谱,并将其与已知的土豆基因组以及其他植物比较,寻找与水果有些特性相关的基因,相关文献在Nature杂志作为封面文章发表。
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454测序用于美洲奶牛种牛基因组测序项目[创新技巧]
一只名为Pawnee Farm Arlinda Chief的种牛和它的儿子Walkway Chief Mark大约有60000个后代,其后代是牛奶生产的主力。最近一项研究中1,科学家通过454全基因组测序,掌握了他们的基因组中控制重要性状的基因,包括抗病能力、牛奶产量,这些性状已通过北美的当代荷兰奶牛育种活动传播到大量用于牛奶生产的奶牛基因组中。
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PacBio推出首款检测DNA碱基修饰的软件[新品推荐]
DNA碱基修饰(如甲基化)在多个生物进程中扮演了重要角色,包括生长和衰老、免疫、细菌致病性以及疾病发展。PacBio此次推出的新软件能够让研究人员轻松检测并查看这些DNA修饰。软件通过测定测序过程中DNA碱基掺入的速率而发挥作用。此信息在测序过程中自动收集,是该公司单分子实时(SMRT)测序技术的一个独特之处。
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最新综述:超越5种碱基的DNA测序(三)
迄今为止的DNA测序研究大多集中在分析四种标准碱基和5-甲基胞嘧啶。研究显示核苷酸的许多其他化学修饰也控制着基本生命功能,而这些修饰不能通过传统测序方法进行检测。发表在Current Opinion in Structural Biology杂志上的这篇综述着重介绍了一些新兴的具有直接检测多种DNA碱基修饰类型潜力的单分子测序技术。
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最新综述:超越5种碱基的DNA测序(二)
迄今为止的DNA测序研究大多集中在分析四种标准碱基和5-甲基胞嘧啶。研究显示核苷酸的许多其他化学修饰也控制着基本生命功能,而这些修饰不能通过传统测序方法进行检测。发表在Current Opinion in Structural Biology杂志上的这篇综述着重介绍了一些新兴的具有直接检测多种DNA碱基修饰类型潜力的单分子测序技术。
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最新综述:超越5种碱基的DNA测序(一)
迄今为止的DNA测序研究大多集中在分析四种标准碱基和5-甲基胞嘧啶。研究显示核苷酸的许多其他化学修饰也控制着基本生命功能,而这些修饰不能通过传统测序方法进行检测。发表在Current Opinion in Structural Biology杂志上的这篇综述着重介绍了一些新兴的具有直接检测多种DNA碱基修饰类型潜力的单分子测序技术。
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454 GS Junior及NimbleGen序列捕获用于结直肠腺癌相关基因突变热点分析[创新技巧]
美国一研究小组最近开始将GS Junior测序仪用于结直肠腺癌相关基因突变的图谱分析,以试水该方法可为癌症个性化治疗带来的价值。该项目的开展证明这一方法将来用于临床诊断的潜力以及可行性,与该项目相关的网络视频讲座已经由Science杂志以及Roche共同举办。