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454 GS Junior测序仪将在2012-2013年增加测序读长及推出新自动化方案
454公司将在2012年-2013年间陆续推出一系列提高测序性能以及自动化工作流程的GS Junior升级方案。GS Junior系统在传染病,癌症,环境微生物及农业研究方面都有广泛应用。
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NimbleGen序列捕获产品将用于英国50000个外显子组测序项目[创新技巧]
NimbleGen SeqCap EZ Exome捕获产品被英国一医学协会选定作为一项50000个外显子组测序项目的专用序列捕获技术。这个协会侧重研究罕见血液疾病研究,其成员来自多个交叉领域包括基因组学、生物信息学、统计学、细胞生物学、以及模式系统研究,目的在于更好地了解罕见血液病以及遗传因子在这些疾病中的作用。
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技术讲座笔记:单分子测序PacBio[心得点评]
号称第三代的单分子测序技术,又是一个划时代的新里程碑,必将为研究开辟出新的领域和思路,不可错过。可惜PacBio厂家公开的技术讲座今年四月在国内只得2场,讲座实况暂时不允许公开,生物通编者整理了一份详尽的讲座笔记并稍作调整补充,以飨读者。
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Ion Proton测序仪已在贝勒医学院安装[新品推荐]
Ion Proton系统是Ion PGM系统的互补平台,而后者据称是世界上销售最快的台式测序仪。Ion PGM系统为基因、小型基因组和小RNA的测序提供了快速且经济的方案。而新的Ion Proton系统将为致力于了解外显子组、转录组和人类规模基因组的科学家带来快速且廉价的测序。
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GS Junior测序平台用于动物保护研究[创新技巧]
罗氏新近与美国一国家动物园进行合作,将Roche GS Junior测序系统投入到隶属该动物园的动物保护及进化遗传学中心的研究工作中。该中心将依靠二代测序平台的高深度DNA测序能力,开展新的动物的疾病耐受性、群体遗传学、分子生态学研究。
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Nature:三大主流基因组测序仪比较[心得点评]
台式测序仪为大众化基因组测序带来了希望,但是对于不熟悉测序技术的科研人员来说,要从这个竞争激烈的行业过热宣传中找到自己想要的测序仪,并不是件容易的事情。因此来自英国的一组研究人员进行了三大主导机型——罗氏454的GS Junior,Illumina的MiSeq,还有Life Technologies的Ion Torrent个人化基因组测序仪(PGM)的比对……
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RNA-Seq发现乳腺癌中的基因融合[创新技巧]
对于目前读长较短的新一代测序而言,当基因融合丰度较低时,发现难度较大。在此项研究中,研究人员利用Life Technologies的RNA-Seq,介绍了一种能够检测癌细胞系中基因融合的新方法。此方法中的秘密武器是一种新算法,能发现融合的断裂点。
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罗氏454即将推出GType白血病相关基因测序测试盒
罗氏即将推出针的GType 白血病相关基因试剂盒,可检测RUNX1/TET2/CBL/KRAS基因,这些基因的突变性常见于在骨髓增生性疾病、骨髓增生异常、急性骨髓性白血病、急性淋巴性白血病患者的各种血液细胞中。
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第三代测序系统PacBio正式升级 读长达3K[新品推荐]
美国第三代测序公司Pacific Biosciences近日正式宣布其PacBio RS测序系统的重大升级(简称为C2试剂),这包括新的试剂、增强的SMRT Cell和升级的软件。与2011年4月发布的C1版本相比,此次发布的C2试剂和软件让片段平均读长显著提高,从过去的1300bp猛地提升至3000bp。
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罗氏进一步提升GSJunior测序平台性能[新品推荐]
继之前的各种GS Junior实验方法不断推出,去年推出的GType HLA引物试剂盒成功在GS Junior上得以应用,以及即将上市的GType Leukemia RUNX1/ TET2/CBL/ KRAS白血病相关基因试剂盒都将不断扩张GS Junior的应用领域,为各类研究提供成熟可靠的实验方案。