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罗氏GS FLX+系统测定西班牙耐药菌基因组[创新技巧]
一个西班牙医院近期发生Klebsiella pneunomiae细菌的暴发事件,研究人员分离了三个具有耐药性的Klebsiella pneunomiae菌株,并利用罗氏454 GS FLX+系统获得了其基因组序列,这些数据补充了该细菌属的少量已知基因组信息,为其相关的耐药性研究、基因组进化研究提供了新的依据。
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Illumina新品实现癌症突变的快速检测[新品推荐]
Illumina公司近日宣布推出了TruSeq Amplicon - Cancer Panel,这是一个专为MiSeq系统而优化的多重分析,能让研究人员准确地对数百个最相关的癌症位点进行测序,即使它们在困难的样本中,如福尔马林固定、石蜡包埋(FFPE)的肿瘤样本。
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第一个测序云计算平台来了!
云计算,这个时髦的IT术语和生命科学有啥关系?实验技术的不断创新,使研究规模和可获得的数据量急剧扩增,当普通实验室计算能力已不足以应付日益庞大的数据分析时,云计算提供了解决之道。首个新一代测序云计算的诞生,不单将有助于解决数据瓶颈问题,更为未来的实验室数据分析指出新的方向。
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灵活巧用MiSeq在农业基因组学[创新技巧]
小巧经济的MiSeq系统可在数小时内带来新一代测序结果,而不必花费数周,为农业基因组学研究中毛细管电泳提供一种更高通量的替代。相比毛细管电泳可实现更简化的流程和更快的数据分析,一台仪器可实现小到中型基因组的De Novo测序和重测序,血统验证,RAD-Seq,转基因检测……
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454高深度测序发现逃脱早期免疫反应的HIV病毒株[创新技巧]
部分HIV病毒会在感染初期逃脱体内免疫反应,并通过快速的基因组重组而不被免疫系统的识别,在受感染者体内存活下来并进一步繁殖。科研人员正在通过新一代测序技术,增强对不同HIV病毒基因组的认知,改进HIV疫苗设计,希望以此提高对于艾滋病病情的控制能力。
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个人基因组测序之初体验
随着基因组测序的价格大幅下降,也许很快将会降至1000美元甚至更低。低廉的价格可能会促使它成为一个常规的诊断工具,或满足人们的某种好奇心。然而,即使我们知道了结果,那又能怎么样呢?在惴惴不安中度过余生?
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2011创新产品:Ion PGM测序仪[新品推荐]
首款基于半导体技术的测序仪让人眼前一亮。它支持三种价格和产量不等的半导体芯片,灵活可扩展。创新的半导体芯片让测序仪更快速、更易用,且价格更具竞争力。它降低了新一代测序技术的门槛,让我们向真正的个性化医疗又走近了一步。因此,Ion PGM™测序仪被广大读者评为“2011生命科学十大创新产品”。
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华大基因FFPE测序技术获新突破,DNA建库起始量低至200ng
来自华大基因的研究人员在FFPE测序技术上获得新突破,他们只需从福尔马林固定石蜡包埋的组织标本中提取200ng DNA便可直接进行建库、测序及分析。该技术突破可以解决分子生物学实验中缺少实验样本的难题,增加实验的可靠性及准确性。
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2011创新产品:MiSeq测序系统[新品推荐]
MiSeq个人型测序系统采用Illumina久经考验的TruSeq™边合成边测序技术,但售价要低得多。MiSeq的上市实现了许多普通实验室的测序梦想,让新一代测序触手可及,因此,它也被广大读者评为“2011生命科学十大创新产品”。
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“U盘”上的基因组测序[新品推荐]
GridION节点包含了一次性的cartridge,上有2000个纳米孔,能够在24小时内处理几十Gb的序列数据。多个节点可相互连接,实现更强大的处理能力。一次性的MinIon特有500个纳米孔,价格低于900美元。尽管Oxford还未对GridIon定价,但预计每Gb的成本与其他系统更具竞争力。