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华大基因最新研发猴外显子捕获芯片及平台[创新技巧]
全球最大的基因组学研究机构之一——华大基因,于今日公布其已研发出猴外显子测序及分析平台,该平台具有更加简便,经济,高效,运行周期短等优点。据悉,猴外显子捕获芯片和新一代高通量测序技术为该平台的两大核心技术。这两大技术的完美结合,使研究人员可以对每个猴基因组的所有外显子进行测序分析。
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454测序技术对艾滋病感染者干燥血斑中病毒进行抗药性检测[创新技巧]
加拿大公共卫生局的研究人员利用二代测序技术对血斑中的艾滋病病毒基因进行测序,低成本地检测HIV病毒抗药性。此方法比基于PCR的对血浆样品进行基因分型的成本更低,还可以更全面地了解艾滋病毒抗药性信息。
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单细胞测序技术的突破[创新技巧]
来自J. Craig Venter研究所、加利福尼亚大学以及Illumina Cambridge公司的研究人员组成了一个研究小组,对加利福尼亚海洋样本中的单个细菌细胞基因组进行了测序。他们仅利用短片段读取,实现了这种不可培养的细菌的基因组装配,获得了宏基因组研究中缺少的细胞特异的遗传信息。
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测序数据分析之工具大全
目前有不少用于基因组装配和比对的程序和算法,但是该选哪一个呢?许多序列分析的专家认为,这取决于基因组的大小、读取有多长,以及采用的是哪种测序技术。通常,软件还需要优化,以满足每个实验室的独特需求。在《测序数据分析之专家指南》系列文章中,多位专家推荐了他们心水的软件工具。在此,我们整理了这些数据分析工具的信息,供大家参考。
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测序数据分析之专家指南(下)[心得点评]
目前有不少用于基因组装配和比对的程序和算法,但是该选哪一个呢?许多序列分析的专家认为,这取决于基因组的大小、读取有多长,以及采用的是哪种测序技术。通常,软件还需要优化,以满足每个实验室的独特需求。在此,一些专家分享了他们的经验。
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测序数据分析之专家指南(上)[心得点评]
目前有不少用于基因组装配和比对的程序和算法,但是该选哪一个呢?许多序列分析的专家认为,这取决于基因组的大小、读取有多长,以及采用的是哪种测序技术。通常,软件还需要优化,以满足每个实验室的独特需求。在此,一些专家分享了他们的经验。
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德国总理默克尔启动第三代测序仪[新品推荐]
首次由德国总理启动的PacBio RS属于采用单分子测序技术的第三代DNA测序系统,有着其他系统无可匹敌的高达1000bp的平均序列读长,与第二代测序系统相比,它能更快获得结果--不到一天,且测序前无需扩增DNA,避免了潜在的错误。
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三款热门个人型测序仪比拼[选购宝典]
为了让更多的实验室能够有机会使用新一代测序技术,各大公司也争相推出了个人型测序仪。生物通近期对市场上三款热门的个人型测序仪进行了介绍,包括罗氏454的GS Junior、Life Technologies的Ion PGM和Illumina的MiSeq。在此,生物通小编将对这三款测序仪的性能参数进行比较,主要是通量、读长、质量和费用。
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荷兰鹿特丹Erasmus大学利用NimbelGen全外显子捕获3000个老年病样本进行后GWAS研究
罗氏NimbleGen和Caliper Life Sciences 于今年7月签订了一项协议联合开发并优化基于液相序列捕获技术(罗氏NimbleGen公司)的自动化平台Sciclone NGS工作站(Caliper公司)。而最近位于荷兰鹿特丹的Erasmus大学医学中心内科基因实验室已经将这一平台运用到一项大规模的流行病研究项目,用于新一代测序实验前自动化捕获超过3000个样本的目标区域。
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高通量测序技术的发展趋势
生物通报道 在本期的《Genetic Engineering & Biotechnology News》杂志上,Harry Glorikian 和Brian Clancy盘点了他们认为值得关注的测序趋势,包括测序活动的两极化、流程价值的转变,以及临床和商业应用。