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罗氏454新升级,读长达1,000 bp[新品推荐]
生物通报道,罗氏旗下454生命科学昨日宣布推出了全新的GS FLX+系统。此仪器能够产生高达1,000 bp的测序读长,赶超了传统的毛细管电泳测序法。读长的改善也使得通量提升了近50%,达到1 Gb,从而降低了大型测序项目的测序成本。这种新的性能水平代表了生命科学行业的一个里程碑,让高通量测序技术首次带来了与Sanger法相当的准确性和读长。
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Life Tech推出取代芯片的RNA-Seq方案[新品推荐]
生物通报道,Life Technologies公司近日宣布,它推出了一个适用于Ion个人化操作基因组测序仪(PGM)的Ion Total RNA-Seq Kit。此试剂盒为转录本表达分析提供了一个快速、实惠且易用的方案,可取代芯片。
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Nature Methods综述RNA-seq的数据分析方法[创新技巧]
测序之后的数据分析才是真正的挑战。在RNA-seq之后,还需要一些强大的计算工具,才能绘制出完整的转录组图谱。在这一期的《Nature Methods》上,来自MIT和哈佛Broad研究院的研究人员发表了一篇综述,介绍了转录组注释和定量的计算方法。
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PacBio正式发售第三代测序仪[新品推荐]
生物通报道,第三代测序公司Pacific Biosciences上周宣布已开始正式发售PacBio RS系统。当天它发售了两台RS测序仪,一台是发往美国国家生化防卫分析与对策中心(NBACC),另一台是发往冷泉港实验室。
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三种靶向序列捕获策略的比较[选购宝典]
为了评估靶向富集方法在ABI SOLiD 3系统上表现如何,来自迈阿密大学米勒医学院以及Life Technologies的研究人员评估了三种富集技术:罗氏NimbleGen的SeqCap寡核苷酸杂交型芯片捕获,安捷伦的SureSelect寡核苷酸杂交溶液型捕获以及Raindance的多重PCR方法。文章发表在4月29日的《PloS ONE》杂志上。
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Life Tech推出新型样品制备系统 简化测序流程[新品推荐]
为简化测序的样品制备过程,Life Technologies近日宣布推出了Ion OneTouch System,一个自动化的样品制备系统,适用于去年底推出的Ion PGM测序仪。此系统降低了样品制备的复杂度,将手工操作时间减少至5分钟。
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SMART技术给力新一代测序[新品推荐]
很多公司都为新一代测序的文库制备推出了新产品,Clontech也是其中的一个。它利用其招牌的SMART技术,推出了一款试剂盒——SMARTer Ultra Low RNA Kit for Illumina Sequencing。此款试剂盒是与Illumina公司共同开发的,它为生成与Illumina测序仪兼容的总RNA文库提供了一个简单高效的方案。
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新一代测序找到多发性骨髓瘤的关键基因[创新技巧]
在迄今为止最大型的多发性骨髓瘤基因组学研究中,来自美国多发性骨髓瘤研究基金会(MMRF)的研究人员利用Illumina新一代测序鉴定出一些对疾病很关键的新基因和新机制,为临床治疗提供了新的靶点。文章发表在近期的《Nature》杂志上。
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陈竺外显子组测序发现白血病关键突变[创新技巧]
随着更多新一代测序仪的上市,特别是个人化测序仪(如Illumina的MiSeq,ABI的PGM和罗氏454的GS Junior)的上市,测序费用越来越低,再加上序列捕获产品也越来越丰富,使得外显子组测序的门槛越来越低。于是,过去无法开展的多种疾病中关键基因或关键突变的鉴定也成为可能。新一代测序让我们更快找到关键突变,也能更快发表高质量的文章。
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Illumina推出外显子组捕获产品[新品推荐]
为了让研究人员更轻松更经济地利用定向外显子组测序,Illumina提供了TruSeq Exome Enrichment Kit,一种溶液型的序列捕获方法,利用杂交选择分离出人类基因组中的目的外显子区域。有了TruSeq试剂盒,您能够在任何Illumina测序仪上以高通量测序系统检测常见和稀有变异,且每个样品的费用较低。