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整合多组学、机器学习与基因组规模建模推断代谢调控的路线图
机器学习和基因组规模代谢建模(genome-scale metabolic modeling, GEM)加速了模式微生物和哺乳动物细胞中代谢调控关系的发现。本综述提供了一条整合组学数据与计算方法研究系统水平转录调控、翻译后修饰(post-translation
来源:npj Metabolic Health and Disease
时间:2026-11-03
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SWI/SNF染色质重塑复合物在代谢性疾病中的组织特异性表观遗传机制与治疗靶向
代谢性疾病(metabolic disorders)日益被认为与表观遗传改变(epigenetic alterations)相关。SWI/SNF染色质重塑复合物(SWI/SNF chromatin remodeling complexes)已成为代谢稳态(me
来源:npj Metabolic Health and Disease
时间:2026-11-03
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婴儿来源两歧双歧杆菌PNGaseA家族酶偏好N-糖肽的结构基础与β-片层托举构象机制
N-糖链(N-glycan)是肠道菌可利用的重要营养来源,细菌通过肽:N-糖苷酶(PNGase)将其从糖蛋白上释放。母乳富含N-糖基化活性蛋白,可被婴儿结肠微生物利用。研究人员对婴儿相关两歧双歧杆菌(Bifidobacterium bifidum)LMG131
来源:Nature Communications
时间:2026-11-03
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共生藻驱动的组织分区微生物组重塑增强刺胞动物全生物氮同化与必需氨基酸生物合成
微生物组(microbiomes)是刺胞动物全生物(cnidarian holobionts)功能与韧性的重要组成部分,但微生物群落(microbial communities)在宿主组织内的空间与功能整合仍知之甚少。该研究显示,与光合甲藻(photosynt
来源:Nature Communications
时间:2026-11-03
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产甲烷古菌差异性诱导TLR8依赖性信号通路调控NF-κB p65与STAT1/2介导的基因类别表达
古菌在人类肠道中普遍存在,但缺乏经典的细菌细胞壁相关免疫配体。对人外周血单个核细胞(PBMCs)进行时间分辨RNA测序(RNA-seq)显示,Methanosphaera stadtmanae和Methanobrevibacter smithii诱导了共享的免
来源:Nature Communications
时间:2026-11-03
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GlioTrace:基于全标本共聚焦成像与协变量隐马尔可夫建模的患者来源胶质母细胞瘤脑切片单细胞侵袭时空动态重建
胶质母细胞瘤(GBM)向健康脑组织的侵袭仍是有效治疗的主要障碍,但该过程背后的动态单细胞行为在患者模型间仍难以测量。在此,研究人员介绍GlioTrace,一种用于在患者来源异种移植(PDX)脑切片中实时追踪GBM侵袭的离体成像与计算框架。通过将全标本共聚焦显微
来源:Nature Communications
时间:2026-11-03
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PrinTE:研究转座元件驱动基因组扩张与收缩的正向模拟框架
基因组扩张与收缩由转座元件(transposable elements, TEs)活性驱动,但由于缺乏追踪这些变化的历史记录,其潜在动力学仍不清楚。在此,研究人员提出PrinTE,这是一种具有可定制转座子动力学、用于识别与观测基因组最一致的进化参数的全基因组序
来源:Nature Communications
时间:2026-11-03
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全球禽流感研究中的广泛测序错误证据:对Wannigama等人(2025)数据的系统性质疑
Wannigama等人(2025)提出了一项研究,评估了来自采样不足国家的鸟粪样本中是否存在禽流感病毒。样本采集自非洲(马达加斯加、莫桑比克、索马里),中东(也门),南亚(马尔代夫、斯里兰卡),东南亚(印度尼西亚、缅甸、菲律宾)以及大洋洲(巴布亚新几内亚)。该
来源:Nature Communications
时间:2026-11-03
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民族主义框架削弱公众对基于身份仇恨犯罪的谴责
摘要
人们对仇恨犯罪的看法可能是可改变的,因为这些行为是根据受害者不同的社会身份来理解的。我们研究了当仇恨犯罪的框架围绕受害者的民族身份而非宗教身份时,是否会引起不同的反应。首先,我们记录了媒体对仇恨犯罪的报道
来源:PNAS Nexus
时间:2026-11-03
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Midkine通过NOTCH2/HES1与PI3K/AKT通路驱动肺癌脑转移及其作为预后生物标志物的价值
背景/目的:Midkine(MDK),一种肝素结合生长因子,在肺癌(LC)细胞中常过表达。本研究旨在通过蛋白质组学、功能学及体内分析,探究MDK在肺癌及肺癌脑转移(LCBM)中的作用。
方法:研究人员对五对配对的原发性LC与LCBM样本进行了蛋白质组学分析。随
来源:Cancer Biomarkers
时间:2026-11-03