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MAGE:一种识别最大年龄指数基因集的高效算法
衰老以组织特异性和时间特异性的方式改变转录调控,重塑基因调控网络并改变调控影响的动态。传统的计算机模拟影响最大化方法通常依赖静态基因表达快照,无法捕捉基因间影响随时间的变化。为解决这一问题,研究人员引入了年龄指数(Age Index),一种基于网络的度量指标,
来源:Briefings in Bioinformatics
时间:2026-11-03
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结构引导竞争分配框架IsoPrism实现短读转录组异构体使用预测
短读(SR)单细胞与空间转录组学可表征基因表达,但对基因内异构体使用的解析分辨率有限。研究人员提出IsoPrism,一种结构引导的竞争分配框架,可从基因水平表达预测异构体比例。IsoPrism将个体表达与局部表达上下文同转录本结构注释相结合,采用共享迭代更新以
来源:Briefings in Bioinformatics
时间:2026-11-03
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终身应激暴露与动态社会互动中信任形成和社会学习的改变
尽管信任是社会互动的基石,但终身应激源暴露如何影响信任背后的认知过程仍知之甚少。本研究采用应激与逆境量表(Stress and Adversity Inventory,STRAIN)评估累积终身应激源暴露,并结合重复信任博弈的改编版本与计算建模(层次高斯滤波,
来源:Proceedings of the National Academy of Sciences
时间:2026-11-03
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基于对寨卡病毒基因组在受限与未受限环境中RNA折叠行为的分子动力学模拟与邻近连接实验数据整合分析,揭示空间限制重塑RNA三维结构并促进基因组环化的物理机制
许多RNA分子在受限环境中发挥功能,但空间限制对RNA折叠的影响仍知之甚少。邻近连接实验揭示了受限与未受限状态下长程接触的改变,然而这些实验并不能解释空间约束如何导致这些差异。本研究开发了一种物理建模方法,将邻近连接数据整合到粗粒化分子动力学模拟中,以重建受限
来源:Proceedings of the National Academy of Sciences
时间:2026-11-03
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向日葵RLK/Pelle激酶基因组邻域的转座元件关联特征解析
植物RLK/Pelle家族是最大的激酶类群之一,包含发育、环境信号传导和胁迫响应的关键调控因子。转座元件(transposable elements, TEs)同样塑造植物基因组结构并可促成调控变异,然而在大型、重复序列丰富的作物基因组中,RLK/Pelle位
来源:Stresses
时间:2026-11-03
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N-乙酰氨基葡萄糖补充通过重编程*Actinokineospora bangkokensis* 44EHWT代谢增强抗炭疽病活性化合物的多组学解析
放线菌门(Actinomycetota)长期被视为抗生素的重要产生菌。炭疽病由*Colletotrichum*属真菌(尤以*C. gloeosporioides*为主)引起,是一种广泛且严重的采后病害,在全球作物生产中造成重大经济损失,热带和亚热带地区尤为突出
来源:Current Research in Microbial Sciences
时间:2026-11-03
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血红蛋白质量作为一氧化碳中毒个体易感性决定因素的研究
背景:据估计,2021年全球约有28,900例死亡归因于一氧化碳(CO)意外中毒。吸入后,CO与血红蛋白结合的亲和力比氧气高220–240倍,形成碳氧血红蛋白(COHb)。虽然已知CO暴露的组成因素决定血液中CO的摄取,但对于给定CO刺激下个体反应差异的了解甚
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冬虫夏草(Ophiocordyceps sinensis)原基形成过程的定量磷酸化蛋白质组学分析:揭示调控原基发生的磷酸化蛋白质与Ste7–Fus3信号模块
论文摘要翻译
本研究首次对冬虫夏草(Ophiocordyceps sinensis)从僵虫(ST)到原基(PR)转变过程中的磷酸化蛋白质组进行了4D无标记定量分析。研究人员共鉴定出8,417条独特肽段,其中5,851条为磷酸化肽段,对应6,359个磷酸化位点。
来源:Current Research in Microbial Sciences
时间:2026-11-03
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脱落酸响应转录因子SmMYB32正向调控丹参酮生物合成的分子机制
丹参酮是一类主要在丹参根中生物合成的天然产物,其积累可被脱落酸处理促进,然而其潜在调控机制仍不明确。本研究从ABA诱导的转录组中鉴定出一个ABA响应的R2R3-MYB转录因子SmMYB32。过表达SmMYB32通过上调丹参酮生物合成基因SmCYP76AH3和S
来源:Horticulture Research
时间:2026-11-03
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慢病毒载体转导细胞系生物安全等级降级评估的稳健RT-PCR检测方案
专业术语翻译摘要
慢病毒(Lentiviruses)是RNA逆转录病毒(RNA retroviruses)的一个亚家族,能够将其遗传信息稳定整合至宿主基因组中。使用经过安全工程改造的复制缺陷型慢病毒载体(replication-incompetent lent
来源:Methods and Protocols
时间:2026-11-03