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基于CT的病灶基础模型用于肝细胞癌侵袭性无创评估及复发风险预测
肝细胞癌(HCC)仍是全球癌症相关死亡的主要原因之一,根治性切除术后复发率高。对肿瘤侵袭性和复发风险进行准确的无创评估对手术决策和术后监测至关重要,但传统影像学方法仍面临挑战。本研究构建了一个CT病灶基础模型(LFM),通过自监督学习在32 120个通用病灶和
来源:Advanced Science
时间:2026-11-02
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LoGIC:跨物种局部基因簇整合目录
同源基因,尤其是那些位于相近基因组位置并形成基因簇的基因,常具有补偿性作用,因此对这些基因的功能及相互关系的解析构成显著挑战。一个整合多模态信息的局部同源基因簇综合数据库将极大促进此类研究。本研究构建了LoGIC(https://omicslab.geneti
来源:Nucleic Acids Research
时间:2026-11-02
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乙酰化黏连蛋白的区域特异性生成与保留塑造了姐妹染色单体黏连的全基因组模式
姐妹染色单体黏连依赖于ESCO2介导的黏连蛋白(cohesin)亚基SMC3乙酰化,然而该修饰如何在基因组范围内建立与维持仍知之甚少。本研究通过定量染色质免疫沉淀测序(ChIP-seq)分析同步进入S期的人源细胞的染色质结合动态,检测了ESCO2的染色质结合动
来源:Nucleic Acids Research
时间:2026-11-02
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Integrator复合物在转录偶联修复后移除损伤滞留的RNA聚合酶II以促进转录重启
RNA聚合酶II(Pol II)介导的基因转录对转录阻断性DNA损伤(TBLs)高度敏感,若未及时解除,将诱发转录应激,进而导致细胞衰退与衰老。TBLs由转录偶联核苷酸切除修复(TC-NER)途径清除。TC-NER由科凯恩综合征B组蛋白(CSB)识别损伤滞留的
来源:Nucleic Acids Research
时间:2026-11-02
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Queuosine修饰依赖性组氨酰tRNA片段以细胞类型依赖方式促进细胞增殖
tRNA片段(tRFs)是由内源性核糖核酸酶切割tRNA产生的天然小非编码RNA。tRFs在包括细胞增殖调控在内的多种生物学通路中发挥作用。特定的tRNA修饰影响tRF的生物发生。Queuosine(Q)修饰发生于4种哺乳动物tRNA的反密码子摆动位核苷酸,并
来源:Nucleic Acids Research
时间:2026-11-02
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面向机器学习时代的SAbDab2:结构化抗体数据库及其标准化可版本化训练/测试数据划分
结构抗体数据库(SAbDab)是自2013年起发布的实验解析抗体结构公共存储库。2021年显式引入单域抗体支持(SAbDab-nano)。近年来抗体研究热度上升与新抗体形式不断出现,同时机器学习(ML)对标准化、高质量结构数据的需求显著增加。研究人员提出SAb
来源:Nucleic Acids Research
时间:2026-11-02
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胸腺T细胞谱系定向、气道黏膜纤毛清除调控及衰老相关CD4细胞毒性T细胞功能多样性——免疫学前沿机制研究综述
本期内容涉及以下免疫学前沿进展:关于胸腺中T细胞谱系定向的新见解。近端TCR信号与T细胞谱系定向的转录调控之间的联系正通过多种新型实验方法逐步揭示。在本特邀综述中,Ichiro Taniuchi概述了早期胸腺祖细胞向胸腺的募集以及DN2a至DN2b阶段T细胞谱
来源:International Immunology
时间:2026-11-02
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妊娠期糖尿病母婴配对共享代谢组学特征及其对早期代谢编程的启示
妊娠是代谢编程的关键窗口期,在此期间不良的宫内暴露可能影响长期健康。妊娠期糖尿病(GDM)改变宫内环境,但其在早期代谢编程中的作用仍知之甚少。因此,本研究旨在识别母婴配对中的共享代谢组学特征,并评估GDM是否修饰该特征。为此,研究人员开展了一项横断面研究,纳入
来源:International Journal of Molecular Sciences
时间:2026-11-02
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PROTAC-DB 4.0:靶向蛋白降解模式扩展知识库与人工智能驱动的知识发现
蛋白水解靶向嵌合体(proteolysis-targeting chimeras, PROTACs)是一种新兴的治疗模式,利用泛素-蛋白酶体系统诱导靶向蛋白降解(targeted protein degradation, TPD)。其事件驱动和催化机制为靶向以
来源:Nucleic Acids Research
时间:2026-11-02
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基于SCOBY发酵的红白鹅莓汁理化、酚类与挥发性重塑及其抗氧化、酶抑制、HepG2细胞生长抑制和感官特性的基质与碳源依赖性研究
共生菌酵母发酵(SCOBY)可改变果汁基饮料的植物化学组成与生物学特性,但此类变化可能因发酵基质而异。本研究考察了采用共生菌酵母发酵剂(SCOBY)进行为期10天的红茶菌发酵对补充蔗糖或荞麦蜂蜜的红、白鹅莓(Ribes uva-crispa)汁的影响。评估了理
来源:International Journal of Molecular Sciences
时间:2026-11-02