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  • 儿童癌症基因组学与遗传易感性研究进展:从分子诊断到精准治疗

    这篇综述系统阐述了儿童癌症基因组学(NGS)与遗传易感性研究的最新进展,涵盖DNA/RNA测序技术(RNA-seq)、功能基因组学(CRISPR编辑)和液体活检等前沿方法在诊断、预后和靶向治疗中的应用,特别强调了基因融合(gene fusion)、表观遗传驱动因子和复杂结构变异(CGRs)的临床价值,为儿童癌症的精准医疗提供了重要理论依据。

    来源:Annual Review of Genomics and Human Genetics

    时间:2025-09-09

  • 综述:CRISPR激活技术在植物抗病育种中新型基因的鉴定与应用

    这篇综述系统阐述了CRISPR激活(CRISPRa)技术如何通过精准上调内源基因表达来增强植物抗病性,重点探讨了其与功能基因组学(GWAS、多组学)的协同应用、可编程转录激活因子(PTAs)的优化策略,以及实现非转基因过表达的潜力,为作物抗病育种提供了创新范式。

    来源:Frontiers in Genome Editing

    时间:2025-09-09

  • 呼吸道微病毒科噬菌体遗传多样性揭示人体呼吸生态系统病毒组学新维度

    本研究通过宏基因组测序从健康人群鼻咽拭子中鉴定出327个微病毒科(Microviridae)相关重叠群,包括15个近完整基因组,首次系统揭示了该科噬菌体在呼吸道的遗传多样性。研究采用VP1(主要衣壳蛋白)系统发育分析将基因组划分为7个新群,CRISPR间隔序列预测宿主为普雷沃菌(Prevotella)等。这些基因组(5,000-6,484 nt)与已知微病毒科成员VP1相似性<46.73%,提示可能存在新属,为呼吸道疾病干预提供新靶点。

    来源:Frontiers in Cellular and Infection Microbiology

    时间:2025-09-09

  • 葫芦科作物致病尖孢镰刀菌中ECC1效应蛋白同源基因调控宿主特异性毒力的分子机制

    这篇研究揭示了尖孢镰刀菌(Fusarium oxysporum, Fo)中ECC1效应蛋白家族通过基因复制和功能分化调控宿主特异性的新机制。通过CRISPR/Cas9基因编辑和表达谱分析,发现ECC1aFom和ECC1b分别促进甜瓜和黄瓜感染,而ECC1aFom在黄瓜中触发非寄主抗性(avr基因功能)。结构预测显示ECC1具有ToxA-like效应蛋白特征,其早期感染阶段表达峰值(4 dpi)暗示其在宿主定殖中的关键作用。该研究为理解病原菌宿主适应性进化提供了分子靶点。

    来源:Frontiers in Cellular and Infection Microbiology

    时间:2025-09-09

  • CRISPR/Cas9编辑大豆赤霉素受体基因GmGID1-2显著提升产量与共生固氮效率

    本研究通过CRISPR/Cas9技术敲除大豆赤霉素受体基因GmGID1-2,创制了具有半矮化、茎秆粗壮、分枝增多等优良农艺性状的新种质。该突变体通过调控DELLA蛋白积累,同步实现了产量提升17.16%、籽粒含油量增加1.64%以及根瘤固氮能力增强20.96%的突破性进展,为豆科作物可持续育种提供了关键靶点。

    来源:Journal of Integrative Plant Biology

    时间:2025-09-09

  • 金黄色葡萄球菌中可编程无选择压力CRISPRi系统的开发及其在宿主长期互作研究中的应用

    本研究针对传统CRISPR干扰(CRISPRi)系统在细菌基因功能研究中依赖抗生素选择和诱导剂的局限性,开发了一种基于pCM29质粒的可编程无选择压力CRISPRi(ppsf-CRISPRi)系统。该系统利用金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)内源启动子调控dCas9表达,通过靶向沉默凝固酶(coa)和自溶素(atl)基因,在无需外源诱导和抗生素压力下实现≥27代的稳定基因沉默。研究证实该系统在体外血浆凝固实验、THP-1巨噬细胞感染和蜡螟(Galleria mellonella)感染模型中均能有效模拟基因敲除表型,为长期宿主-病原体互作研究提供了新工具。

    来源:iScience

    时间:2025-09-09

  • 基于PafA介导邻近标记的APPLE-MS技术:高灵敏度解析弱相互作用及膜蛋白互作网络的新方法

    针对传统亲和纯化-质谱(AP-MS)在检测弱/瞬时相互作用及膜蛋白互作(PPI)的局限性,Luo等开发了结合Twin-Strep标签富集与PafA介导邻近标记的APPLE-MS技术。该方法灵敏度提升4.07倍,成功揭示SARS-CoV-2 ORF9B动态互作组和PIN1内源性互作网络,为病毒-宿主互作研究和药物靶点发现提供新工具。

    来源:Cell Reports Methods

    时间:2025-09-09

  • 小麦抗病性挑战与全球策略:从基因编辑到精准表型平台的可持续解决方案

    这篇综述系统阐述了小麦抗病育种面临的病原菌进化、杀菌剂抗性及品种更替等核心挑战,提出了整合多基因抗性(APR)、基因组选择(GS)和CRISPR-Cas9基因编辑等全球策略,强调通过精准表型平台(PPP)和移动病原诊断系统(MARPLE)实现抗病品种的快速部署,为保障全球小麦安全提供科学路径。

    来源:Annual Review of Phytopathology

    时间:2025-09-09

  • 植物细菌病害中的易感基因:从分子机制到抗病育种应用

    这篇综述系统阐述了植物易感基因(S genes)在细菌病害中的关键作用,包括其被病原菌效应因子(如TALEs)利用的分子机制、功能多样性(如SWEET糖转运蛋白家族、转录因子等),以及通过基因编辑(CRISPR-Cas)、表观遗传调控和天然等位基因挖掘实现抗病育种的应用前景。文章强调了S基因研究对理解植物-病原互作界面和开发持久抗性策略的双重意义。

    来源:Annual Review of Phytopathology

    时间:2025-09-09

  • CRISPRi与Tn-seq联合解析艰难梭菌必需基因谱:抗生素靶点发现与细胞分裂机制新见解

    这篇研究通过CRISPR干扰(CRISPRi)和转座子插入测序(Tn-seq)技术,系统鉴定了艰难梭菌(Clostridioides difficile)R20291菌株的346个必需基因,其中283个与既往研究重叠形成"核心必需基因组"。研究验证了>90%靶基因的必需性,发现80%基因敲低导致形态异常,并首次鉴定18个定位于分裂位点的新蛋白(如YlmG/YlxW/YlxX),为开发窄谱抗生素和解析该病原体独特分裂机制提供了关键靶点与工具。

    来源:Journal of Bacteriology

    时间:2025-09-09


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