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  • 链霉菌基因组编辑新利器:基于TnpB的STAGE工具包开发与应用

    来自国内的研究人员针对链霉菌(Streptomyces)基因编辑工具匮乏的现状,开发了基于ISDra2转座酶(TnpB)的STAGE基因组编辑平台。该工具包克服了传统CRISPR系统蛋白尺寸大、细胞毒性强等缺陷,实现了效率超75%的C·G-to-T·A碱基编辑(STAGE-cBEST/McBEST),经AI优化后编辑效率接近100%,为链霉菌合成生物学研究提供了精准高效的遗传操作工具。

    来源:Proceedings of the National Academy of Sciences

    时间:2025-08-27

  • 弓形虫PPM3H磷酸酶调控寄生虫毒力并调节宿主免疫炎症反应的作用机制研究

    本研究针对弓形虫(Toxoplasma gondii)毒力因子PPM3H磷酸酶的生物学功能展开深入探索。研究人员通过CRISPR/Cas9基因编辑技术构建了ppm3h基因敲除(RH-PPM3H-KO)和替换(PRU-PPM3H-R)的弓形虫株系,结合小鼠感染模型和转录组分析发现:PPM3H通过上调宿主Cx3cl1、Ccl22等趋化因子表达,激活Jak-STAT和Th17等免疫通路,诱导过度的炎症反应导致免疫病理损伤,从而增强寄生虫毒力。该研究发表于《Veterinary Research》,首次揭示了PP2C家族磷酸酶通过"促炎"而非传统"免疫逃逸"机制调控弓形虫致病性的新范式。

    来源:Veterinary Research

    时间:2025-08-27

  • 线粒体氧化磷酸化与嘧啶合成通路调控蛋白激酶A活性的全基因组RNAi筛选研究

    本研究通过构建活体PKA(蛋白激酶A)荧光传感器,在秀丽隐杆线虫肠道中开展全基因组RNAi筛选,首次系统鉴定了肠道PKA活性的自主与非自主调控网络。研究发现抑制线粒体OXPHOS(氧化磷酸化)通路和嘧啶合成途径可显著激活PKA,后者通过不依赖cAMP的新机制发挥作用。该成果为代谢性疾病和癌症等PKA相关疾病的治疗提供了新靶点,发表于《Communications Biology》。

    来源:Communications Biology

    时间:2025-08-27

  • 综述:用于传染病诊断的即时生物传感器:最新进展与前景

    快速、精准、便携的POC生物传感器在感染性疾病诊断中展现出重要应用价值。本文系统综述了电化学、光学和压电三类传感器的工作原理、检测机制及临床应用案例,包括COVID-19、HIV、疟疾等疾病的快速检测技术,并分析了纳米材料、CRISPR/Cas系统等创新技术对灵敏度提升的促进作用。当前挑战集中于多指标集成检测、环境稳定性及临床转化,未来需加强数字健康整合和材料创新。

    来源:RSC Advances

    时间:2025-08-27

  • Systema框架:超越系统性变异评估遗传扰动响应预测的新范式

    本研究针对功能基因组学中遗传扰动转录响应预测的挑战,开发了Systema评估框架。研究人员发现现有方法易受系统性变异(systematic variation)干扰,导致预测性能被高估。通过量化10个数据集中的系统性变异,团队揭示了标准评估指标(PearsonΔ、PearsonΔ20)的局限性,并提出以扰动特异性效应为核心的新评估策略。该研究为区分真实生物学效应与技术偏差提供了重要工具,对基因功能解析和药物开发具有方法论意义。

    来源:Nature Biotechnology

    时间:2025-08-26

  • 结直肠癌表观遗传图谱解析与功能性变异CRISPRi筛选揭示致癌新机制

    来自Lu团队的研究人员通过整合533例结直肠组织多组学数据,构建了从正常黏膜到晚期腺瘤直至癌变的动态表观遗传图谱,鉴定出7,492个差异顺式调控元件(CREs)。采用高通量CRISPR干扰(CRISPRi)筛选技术发现265个调控结直肠癌(CRC)细胞增殖的功能性CREs,并基于此开发了可预测癌前病变和CRC风险的多元遗传风险评分(PRS)。特别揭示了功能性变异rs10871066通过FOXP1/TCF7L2介导的沉默子-增强子转换机制,远程激活KLF5致癌通路并抑制PIBF1依赖的NK细胞毒性,为CRC防治提供新靶点。

    来源:Nature Cancer

    时间:2025-08-26

  • 基于组合式人源转录激活域的高效CRISPR基因激活系统开发与优化

    本研究针对CRISPR激活系统中病毒来源转录激活域(TADs)潜在的免疫原性问题,通过系统比较人源TADs(hTADs)的激活效能,开发出NFZ-p65HSF1(NP)等组合式hTADs。这些新型激活域在dCas9/dCasMINI系统中展现出与经典病毒TAD-VPR相当的基因激活效率,同时具有更小的分子尺寸和更低的预测免疫原性,为基因治疗和合成生物学提供了更安全的工具。

    来源:Protein & Cell

    时间:2025-08-26

  • 非洲猪瘟病毒A179L通过降解IFITM1抑制NF-κB信号通路的机制研究

    本研究揭示了非洲猪瘟病毒(ASFV)免疫逃逸的新机制:其编码蛋白A179L通过靶向干扰素诱导跨膜蛋白1(IFITM1)并促进E3泛素连接酶MARCH8介导的K48泛素化降解,从而抑制NF-κB信号通路激活。研究人员利用酵母双杂交、CRISPR-Cas9基因敲除和重组病毒构建等技术,首次发现IFITM1通过结合IKKβ促进其磷酸化以激活NF-κB,而A179L通过破坏该过程抑制炎症因子产生。该成果发表于《Cell Communication and Signaling》,为ASFV免疫调控机制提供了新靶点。

    来源:Cell Communication and Signaling

    时间:2025-08-26

  • 多顺式调控模块协同确保Tup/Islet1在果蝇背肌身份决定中的稳健功能

    本研究针对果蝇肌肉发育中关键转录因子Tup/Islet1的调控机制,通过CRISPR-Cas9基因编辑和转录分析技术,首次揭示三个顺式调控模块(CRMs)通过时空接力方式精确调控tup表达的模式。研究发现tupF4、tupADME和tupHDME三个增强子分别负责启动、维持和放大tup在背肌中的表达,其中后两者通过Tup自调控机制实现功能冗余,确保肌肉形态正确发育。该成果发表于《Skeletal Muscle》,为理解多增强子协同调控发育关键基因提供了新模式。

    来源:Skeletal Muscle

    时间:2025-08-26

  • Syndecan-2通过增强Wnt/β-catenin信号通路促进三阴性乳腺癌侵袭性的机制研究

    本研究揭示了跨膜蛋白聚糖Syndecan-2(SDC2)在乳腺癌中作为Wnt/β-catenin信号通路正向调控因子的关键作用。通过CRISPR/Cas9基因编辑和报告基因实验,证实SDC2能显著增强HEK293T和BT-20三阴性乳腺癌(TNBC)细胞对Wnt3a的敏感性,其缺失会降低β-catenin转录活性。该发现为靶向SDC2-Wnt/β-catenin轴治疗乳腺癌提供了新思路。

    来源:The International Journal of Biochemistry & Cell Biology

    时间:2025-08-26


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