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  • 综述:Komagataella phaffii:一种用于生产高附加值化学品的多功能平台

    Komagataella phaffii作为合成生物学研究的热点,因其GRAS认证、高效表达系统及代谢多样性成为高附加值化学品(有机酸、脂肪酸、萜类等)生物合成的理想底盘。本文系统综述了CRISPR/Cas9等基因编辑工具的优化进展,代谢通路重构策略及多组学数据驱动的系统生物学方法。通过整合转录调控元件、优化前体供应及能量代谢平衡,显著提升了目标产物的产量。未来需突破宿主代谢兼容性、多基因协同表达及毒性代谢物调控等瓶颈,构建全基因组数字模型以指导合成生物学设计。

    来源:Green Carbon

    时间:2025-12-24

  • Try和Amy在青鳉(Oryzias latipes)的摄食、消化、生长和发育中的作用:来自比较基因敲除研究的见解

    胰蛋白酶基因敲除导致斑马鱼幼虫消化能力下降、肠道发育异常及成体生长代谢障碍,证实胰蛋白酶对幼虫发育至关重要。

    来源:Journal of Zhejiang University-SCIENCE B

    时间:2025-12-23

  • 综述:tRNA作为噬菌体防御中的毒素靶标,同时也是针对感染失败(abortive infection)进行反击的重点

    噬菌体防御中细菌tRNA修饰毒素的机制及反制策略研究,涵盖磷酸化、核苷酰化、切割等作用模式,以及特异性识别基序和抗性tRNA的进化策略。重点解析FaRel2、MenT、AriB等毒素的分子作用靶点,如接受茎核苷酸组成、变体环长度及反密码子茎结构,并探讨噬菌体通过自身tRNA、修复酶及抗毒素RNA模拟物等反制手段。研究揭示宿主-病原体在tRNA代谢层面的动态博弈,为靶向翻译的抗病毒治疗提供新方向。

    来源:Current Opinion in Microbiology

    时间:2025-12-23

  • 一种简单的方法,可以高效地在植物中产生结构变异

    本研究利用拓扑异构酶Ⅱ抑制剂依托泊苷诱导拟南芥遗传变异,发现其能高效产生缺失、倒位等结构变异,导致半显性矮化、隐性矮化和花色异常等表型。通过短读和长读测序验证,共鉴定27种结构变异,其中1.52 Mb倒位影响AS1基因表达,37 bp缺失导致IMMUTANS基因 frameshift突变。该方法相比辐射诱导更简便,适用于多种植物,且突变率高于传统辐射诱变。

    来源:PLOS Genetics

    时间:2025-12-23

  • 全球变暖背景下蔬菜作物耐热性的分子机制与育种策略研究

    随着全球变暖加剧,蔬菜作物面临严峻的高温胁迫威胁,导致产量和品质下降。为解决此问题,研究人员系统综述了高温对蔬菜多生长阶段的影响,深入解析了HSFs、HSPs、Ca2+信号、ROS稳态及表观遗传调控等分子响应网络,并评估了从传统育种到CRISPR/Cas9基因组编辑等育种策略。该研究为培育气候智能型蔬菜品种提供了全面的理论框架和技术路线,对保障全球粮食安全具有重要意义。

    来源:Horticulture Research

    时间:2025-12-23

  • 通过无服务器云计算实现生物信息学领域高性能计算的民主化:以使用Crackling Cloud进行CRISPR-Cas9引导RNA设计为例

    基于AWS serverless架构开发了首个免费、可扩展的CRISPR-Cas9 gRNA设计工具,有效降低计算成本并提升处理速度,促进云技术在生物信息学中的应用。

    来源:PLOS Computational Biology

    时间:2025-12-23

  • 靶向丝氨酸蛋白酶TMPRSS2抑制鸡细胞和器官培养物中甲型流感病毒复制的研究

    本研究针对禽流感病毒(AIV)持续威胁动物福利和家禽业的问题,探讨了通过靶向宿主丝氨酸蛋白酶TMPRSS2来限制病毒复制的新策略。研究人员利用CRISPR/Cas9技术构建了TMPRSS2基因敲除(KO)的鸡DF-1细胞系,并结合气管器官培养(TOCs)和肺组织培养(LCs)模型,评估了蛋白酶抑制剂Camostat mesylate(CAM)对低致病性禽流感病毒(LPAIVs)H9N2和H6N8复制的抑制作用。结果表明,基因敲除和化学抑制均能显著降低病毒复制,并延长感染后器官培养物的纤毛活性和存活时间。这为开发针对禽流感的新型抗病毒疗法提供了重要理论依据,同时证实了鸡器官培养系统在药物评价中的应用价值。

    来源:Heliyon

    时间:2025-12-23

  • 利用单细胞CRISPR技术解析细胞生态系统

    单细胞CRISPR筛选技术通过整合sgRNA库与多组学平台,突破传统组学限制,实现基因功能的高通量分析。该技术已发展出Perturb-seq、CROP-seq等多种平台,支持表型选择、转录组及表观组分析,应用于疾病机制、免疫调控等领域。然而,技术瓶颈如sgRNA多态性低、脱靶效应及数据分析复杂性仍待解决,未来需结合空间分辨率、多组学整合及AI算法提升平台效率与应用广度。

    来源:Blood Science

    时间:2025-12-23

  • 细胞内耦合振荡器:合成生物学中复杂动态行为的设计与应用

    本研究针对合成生物学中实现复杂功能的需求,探索了将振荡器作为高级构建模块进行细胞内耦合的设计策略。研究人员通过计算建模,系统分析了不同耦合强度下(独立、弱/强耦合、深度耦合)振荡器系统的动态行为,预测了包括节拍现象、幅频调制、混沌及同步化等多种现象,并提出了基于振荡器的计算框架,为合成基因电路的可扩展设计提供了新范式。

    来源:Nature Communications

    时间:2025-12-22

  • TTBK2激酶结构域错义变异导致功能丧失与磷酸化受损的机制研究

    本研究针对TTBK2基因激酶结构域错义变异(L209F)的致病机制不明确问题,通过CRISPR/Cas9基因编辑技术构建细胞模型,发现该变异导致TTBK2蛋白稳定性降低、激酶活性受损(尤其对TDP-43磷酸化能力减弱),并引发细胞骨架稳定性异常及TGF-β信号通路紊乱。该研究为脊髓小脑共济失调11型(SCA11)的致病机制提供了新见解,强调了激酶结构域错义变异的潜在致病性。

    来源:Scientific Reports

    时间:2025-12-22


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