亮点：微生物群组装遵循层级框架，宿主来源的电子受体进行的栖息地过滤（habitat filtering）塑造了优势生态类群。饮食输入细化生态位可用性，优先效应（priority effects）稳定群落，微生物拮抗（microbial antagonism）调节对开放生态位的竞争。更高阶的生态因素凌驾于较低层级因素之上，控制微生物群组装。在没有重大生态系统破坏（如抗生素）的情况下，优先效应限制了微生物拮抗对成熟微生物群落的影响。改变饮食输入若破坏宿主来源电子受体的栖息地过滤，会改变优势分类群，但不会破坏内稳态，能维持稳定的、适应饮食的群落。宿主来源电子受体的栖息地过滤被破坏会导致内稳态紊乱。在这种情况下，若不解决宿主层面的变化，像益生元（饮食）或益生菌（微生物拮抗）这类低层级干预措施是不够的。
摘要：肠道微生物群（gut microbiota）在人类健康中起着至关重要的作用，然而其分类学复杂性、个体间变异性以及成年后对变化的抗性，给理解驱动其组成和功能变化的因素带来了挑战。在此，研究人员提出了一个控制肠道微生物群组装、稳定性和恢复力的生态因素层级体系。在这个层级体系的顶端是宿主来源电子受体的栖息地过滤，它决定了在不同肠道区域占主导地位的生态类群。宿主的饮食行为通过调节营养物质的可用性，塑造了这些生态类群内的生态位可用性。优先效应维持了分类学稳定性，而微生物拮抗则控制着对开放生态位的竞争。这个框架突出了宿主对微生物能量代谢的控制如何指导微生物群的自我组装，并维持肠道内稳态（gut homeostasis）。
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