MEN1通过调控CD44可变剪接诱导铁死亡抑制肺癌的新机制

时间:2026年1月3日
来源:Cancer Research

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本研究揭示了肿瘤抑制基因MEN1通过调控RNA聚合酶II(Pol II)延伸速率(涉及PAF1复合体及磷酸化状态p-Pol II Ser2/Ser5),影响CD44前体mRNA的可变剪接(AS),从而改变CD44变异体(如CD44v6)的表达水平,最终通过调节谷胱甘肽过氧化物酶4(GPX4)等关键蛋白介导铁死亡进程,为MEN1缺失型肺癌的治疗提供了新的靶点(CD44v6干扰肽)和策略(激活铁死亡)。

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MEN1调控脂质过氧化与铁死亡在肺癌细胞中的作用
研究团队发现,在肺癌细胞中,MEN1的表达水平与铁死亡的敏感性密切相关。利用短发夹RNA(shRNA)敲低或CRISPR/Cas9技术敲除(KO)MEN1基因后,负向调控铁死亡的关键蛋白GPX4的表达显著上调。相反,过表达MEN1(oeMEN1)则会降低GPX4的水平。功能实验表明,MEN1缺陷的肺癌细胞(如A549、NCI-H460)对铁死亡诱导剂(如erastin、RSL3)的敏感性降低,表现为活性氧(ROS)和脂质过氧化物的积累减少。而重新引入MEN1(rMEN1)可逆转这种表型。透射电镜观察进一步证实,MEN1缺失导致线粒体形态异常(如线粒体肿胀、嵴结构破坏),这与铁死亡的典型特征相符。非靶向代谢组学分析揭示,MEN1敲除细胞的代谢谱发生显著改变,特别是鞘脂代谢通路富集,提示MEN1通过调节代谢重编程影响铁死亡。
MEN1调控的铁死亡对抑制肺肿瘤生长和转移至关重要
体外功能实验显示,MEN1缺陷显著增强了NCI-H460细胞的增殖、迁移和侵袭能力。在免疫缺陷M-NSG小鼠体内构建的实验性肺转移模型中,尾静脉注射MEN1敲除的NCI-H460细胞后,肺部转移瘤的负荷、数量以及增殖标志物Ki67和转移相关蛋白HMGB1的表达均显著高于野生型(WT)细胞对照组。为了在自发肿瘤模型中验证,研究者构建了KrasG12D驱动、Sftpc-CreER介导的肺腺癌(LUAD)小鼠模型(KS),并进一步与Men1条件性敲除小鼠杂交获得KMS小鼠。结果显示,与KS小鼠相比,KMS小鼠的肿瘤负荷、肿瘤数量显著增加,生存期明显缩短。重要的是,KMS小鼠肺组织中脂质过氧化水平降低,而GPX4的表达升高,表明Men1的缺失通过抑制铁死亡加速了肿瘤进展。
MEN1对肺癌细胞铁死亡的调控依赖于CD44变异亚型
对KS和KMS小鼠肺组织进行RNA测序(RNA-seq)分析,发现Men1缺失导致细胞外基质(ECM)和细胞粘附分子相关通路基因显著富集。其中,CD44作为重要的细胞粘附分子,其变异剪接亚型(如CD44v3, CD44v6, CD44v9)在KMS小鼠的肺肿瘤组织中表达显著上调。临床样本分析表明,在人类肺癌组织中,CD44变异体(尤其是CD44v6和CD44v9)的mRNA和蛋白水平与GPX4表达呈正相关,且高CD44百分数剪接指数(PSI)与患者的不良预后相关。在细胞模型中,MEN1敲除促进了PMA诱导的CD44v6表达。功能挽救实验证实,敲低CD44v6(siV6)可以部分逆转MEN1缺失导致的GPX4上调、erastin诱导的脂质过氧化抑制以及细胞对铁死亡诱导剂的抵抗。这表明MEN1主要通过抑制CD44变异体的生成来维持铁死亡敏感性。
MEN1通过抑制RNA可变剪接阻止CD44变异体的产生
CD44基因包含多个恒定外显子和可变外显子(v1-v10)。RT-PCR和qPCR分析显示,在Men1全身性敲除(Men1Δ/Δ)小鼠的肺组织、KMS小鼠的肺肿瘤组织以及MEN1敲除的NCI-H460细胞中,多种CD44变异体(v3-v10)的mRNA和蛋白水平均显著升高。通过DRB(5,6-二氯苯并咪唑-1-β-D-呋喃核糖苷)释放实验评估转录延伸速率,发现MEN1缺失加快了RNA聚合酶II(Pol II)在CD44基因体上的延伸速度。剪接报告基因实验(pETCatEBLucv6)进一步证明,MEN1缺失促进了CD44可变外显子v6的包含。这些结果说明MEN1通过减缓Pol II的转录延伸,影响了CD44前体mRNA的剪接效率,从而抑制了变异体的产生。
Menin通过招募PAF1调控Pol II从CD44基因体的释放
机制探索表明,MEN1调控剪接的核心在于影响Pol II的暂停和释放。染色质免疫共沉淀(ChIP)实验显示,MEN1缺失导致Pol II(使用识别总Pol II的8WG16抗体和识别CTD的4H8抗体)在CD44基因启动子近端区域(如内含子1,i1)的富集减少,而磷酸化Pol II(Ser2,延伸标志)在基因体内部的富集增加。这表明MEN1缺失促进了Pol II从暂停状态向延伸状态的转变。进一步研究发现,PAF1(Pol II相关因子1)在这一过程中起关键作用。MEN1缺失增强了PAF1在CD44基因不同区域(包括启动子近端和可变外显子区域)的染色质结合。敲低PAF1(siPAF1)可以减缓MEN1缺失导致的Pol II快速延伸,并部分恢复CD44变异体pre-mRNA的生成。RNA免疫共沉淀(RIP)实验表明,MEN1缺失还影响了剪接因子如ESRP1和hnRNPLL在CD44可变外显子剪接位点的招募。综合来看,MEN1通过调控PAF1的招募,影响Pol II的磷酸化状态(Ser5暂停 vs Ser2延伸)和延伸速率,进而改变剪接因子的结合动力学,最终决定CD44可变外显子的包含与否。
CD44变异体-GPX4信号轴在肺癌中上调并与不良预后相关
对115例人类肺癌临床样本的分析显示,与癌旁正常组织相比,肿瘤组织中CD44多种变异体(v3, v5, v6, v9)和GPX4的mRNA及蛋白表达均显著上调。CD44v6的高表达与肿瘤分期、淋巴结转移等不良临床病理特征正相关。公共数据库(如TCGA)分析证实,GPX4高表达的LUAD患者总生存期(OS)和无复发生存期(RFS)更短。相反,MEN1在肺癌组织中的表达低于正常组织,且低MEN1表达结合高CD44 PSI预示着更差的预后。这提示MEN1-CD44变异体-铁死亡轴在肺癌发生发展中扮演重要角色。
CD44v6多肽通过重新激活铁死亡抑制已形成肺癌的生长和转移
最后,研究团队评估了靶向CD44v6的治疗潜力。在已形成原发性肺肿瘤的KS和KMS小鼠模型中,腹腔注射小鼠CD44v6干扰肽(mv6pep)或铁死亡诱导剂erastin,持续3周。结果显示,与对照肽(Ctrlpep)组相比,mv6pep和erastin治疗均能显著抑制肿瘤生长,表现为肺重、肿瘤负荷和数量的减少,以及Ki67阳性率的下降。更重要的是,mv6pep治疗显著增加了肺组织中的铁含量、脂质过氧化水平和4-羟基壬烯醛(4HNE)的表达,同时降低了GPX4的表达,表明铁死亡被重新激活。在实验性转移模型中,尾静脉注射人源CD44v6干扰肽(hv6pep)也能有效抑制MEN1敲除NCI-H460细胞在M-NSG小鼠体内形成的转移瘤,并伴随铁死亡标志物的变化。值得注意的是,CD44v6干扰肽对MEN1缺失的肿瘤表现出更强的抑制效果,提示其对MEN1缺陷型肺癌具有潜在的特异性治疗价值。
综上所述,本研究阐明了MEN1作为一个关键的肿瘤抑制因子,通过调控PAF1介导的Pol II延伸速率,影响CD44前体mRNA的可变剪接,从而控制CD44变异体的生成,并最终通过调节铁死亡通路抑制肺癌的进展。这为理解MEN1的肿瘤抑制功能提供了新的视角,并为治疗MEN1缺失的肺癌提供了新的靶点策略。

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