跨越三十载:人工智能如何引领生物技术新纪元,从基因组“读”到疾病“解”

时间:2026年3月19日
来源:Nature Biotechnology

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在过去的三十年里,基因组测序技术驱动了生物技术革命,积累了海量的生物学数据,但如何从这些复杂数据中提取可转化为临床或工业成果的洞见,仍是巨大挑战。本期《Nature Biotechnology》社论指出,人工智能(AI)正成为下一阶段生物技术发展的关键驱动力。它将帮助压缩生物复杂性,在靶点发现、蛋白质设计、衰老干预、气候生物技术等领域实现突破,旨在加速从数据到应用的转化,并更清晰地界定预测的边界。

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三十年前,当科学家们雄心勃勃地开始解读酵母和人类的全部遗传密码时,一场席卷整个生命科学的革命拉开了序幕。这不仅仅关乎技术,更关乎一个根本性的理念转变:如果能大规模“读取”生命的数据——DNA序列,我们或许就能学会“编写”和“改造”生命。随着测序成本以超越摩尔定律的速度骤降,从数亿美元降至数百美元,获取生命蓝图的副本变得前所未有的容易。一时间,仿佛治愈所有疾病的钥匙已然在手。
然而,现实很快给这股乐观情绪泼了一盆冷水。海量的基因组数据非但没有立即带来简单明了的答案,反而像打开了一个潘多拉魔盒,暴露了生命系统内部令人咋舌的复杂性。基因与基因之间、基因与环境之间,在细胞层面存在着难以计数的相互作用。读取基因组序列是相对“简单”的部分,而解读这些序列如何决定疾病风险、塑造个体表型,则充满了“噪音”和不确定性。生物技术领域随之面临一个核心困境:我们手握前所未有的数据宝藏,却难以将其有效地转化为可应用的成果,无论是精准的疾病疗法、高效的工业生物制造,还是对抗衰老的干预措施。
为了跨越从数据发现到实际应用之间的鸿沟,研究人员开始将目光投向一个新的强大工具:人工智能。在《Nature Biotechnology》创刊三十周年之际,一篇社论探讨了人工智能如何成为引领生物技术未来十年的关键力量。这篇文章并非报告一项具体的研究,而是基于三十年的行业观察,描绘了人工智能在解析生物复杂性、加速生物技术创新方面的潜力和方向。人工智能算法和基础模型能够处理高维度的组学数据或蛋白质序列,梳理出其中隐藏的功能关联。它们可以搜索人类无法想象的化学空间,在虚拟筛选、靶点发现、蛋白质结构预测与设计乃至实验设计等现代生物技术的早期关键环节大显身手。
这篇文章指出,人工智能并非能让所有生物学过程都变得可预测。它的核心价值在于,在预测可能的地方做出更清晰的预测,并明确指出哪些地方预测目前还不可行。这种区分至关重要,因为未来十年的生物技术突破,很可能就发生在生物学、计算科学和社会需求高度契合的这些特定领域。未来的生物技术将更少地由我们能生成多少数据及其分析来定义,而更多地取决于我们选择优先解决哪些问题。
当前,该领域正优先关注并密切追踪衰老研究领域。尽管存在一些夸大其词的说法,但目前针对衰老的干预措施仍处于初步阶段。长寿研究的下一个阶段将更侧重于优化健康寿命,而非追求戏剧性的寿命延长。人工智能可以整合基因组学、蛋白质组学和纵向健康数据,揭示其中的模式。随着靶向干预措施从模式生物推进到人类,更多关于人类生理机能以及如何对其进行修饰以改善健康的知识将被揭示。
气候和工业生物技术是未来几十年亟需扩展和优先发展的领域。与人类疗法相比,工程微生物、作物、酶和生物过程的优化、标准化和大规模部署面临的监管障碍更少。人工智能也将帮助寻找工程靶点和优化流程。在未来十年,生产材料、食品、燃料和化学品的过程应该更加可持续和资源高效。随着发现过程的加速,生产制造已成为一个限制步骤。人工智能既可以帮助设计更好的分子,也可以帮助实现制造过程的自动化。进展将来自可靠性、规模、成本和分销方面的进步,从而使细胞疗法、RNA药物和个性化药物能够抵达患者和市场。更简易的制造也将使生物技术更加触手可及。
拥抱人工智能用于科学研究是明智之举,但认清其局限性并正确使用它同样重要。随着人工智能产生更广泛的全球影响,清晰地传达其益处和局限性也变得更加重要。当前,有大量已发表的研究和新闻在讨论生物技术和公共健康的进展,但也有过剩的虚假信息需要甄别。与测序技术的益处类似——其全面影响花费了数十年才得以显现——人工智能的益处也很可能逐渐而非立即显现。该领域致力于准确报道这些科学进展,并坚信这些创新正是未来几十年社会所需要的。
主要技术方法
该文章为观点性社论,非原始研究论文,因此未涉及具体实验技术方法。其论述基于对过去三十年生物技术发展,特别是基因组测序革命和当前人工智能应用趋势的文献回顾与行业观察。文中引用了包括1996年酵母基因组完成、人类基因组计划数据共享政策,以及2016年《Nature Biotechnology》20周年社论等关键历史节点和信息作为论据支撑。
研究结果
  • 人工智能作为新驱动力:文章结论指出,驱动生物技术的动力已从过去的基因组测序革命,转变为未来十年的人工智能。AI被定位为压缩生物复杂性、将其转化为人类可理解形式的关键工具。
  • 人工智能的潜力和边界:研究发现,AI在虚拟筛选、靶点发现、蛋白质结构预测与设计、实验设计等早期研发环节具有显著潜力。然而,AI并不能使所有生物学变得可预测,其主要价值在于做出更清晰的预测,并识别出预测的边界。
  • 优先发展领域
    1. 1.
      衰老研究:下一阶段重点在于利用AI整合多组学数据,优化健康寿命,推动靶向干预从基础研究向临床应用转化。
    2. 2.
      气候与工业生物技术:该领域因监管壁垒相对较低而被视为应优先扩展。AI可用于优化工程微生物、酶和生物制造过程,以实现可持续生产。
    3. 3.
      生产制造:AI有助于自动化生产制造,解决生物疗法(如细胞疗法、RNA药物)在可靠性、规模、成本和分销方面的瓶颈,提升可及性。
  • 沟通与预期管理:研究强调,在AI时代,向公众清晰、准确地传达技术的益处和局限性至关重要,以应对信息过载和虚假新闻的挑战。AI带来的益处,如同当年的测序技术,将是一个逐步显现的过程。
结论与意义
这篇《Nature Biotechnology》三十周年社论系统梳理了生物技术从基因组时代向人工智能时代转型的必然性与核心挑战。其核心结论是,生物技术的范式正在发生根本性转变:从以数据生成和分析为中心,转向以人工智能为引擎、以解决特定优先问题为导向的新阶段。文章的意义在于为整个领域指明了未来十年的战略方向:人工智能并非万能钥匙,而是强大的“解耦”工具,它能帮助我们在海量数据中识别出可行动的路径,同时在气候、健康、生产等关键社会需求领域聚焦发力。这要求科研界、产业界和社会在拥抱技术潜力的同时,保持理性的预期,并加强负责任的科学传播,以确保生物技术的创新成果能够真正、有序地造福社会。最终,生物技术的成功将不仅取决于技术本身的突破,更取决于我们如何智慧地选择与运用这些技术。

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