来自Bacillus altitudinis JYY-02的两种新型脱乙酰酶的异源表达及其在几丁质和木聚糖酶法修饰中的应用

时间:2026年3月30日
来源:Carbohydrate Research

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酶催化脱乙酰化技术及新型生物催化剂开发研究。该研究从极端嗜热菌Bacillus altitudinis JYY-02中筛选出PdaA和COD两种CE4家族脱乙酰基酶,通过原核表达纯化后证实其高热稳定性(50℃处理1小时活性保留>90%),最佳催化条件分别为pH 5.0/30℃(PdaA)和pH 6.5/30℃(COD),对壳聚糖的脱乙酰化率达59.81-69.02%。与纤维素酶协同作用可使木聚糖水解率提升35-40%,为绿色生物制造提供了高效稳定的新型酶催化剂。

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Gengxian Zhou|Guicai Du|Hongzheng Tai|Lijiao Wang|Chao Wang|Ronggui Li|Qunqun Guo
青岛大学生命科学学院,中国青岛266071

摘要:

脱乙酰化可以将几丁质转化为具有更好性能的壳聚糖,并提高木聚糖的水解效率,从而扩展其在生物医学、农业和生物基材料中的应用。在本研究中,从Bacillus altitudinis JYY-02中筛选出两个新的脱乙酰酶基因,分别编码多糖脱乙酰酶(PdaA)和几丁质寡糖脱乙酰酶(COD),并在Escherichia coli Rosetta (DE3)中异源表达。随后使用Ni–NTA亲和层析法纯化了这些重组脱乙酰酶。全面的酶学表征显示,PdaA在pH 5.0和30°C时活性最佳,而COD在pH 6.5和30°C时表现最佳。这两种脱乙酰酶都具有出色的热稳定性,在50°C下孵育1小时后仍能保持超过90%的活性。动力学研究表明,PdaA和COD具有高效的底物结合能力,Km值分别为58.58 μg/mL和72.05 μg/mL。功能分析表明,这两种脱乙酰酶能够有效催化胶体几丁质的脱乙酰化,脱乙酰程度为59.81-69.02%。此外,当与木聚糖酶结合使用时,它们显著提高了木聚糖的水解效率,与传统的酸水解方法相比,还原糖的产量增加了35-40%。这些脱乙酰酶优异的催化性能和稳定性使它们成为商业几丁质和木聚糖酶法改性的有前途的生物催化剂。

引言

几丁质和木聚糖是两种最丰富的天然多糖,但乙酰基的存在严重限制了它们的功能性和工业应用[1]。几丁质是一种线性的、含量丰富的结构多糖,主要由β-(1,4)-连接的N-乙酰-D-葡糖胺(GlcNAc)单元组成。通过酶法或化学脱乙酰化,几丁质可以转化为壳聚糖,这是一种独特的阳离子生物聚合物,主要由D-葡糖胺(GlcN)和残留的GlcNAc单元组成,具有出色的生物相容性、黏膜粘附性和固有的抗菌活性[2]、[3]、[4]。这些特性使其在先进的伤口敷料、靶向药物输送系统以及组织工程支架等应用中得到广泛应用。在农业领域,基于壳聚糖的制剂作为环保的生物刺激剂,可以增强作物的抗逆性,同时减少对化学农药的依赖[5]、[6]。木聚糖寡糖(XOS)通过木聚糖的水解和脱乙酰化获得,作为下一代益生元在功能性食品行业中受到广泛关注,临床研究表明它们能够在极低的日剂量下选择性刺激有益的肠道微生物群[7]。目前,全球增值壳聚糖和XOS的市场正在呈指数级增长,预计到2030年的复合年增长率为15-20%[8]、[9]、[10]、[11]。因此,将几丁质和木聚糖分别转化为壳聚糖和XOS是非常必要的。
然而,目前从几丁质生产壳聚糖的工业方法仍然依赖于不可持续的化学过程[12]、[13]。传统的壳聚糖制造需要在高温(80-120°C)下用浓碱溶液(40-50% NaOH)处理较长时间(4-6小时),产生大量有害废物,并导致聚合物链的随机断裂[14]。此外,这种策略导致产品质量不稳定,脱乙酰程度(DD)和分子量分布广泛——这些参数对高价值应用中的材料性能至关重要[15]、[16]、[17]。同样,商业XOS的生产主要依赖于耗能高的蒸汽爆炸或强酸水解富含木聚糖的生物质,通常会产生含有糠醛和酚类化合物等不希望的副产物[18]。
对可持续制造过程的需求不断增长,推动了对多糖酶法改性的研究兴趣。微生物脱乙酰酶提供了一种有吸引力的生物催化解决方案,能够在温和的反应条件下运行,并对脱乙酰化模式进行精确控制[19]。然而,酶法多糖改性的广泛工业应用受到几个持续存在的挑战的阻碍。来自真菌来源的可用脱乙酰酶(例如Mucor rouxii [20]、Aspergillus nidulans [21])在异源系统中的表达产量较低,且在工艺条件下的稳定性有限。更重要的是,除了酶的表达和稳定性之外,根本的瓶颈在于天然聚合几丁质的高度结晶结构和严格的水不溶性,这造成了严重的空间阻碍,严重限制了酶的访问性。此外,虽然海洋细菌酶更为稳健,但它们的pH耐受范围较窄,且需要高盐浓度才能达到最佳活性[19]。
为了克服这些限制,我们旨在从Bacillus altitudinis JYY-02中发现新的、适用于工业生产的脱乙酰酶,该菌株在我们之前的研究中已被鉴定为耐热菌株[22]。本研究的新颖之处不仅在于发现了这种新的极端嗜热菌株,还在于目标酶独特的结构和功能特性。具体来说,两个假定的CE4家族基因编码多糖脱乙酰酶(PdaA)和几丁质寡糖脱乙酰酶(COD)被异源表达。这些新型脱乙酰酶表现出出色的热稳定性和独特的金属离子激活机制。此外,结构分析揭示了它们完全不同的静电结合口袋。我们系统地研究了它们的生化特性,并展示了它们在商业几丁质和木聚糖精确酶法改性中的潜在应用,为它们与水解酶的协同作用提供了宝贵的见解。

材料

Escherichia coli BL21 (DE3)、E. coli DH5α、E. coli Rosetta (DE3)和pET-15b载体购自北京全时金生物技术有限公司。B. altitudinis JYY-02保存在我们的实验室中。几丁质购自上海阿拉丁试剂有限公司。山毛榉木木聚糖、玉米芯木聚糖、来自蟹壳的几丁质粉末和木糖购自上海麦克林生化有限公司,T4 DNA连接酶购自大连宝洁有限公司。

生物信息学分析

生物信息学分析显示,PdaA和COD酶具有相似的结构特征。PdaA由246个氨基酸残基组成,理论分子量为28.02 kDa,pI为7.84;COD由254个残基组成,分子量为28.78 kDa,pI为7.79。结构预测表明这两种酶都不包含跨膜结构域(Figure_S1B & S2B),但都含有信号肽(Figure_S1A & S2A),并且表现出强烈的亲水性,GRAVY得分为-0.293。

讨论

对于一些乙酰化多糖,如几丁质和木聚糖,乙酰基的存在严重限制了它们的溶解性、加工性和应用潜力。传统的脱乙酰化方法依赖于化学处理,能耗高,会产生大量环境污染物,并且经常导致副产物不稳定[44]、[45]。为了解决这些挑战,酶法脱乙酰化作为一种非常有前景的绿色替代方案应运而生,吸引了越来越多的研究

结论

本研究报道了从B. altitudinis JYY-02中鉴定并表征了两种属于CE4家族的细菌脱乙酰酶PdaA和COD。在E. coli中异源表达后,这两种酶都被纯化并进行了生化表征,PdaA的纯化倍数达到了11.66倍(产率为73%),COD的纯化倍数达到了15.87倍(产率为72%)。这两种酶具有不同的底物识别机制。PdaA利用碱性残基形成正电荷

CRediT作者贡献声明

Lijiao Wang:验证、方法学、数据管理。Guicai Du:撰写——审稿与编辑、方法学、资金获取、概念构思。Hongzheng Tai:验证、方法学、形式分析。Gengxian Zhou:撰写——审稿与编辑、初稿撰写、验证、方法学、研究、形式分析、概念构思。Qunqun Guo:撰写——审稿与编辑、监督、资源管理、项目协调、方法学、资金获取、概念构思。Chao Wang:

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