对十五个安纳托利亚绵羊品种的人口结构和基因组多样性进行了全面分析

摘要

背景

表征基因组多样性和种群结构对于保护和可持续利用本地绵羊遗传资源至关重要。安纳托利亚是绵羊多样性的重要中心，这里存在多个受到不同育种历史、生态条件和管理实践影响的种群。在这项研究中，我们使用基于SNP的数据对15个安纳托利亚绵羊种群进行了全面的基因组范围评估，以研究它们的基因组多样性、种群结构和遗传关系。

结果

遗传多样性指标显示，各种群在杂合性、等位基因丰富度、次要等位基因频率、多态性位点比例和近交系数方面存在显著异质性，表明种群内部的基因组变异存在明显差异。分子方差分析表明，大部分总遗传变异分布在种群内部，但也有相当一部分可归因于种群间的差异。成对FST估计和主成分分析显示了一个结构化但异质的基因组景观，一些种群表现出明显的分化，而其他种群则聚集得更紧密。系统发育分析进一步通过单系聚类、种群内部分支长度的分布以及种群间的亲缘距离差异支持了这一模式。混合分析确定了三个主要的祖先成分，并揭示了不同种群在祖先组成和混合水平上的差异。纯合子片段（ROH）分析显示，各种群在纯合子片段的丰度和长度分布上存在显著差异，这也反映在基于ROH的基因组近交系数（FROH）谱型中。基因流估计还表明种群间的连通性存在异质性。

结论

总体而言，这些发现表明，尽管安纳托利亚绵羊种群在分化程度、混合程度和基因组近交程度上存在差异，但它们仍保留了多样且结构化的基因组背景。本研究为理解安纳托利亚绵羊种群之间的进化关系提供了坚实的基因组框架，并为未来的保护、管理和育种策略提供了宝贵的见解。