综述：平菇的分子生物学：基因组资源、遗传操作及调控机制

摘要

作为世界上种植最广泛的食用蘑菇之一，侧耳菌属（Pleurotus）因其美味和丰富的营养价值而深受人们喜爱。由于其巨大的经济价值，近年来对侧耳菌属物种的分子生物学研究不断深入。本文首先总结了该属现有的基因组资源现状。包括Pleurotus tuoliensis和Pleurotus ostreatus在内的14个物种的全基因组测序为挖掘功能基因提供了参考数据。尽管侧耳菌属的基因组数据持续增加，但成功的基因转化实例仍然有限。关于不同发育阶段及各种环境压力下关键基因调控机制的研究还不够充分。接下来，本文系统地介绍了基因编辑技术（CRISPR/Cas9、RNAi和基因过表达）在侧耳菌属中的应用。RNAi和基因过表达技术已经非常成熟，并在大多数侧耳菌属物种中得到常规应用。然而，CRISPR/Cas9技术的应用仍仅限于P. eryngii和P. ostreatus。这一限制主要是由于建立基因转化系统的难度以及同源重组效率较低所致。此外，本文还探讨了多组学技术在阐明形态发生和应激反应分子机制方面的价值。为了解决非模式生物缺乏特异性抗体的问题，我们评估了DAP-seq技术在侧耳菌属中的应用潜力，并讨论了其局限性，包括由于缺乏真实的体内环境而可能导致的假阳性风险。本文旨在评估当前针对侧耳菌属的分子生物学研究进展，并为功能基因组学研究及侧耳菌属复杂性状的分子机制分析提供系统的技术支持和见解。

作为世界上种植最广泛的食用蘑菇之一，侧耳菌属因其美味和丰富的营养价值而深受人们喜爱。由于其巨大的经济价值，近年来对侧耳菌属物种的分子生物学研究不断深入。本文首先总结了该属现有的基因组资源现状。包括Pleurotus tuoliensis和Pleurotus ostreatus在内的14个物种的全基因组测序为挖掘功能基因提供了参考数据。尽管侧耳菌属的基因组数据持续增加，但成功的基因转化实例仍然有限。关于不同发育阶段及各种环境压力下关键基因调控机制的研究还不够充分。接下来，本文系统地介绍了基因编辑技术（CRISPR/Cas9、RNAi和基因过表达）在侧耳菌属中的应用。RNAi和基因过表达技术已经非常成熟，并在大多数侧耳菌属物种中得到常规应用。然而，CRISPR/Cas9技术的应用仍仅限于P. eryngii和P. ostreatus。这一限制主要是由于建立基因转化系统的难度以及同源重组效率较低所致。此外，本文还探讨了多组学技术在阐明形态发生和应激反应分子机制方面的价值。为了解决非模式生物缺乏特异性抗体的问题，我们评估了DAP-seq技术在侧耳菌属中的应用潜力，并讨论了其局限性，包括由于缺乏真实的体内环境而可能导致的假阳性风险。本文旨在评估当前针对侧耳菌属的分子生物学研究进展，并为功能基因组学研究及侧耳菌属复杂性状的分子机制分析提供系统的技术支持和见解。