GCNT3被确定为子宫内膜癌中与糖代谢相关的生物标志物

摘要

子宫内膜癌（EC）的发病率正在上升，而糖尿病（DM）会增加患EC的风险。本研究探讨了与糖代谢相关的基因GCNT3在EC中的作用。我们系统地将胰腺组织DM数据集（GSE25724、GSE76896和GSE95849）与TCGA-UCEC队列的RNA测序数据进行了整合。分析策略包括全面的生物信息学流程，主要涵盖差异基因表达分析、生存结果建模、功能富集分析以及详细的免疫浸润评估。我们采用了三种机器学习算法（LASSO回归、支持向量机-递归特征消除（SVM-RFE）和随机森林）来进行特征选择。为避免仅使用同一队列数据导致的偏差，将EC队列随机分为训练集和测试集，比例为7:3。在训练集上进行特征选择，LASSO和SVM-RFE采用5折交叉验证，然后在独立的测试集中评估模型的区分能力和决策曲线性能。最后，通过免疫组化检测80例EC组织和40例组织学确认的正常子宫内膜对照组织，验证GCNT3的表达差异及其在EC中的潜在生物学意义。随后进行了分子对接研究，以探索GCNT3与候选药物阿法替尼（Afatinib）和塞卢替尼（Selumetinib）之间的潜在结合相互作用。研究发现GCNT3在EC中表达上调。在未经调整的Kaplan-Meier分析中，较高的GCNT3表达与更好的总体生存率和无病生存率相关。在调整了年龄、肿瘤分级和肿瘤分期的多变量Cox回归分析中，GCNT3仍然是EC的一个独立预后因素。高GCNT3表达还与较低的肿瘤分级和较早的肿瘤分期相关，并伴有不同的免疫浸润模式。高GCNT3表达还与阿法替尼和塞卢替尼的较低预测IC50值相关。分子对接结果表明GCNT3可能与这些药物存在结合相互作用，这支持了GCNT3表达与药物反应性差异之间的潜在关联。GCNT3可能是EC预后和治疗的潜在生物标志物，其与糖代谢特征和免疫微环境存在一致的相关性。