抗生素污染物的发育毒性综合评估:机器学习预测、斑马鱼验证与网络毒理学

时间:2026年5月21日
来源:Molecular Diversity

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摘要由环境污染物(尤其是抗生素)引起的发育毒性往往具有隐蔽性,并且由于生物累积和随后的口服摄入而常被低估。本研究通过使用摩根指纹(Morgan fingerprints)在精心筛选的发育毒性物质数据集上构建并比较了四种模型,开发了一种基于机器学习的预测策略。最优的随机森林模型在接

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摘要

由环境污染物(尤其是抗生素)引起的发育毒性往往具有隐蔽性,并且由于生物累积和随后的口服摄入而常被低估。本研究通过使用摩根指纹(Morgan fingerprints)在精心筛选的发育毒性物质数据集上构建并比较了四种模型,开发了一种基于机器学习的预测策略。最优的随机森林模型在接收者操作特征曲线(Receiver Operating Characteristic Curve,AUC)下的面积为0.87(95%置信区间:0.83–0.91),准确率为0.80,马修斯相关系数(Matthews correlation coefficient)为0.59。将该集成模型应用于2,341种抗生素后,米康唑(miconazole)被确定为最高概率的候选物质(平均概率为0.97)。在斑马鱼胚胎毒性实验中,低浓度(0.3和3.0 µM)的米康唑暴露在受精后72小时内未导致统计学上的显著死亡率,而高浓度(30 µM)在48小时和72小时时导致死亡率显著升高(p < 0.05,与对照组相比)。网络毒理学和分子对接分析表明,米康唑可能与关键靶点AKT1和BRAF相互作用,可能干扰化学致癌作用–活性氧物种信号通路。这些综合结果表明,米康唑具有潜在的发育毒性,在得出明确的监管结论之前,需要进一步进行机制研究和长期暴露实验。

图形摘要

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由环境污染物(尤其是抗生素)引起的发育毒性往往具有隐蔽性,并且由于生物累积和随后的口服摄入而常被低估。本研究通过使用摩根指纹(Morgan fingerprints)在精心筛选的发育毒性物质数据集上构建并比较了四种模型,开发了一种基于机器学习的预测策略。最优的随机森林模型在接收者操作特征曲线(Receiver Operating Characteristic Curve,AUC)下的面积为0.87(95%置信区间:0.83–0.91),准确率为0.80,马修斯相关系数(Matthews correlation coefficient)为0.59。将该集成模型应用于2,341种抗生素后,米康唑(miconazole)被确定为最高概率的候选物质(平均概率为0.97)。在斑马鱼胚胎毒性实验中,低浓度(0.3和3.0 µM)的米康唑暴露在受精后72小时内未导致统计学上的显著死亡率,而高浓度(30 µM)在48小时和72小时时导致死亡率显著升高(p < 0.05,与对照组相比)。网络毒理学和分子对接分析表明,米康唑可能与关键靶点AKT1和BRAF相互作用,可能干扰化学致癌作用–活性氧物种信号通路。这些综合结果表明,米康唑具有潜在的发育毒性,在得出明确的监管结论之前,需要进一步进行机制研究和长期暴露实验。

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