Single-cell profiling of PDAC reveals lineage-specific transcriptional remodeling associated with aging 研究人员对20例未经治疗PDAC样本进行单细胞测序,质控后保留102,155个高质量细胞,并比较多种整合策略后选择CCA用于批次校正与跨供体整合。无监督聚类鉴定出15类主要细胞群,包括上皮细胞、T细胞亚群、NK细胞、B/浆细胞、成纤维细胞、内皮细胞以及多种髓系细胞等。结果显示,年轻与老年组在总体细胞组成上的差异相对有限,但年龄相关差异表达基因广泛存在于多种细胞谱系中,其中上皮细胞、成纤维细胞和巨噬细胞变化最明显。Augur分析进一步表明,上述三类细胞是对衰老最敏感的区室,提示PDAC中的年龄效应首先表现为特定谱系内的转录重塑,而非单纯细胞比例变化。
The SLC2A1+ ductal cells emerge as a primary target of age-related malignant remodeling 在上皮细胞再聚类后,研究解析出8种转录状态,包括一般上皮群、多种导管细胞群以及少量内分泌、腺泡细胞群。CopyKAT分析显示导管细胞总体以非整倍体恶性细胞为主,其中SLC2A1+与TFF1+导管亚群恶性比例最高。年龄分层比较发现,SLC2A1+导管细胞在老年患者中显著扩增,且其年龄相关转录组漂移最大,同时具有最多的年龄相关差异表达基因。由此可见,SLC2A1+导管细胞是衰老相关恶性重塑最突出的上皮亚群。
An EMT meta-program links SLC2A1+ ductal cells to age-associated malignancy 为区分“年龄效应”与“恶性效应”的相对贡献,研究将各导管细胞状态投射到年龄富集与恶性富集双轴上,发现SLC2A1+导管细胞位于两者兼具的象限,是最具代表性的衰老相关恶性程序。共识NMF识别出7个元程序,其中MP4为EMT程序,MP3为OXPHOS程序。SLC2A1+导管细胞中,EMT程序在老年且恶性的象限内最活跃,而OXPHOS呈相反趋势。进一步比较恶性与非恶性SLC2A1+细胞的年龄相关差异表达后,研究发现老年恶性细胞特异富集TGFβ signaling、EMT以及干扰素反应等通路,支持“衰老选择性扩增SLC2A1+恶性导管细胞,并通过TGFβ介导EMT”的模型。
YY1 is a key transcriptional factor in age-associated SLC2A1+ ductal cells 通过SCENIC+调控网络分析与通路活性相关性整合,研究在SLC2A1+导管细胞中优先识别出YY1、ELF1、HMGA2和ING4四个高置信度转录因子调控子。其中,YY1与TGFβ信号的正相关性最强,其调控子活性在SLC2A1+状态中最高,并在老年患者中进一步增强。相比之下,ELF1虽有类似趋势但较弱,HMGA2和ING4则缺乏稳定的年龄相关增强。基于此,研究将YY1界定为驱动该衰老相关SLC2A1+导管程序的核心转录调控因子。
A multi-gene predictor based on the SLC2A1+ ductal cell signature stratifies patient prognosis 利用TCGA-PAAD数据,研究首先证实高SLC2A1表达与较差生存结局相关。随后从SLC2A1+导管细胞的前50个标志基因中,经逐步Cox筛选并训练RSF模型,建立14基因预后评分系统。该模型在1年、3年和5年时间依赖ROC中均表现出较高AUC,并可将患者清晰分为高风险与低风险组。结果说明,来源于SLC2A1+导管细胞的多基因特征能够有效捕捉PDAC中与EMT、TGF-β及代谢重编程相关的高危生物学。
SLC2A1 promotes EMT and invasive potential in PDAC cells 在PANC-1和Capan-2细胞中,研究通过敲低和过表达实验验证SLC2A1的功能。SLC2A1沉默后,E-cadherin上调、vimentin下调,免疫荧光也显示上皮表型恢复;同时划痕与Transwell实验提示迁移、侵袭能力显著下降。相反,SLC2A1过表达诱导EMT样改变并增强运动侵袭性。由此直接证明,SLC2A1不仅是衰老相关导管细胞标志分子,而且是推动PDAC细胞EMT及侵袭行为的功能因子。