基于多种细胞因子的全基因组关联研究（TWAS）针对七种炎症性皮肤病，确定了角质形成细胞中的潜在致病基因

时间：2026年5月28日

来源：Journal of Allergy and Clinical Immunology

编辑推荐：

美国密歇根大学安娜堡分校生物统计学系

摘要

背景

转录组范围关联研究（TWAS）能够识别基因调控表达（GReX）成分，并在全基因组关联研究（GWAS）中确定致病基因，但通常受限于单一细胞环境的限制。

目的

我们假设在多种条件下对GReX进行建模可以提高识别复杂炎症性疾病致病基因的能力。

方法

我们在角质形成细胞中，对400个转录组在八种促炎细胞因子刺激下进行了TWAS分析，针对七种炎症性皮肤病（特应性皮炎、银屑病、痤疮、斑秃、系统性硬化症、SLE和白癜风）的GWAS数据，对18,599个基因的GReX进行了建模。

结果

我们的TWAS从这七种疾病中识别出274个具有显著基因关联的位点。我们提出了致病基因及其相关的促炎细胞因子刺激因素，包括：银屑病中的ERAP2与IL-17A+TNF刺激相关；痤疮中的WNT10A与IFNγ刺激相关；斑秃、痤疮和SLE中的RAET1L、MAP3K11和ITGAM分别与TNF刺激相关。值得注意的是，我们通过TWAS识别的基因与GWAS信号的高度共定位（p = 1.03×10^-15），并且我们的方法成功捕捉到了超过85%具有共定位eQTL的基因。利用单细胞分辨率的空间分析，我们进一步证明了在银屑病皮肤中，TWAS信号受到表达TNF/IL-17的细胞的显著影响。