通过反向疫苗学技术设计一种多表位金黄色葡萄球菌疫苗，该疫苗整合了蛋白A变体、α-溶血素和纤维连接蛋白A

摘要

金黄色葡萄球菌由于其对抗生素的耐药性日益增强，已成为一个重大的公共卫生问题。鉴于以往针对金黄色葡萄球菌的疫苗候选物在临床应用中取得的成效有限，本研究旨在设计并通过计算方法评估一种新型多表位构建体，该构建体整合了来自纤维连接蛋白A、α-溶血素以及一种脱毒蛋白A变体的序列。通过计算预测并评估了候选表位的免疫原性、毒性和交叉反应性。随后，这些表位通过连接子连接在一起，并添加了佐剂和增强子序列以增强免疫反应。最终构建体表现出良好的理化性质，预测的溶解度较高，且在Ramachandran图谱中97.115%的氨基酸位于理想区域。对接分析表明所选表位能够与相应的HLA I类和II类分子合理结合。完整的疫苗构建体在in silico模拟中显示出与TLR4/MD-2异二聚体的稳定相互作用，并且在100纳秒的分子动力学模拟过程中，受体-疫苗界面保持稳定。免疫模拟预测主要会产生体液免疫反应和CD4+ T辅助细胞反应，同时B细胞、IgM和IgG1的产生量以及记忆CD4+ T细胞、巨噬细胞、IFN-γ、IL-2和IL-12的水平也会增加。密码子优化和in silico克隆技术支持该疫苗构建体在大肠杆菌中的重组表达。综上所述，这种多表位构建体被认为是进一步实验评估对抗金黄色葡萄球菌感染的有希望的候选对象。