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基于候选顺式调控元件的全基因组非编码区罕见变异关联分析
摘要背景大规模全基因组测序(WGS)数据为探索非编码区域中罕见变异在复杂性状中的作用提供了前所未有的机会。然而,与基于基因的外显子分析不同,非编码区域缺乏用于罕见变异检测的明确单元。由于非编码区域包含了大多数已报告的GWAS位点,因此需要建立有效的方法来研究这些区域内罕见变异对性
来源:BMC Genomics
时间:2026-11-06
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MSCF-DM:基于多尺度特征融合与物种条件调制的多物种 DNA 甲基化位点预测模型
摘要
DNA甲基化在基因表达调控、细胞分化、染色质稳定性以及疾病的发展和进展中起着重要作用。现有的深度学习方法通常是为单个物种或数据集单独开发的,这导致难以同时捕捉不同甲基化类型之间的共同模式以及物种间的差异,同时也限制了它们在多个数据集上的统一应用。为了解决
来源:BMC Genomics
时间:2026-11-06
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物种特异性基因复制与调控重连驱动哺乳动物唾液的快速性别特异性进化
摘要背景哺乳动物的唾液在消化、免疫和宿主-微生物群相互作用中起着重要作用,但其蛋白质组成在不同物种和性别之间存在显著差异。这种多样性使得唾液成为研究基因表达进化的一个强大模型。在此,我们从基因组、转录组和蛋白质组层面比较了小鼠和人类的唾液腺及其分泌物,以了解唾液成分的进化过程。结
来源:BMC Genomics
时间:2026-11-06
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舌鳎Dmrt1缺失诱导性别逆转的表观遗传调控:DNA甲基化与基因表达网络重塑
摘要背景Dmrt1 是在脊椎动物中保守的主要决定雄性性别的基因。在舌鳎(Cynoglossus semilaevis)中,这是一种具有 ZZ/ZW 性别决定系统且雌性生长优势明显的重要经济鱼类,dmrt1 基因的缺失会导致 ZZ 型雄性表现出雌性化表型。然而,其背后的表观遗传调控
来源:BMC Genomics
时间:2026-11-06
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高温暴露诱导中国大鲵卵巢分化延迟及阶段特异性分子重塑
摘要环境温度的升高可能会干扰两栖动物的性腺分化,进而改变性别比例,对对温度敏感的种群构成威胁。中国大鲵(Andrias davidianus;CGS)是现存最大的两栖动物,在野外处于极度濒危状态,同时也是中国重要的水产养殖物种。然而,长时间的热暴露如何影响CGS的性腺分化目前尚不
来源:BMC Genomics
时间:2026-11-06
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赤霉素处理对 Sistan Yaghooti 葡萄果串紧凑度形成的转录组分析
摘要果串紧凑度是影响鲜食葡萄品种果实品质和抗病性的重要农艺性状。为了研究果串结构形成的转录机制以及赤霉素(GA)处理的效果,我们对经过GA处理的植株和对照植株在三个发育阶段的Vitis vinifera cv. Sistan Yaghooti果串组织进行了RNA-seq分析。使用
来源:BMC Genomic Data
时间:2026-11-06
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马尼拉蛤选择性摄食浮游植物的糖编码机制:黏膜凝集素介导的碳水化合物识别
摘要
背景
滤食性双壳类动物在沿海生态系统和海水养殖系统中具有重要的生态和经济意义,它们的摄食行为显著影响营养物质的生物地球化学循环以及水产养殖的产量。尽管人们已经认识到双壳类动物具有选择性摄取颗粒的能力,但其背后的内在机制仍然很大程度上尚未被阐明。本
来源:BMC Biology
时间:2026-11-06
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海参 Holothuria glaberrima 染色体级别基因组组装及再生相关基因家族特征分析
摘要背景海参 Holothuria glaberrima 是再生研究中的重要模型,它帮助人们发现了肠道和神经元再生的关键细胞和分子特性。然而,由于缺乏高质量的参考基因组,对该物种再生过程的分子研究受到了限制。结果我们利用 PacBio 长读长序列测序和 Omni-C 染色质构象捕
来源:BMC Biology
时间:2026-11-06
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基于双共振压电细胞测定平台揭示 PRPF8 突变 iPSC-RPE 细胞力学特性
摘要背景致病的PRPF8变异体会导致严重的视网膜退化,但它们在视网膜色素上皮(RPE)中的生物学机制相关特性尚不明确。我们开发并应用了一种重新配置的双共振压电细胞测定(DRPC)平台,用于无标记地分析患者来源的诱导多能干细胞衍生的RPE单层细胞(iPSC-RPE, iRPE)的力
来源:Journal of Biological Engineering
时间:2026-11-06
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基于合成联盟的 CO2 固定与柠檬烯生产:生长模式调控与概念验证
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摘要微生物将二氧化碳(CO2)转化为化学物质对于可持续的生物经济至关重要。然而,这一过程常常受到低碳固定率的制约。光自养菌与异养菌的共培养系统可以通过利用光自养菌的强大碳汇来驱动碳固定,进而将其与异养菌的化学生产相结合,从而克服这一瓶颈。尽管潜力巨大,但利用这种共培养系统
来源:Microbial Cell Factories
时间:2026-11-06