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基于CRISPR/Cas9的四川灵芝单核菌株基因编辑系统构建及基因型依赖性效率评估
本研究成功构建了一个整合七种关键元件的双sgRNA CRISPR/Cas9基因编辑平台,首次在四川灵芝(Ganoderma sichuanense)中系统筛选了适用于基因编辑的单核受体菌株。研究证实基因编辑效率存在显著的基因型依赖性,并成功编辑了生长、发育及代谢相关的多个功能基因,为灵芝属真菌的功能基因组学研究与遗传改良提供了强有力的技术支撑和宝贵的菌株资源。
来源:Journal of Fungi
时间:2025-12-29
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基于扩散模型的单细胞转录组扰动预测去偏框架:dbDiffusion的创新与应用
本文介绍了一种名为dbDiffusion的创新计算框架,该框架结合扩散模型(Diffusion Model)与分类器无关引导(classifier-free guidance),通过变分自编码器(VAE)在潜在空间生成单细胞转录组数据,能够准确预测未见过的遗传扰动(如CRISPR扰动)对基因表达的影响。与依赖大型语言模型(LLM)或基础模型的方法不同,dbDiffusion利用扰动嵌入(embedding)和去偏(debiasing)技术,显著提升了预测的准确性和统计推断的稳健性。在多个Perturb-seq数据集上的基准测试表明,该方法在预测扰动响应、构建置信区间(CI)及识别差异表达基因(DEG)方面均优于现有方法(如GEARS、scGPT等),为功能基因组学提供了可扩展的计算工具。
来源:Proceedings of the National Academy of Sciences
时间:2025-12-29
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基于RT-RPA与CRISPR/Cas12a的一管式现场可视化检测技术用于欧亚类禽H1N1猪流感病毒的快速诊断
本文开发了一种创新的一管式双信号检测平台,将逆转录重组酶聚合酶扩增(RT-RPA)与CRISPR/Cas12a技术相结合,实现了欧亚类禽H1N1猪流感病毒(EA H1N1 SIV)的快速现场检测。该检测方法以血凝素(HA)基因保守区为靶点,检测限达2 copies/μL,30分钟内即可完成,且与RT-qPCR符合率达94.18%。该技术具备高特异性、操作简便及设备便携等优势,为猪流感现场监测提供了重要技术支撑。
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YTHDF3通过抑制I型干扰素刺激基因依赖性抗肿瘤免疫促进HPV相关宫颈癌发生
本研究针对高危HPV(人乳头瘤病毒)持续感染如何通过表观转录组调控逃逸宿主抗病毒免疫的难题,揭示了m6A阅读蛋白YTHDF3通过稳定STAT3 mRNA负向调控I型干扰素信号通路的新机制。研究人员发现YTHDF3-STAT3轴可抑制IRF7/IFN-α介导的抗病毒免疫,促进HPV E6/E7致癌蛋白持续表达,并塑造免疫抑制微环境。该研究为HPV相关恶性肿瘤提供了新的治疗靶点,发表于《Cell Death & Disease》。
来源:Cell Death & Disease
时间:2025-12-28
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综述:基于CRISPR的纸基传感器在核酸检测方面的最新进展
CRISPR/Cas系统与纸基传感器结合,开发了高特异性、灵敏的核酸检测技术,涵盖荧光、颜色、电化学、SERS及双模式信号策略,并集成lfas和微流控平台,通过水凝胶增强稳定性和深度学习辅助分析,推动便携快速检测发展。
来源:TrAC Trends in Analytical Chemistry
时间:2025-12-28
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层层包覆的壳聚糖-CRISPR/Cas9 mTOR纳米颗粒:一种抑制晶状体上皮细胞增殖和迁移的新方法,用于预防后囊混浊
CRISPR/Cas9靶向mTOR的壳聚糖纳米颗粒通过LbL技术负载于人工晶状体表面,有效抑制人眼晶状体上皮细胞增殖迁移及后囊混浊形成,为长期防控提供新策略。
来源:Experimental Cell Research
时间:2025-12-28
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综述:棉花防御与胁迫调控的分子见解:CRISPR-Cas9介导生物与非生物胁迫通路关键基因编辑
本文系统综述了CRISPR-Cas9技术在棉花育种中的应用进展,重点探讨了该技术如何通过精准编辑关键基因(如GhPDS、GhCLA1、GhAOC2、Gh14-3-3d等),揭示棉花在应对生物胁迫(如黄萎病、棉铃虫)和非生物胁迫(如干旱、盐碱、高温)过程中的分子调控网络。文章深入解析了水杨酸(SA)-茉莉酸(JA)-乙烯(ET)信号通路间的交叉对话、活性氧(ROS)调控以及次生代谢物(如棉酚)生物合成机制,并展望了整合多组学、Prime编辑等前沿策略以培育高抗逆棉花新品种的未来方向。
来源:Physiological and Molecular Plant Pathology
时间:2025-12-28
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综述:通过单细胞转录组学探究植物中的细胞景观
植物单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术为解析细胞异质性和发育机制提供了高分辨率方法,但其与功能基因组学和空间技术的整合仍存局限。本文综述了scRNA-seq在揭示植物多组织发育轨迹、细胞命运决定及胁迫响应中的进展,强调其在候选基因挖掘(如CRISPR验证)和跨物种应用中的潜力,同时批判性评估了技术挑战并提出解决方案,为精准育种提供理论支撑。
来源:Plant Science
时间:2025-12-28
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用于通用有机磷农药检测的“瘦身”探针技术:单探针-Cas12a集成策略的开发与验证
氯氟吡嗪(CPF)检测中,基于CRISPR/Cas12a的LAC策略通过DNA激活器双态机制实现高效电化学传感,结合分子对接模拟验证 CPF与适配体的特异性结合,构建两步快速检测体系,在复杂基质中展现出高特异性和灵敏度。
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靶向“苦味基因”的基因组编辑技术消除柑橘中苦味黄烷酮合成:新品种培育与种植气候扩展的前景
本研究通过CRISPR/Cas9基因组编辑技术靶向柑橘苦味关键基因——黄烷酮-7-O-葡萄糖苷-1,2-鼠李糖基转移酶(1,2RhaT),成功构建了无苦味柑橘新种质。编辑株系中苦味新橙皮糖苷(如柚皮苷、新橙皮苷)合成被完全抑制,同时无味芦丁糖苷(如橙皮素、香风草苷)代偿性增加,在保留黄酮类化合物健康功效的前提下,为拓展葡萄柚市场及培育抗寒适口柑橘品种开辟新途径。
来源:The Plant Journal
时间:2025-12-27