PCBP2通过抑制m6A甲基化稳定PARP1 mRNA介导乳腺癌奥拉帕尼耐药的新机制

时间:2025年10月16日
来源:Cancer Research

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本研究发现RNA结合蛋白PCBP2通过直接结合PARP1 mRNA的3′ UTR,抑制m6A甲基化修饰,增强PARP1 mRNA稳定性,从而上调PARP1蛋白表达并增强DNA损伤修复能力,最终导致BRCA突变乳腺癌对奥拉帕尼(PARPi)耐药。靶向PCBP2-m6A-PARP1轴可逆转耐药性,为克服PARPi耐药提供了新策略。

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引言

乳腺癌是全球女性最常见的恶性肿瘤,其中BRCA1/2突变患者因同源重组修复(HR)缺陷而对PARP抑制剂(PARPi)如奥拉帕尼敏感,但耐药性仍是临床主要挑战。研究表明,RNA结合蛋白(RBP)可通过转录后调控介导耐药性。多聚胞嘧啶结合蛋白2(PCBP2)是一种序列特异性RBP,能与poly(C) motif结合,调控mRNA稳定性、剪接和翻译。本研究旨在探索PCBP2在奥拉帕尼耐药中的作用机制。

PCBP2与奥拉帕尼敏感性相关

通过生物信息学分析和细胞实验,发现PCBP2在奥拉帕尼耐药细胞中表达上调。在BRCA突变乳腺癌细胞(如SUM149PT和HCC1937)中,过表达PCBP2可诱导奥拉帕尼耐药并增强细胞增殖,而敲低PCBP2则恢复敏感性。机制上,PCBP2直接与PARP1 mRNA结合,抑制其m6A甲基化,从而稳定mRNA并增加PARP1蛋白表达。PARP1上调增强了碱基切除修复(BER)通路活性,减少了DNA损伤积累(γH2AX水平降低),并抑制了凋亡信号(Bcl2上调,Bax和cleaved caspase-3下调)。

稳定敲低PCBP2增强奥拉帕尼敏感性

建立奥拉帕尼耐药细胞株(SUM149PTOlaR和HCC1937OlaR)后,发现其PCBP2和PARP1表达显著升高。敲低PCBP2可降低PARP1表达,减弱BER修复能力(XRCC1、POLβ、LIGIII水平下降),增加DNA损伤和凋亡,并恢复奥拉帕尼敏感性。体内实验进一步证实,敲低PCBP2可抑制肿瘤生长,降低PARP1表达,增加γH2AX水平。

PCBP2通过直接结合PARP1 mRNA 3′ UTR上调PARP1

RIP和RNA pulldown实验证实PCBP2直接结合PARP1 mRNA的3′ UTR,而非5′ UTR或编码区。KH2结构域是结合关键区域。PCBP2过表达延长PARP1 mRNA半衰期,而敲低则加速其降解。缺失3′ UTR的PARP1表达不受PCBP2调控,证实其依赖性。

PCBP2缺失促进m6A甲基化复合物招募并加速PARP1 mRNA降解

m6A是常见的mRNA修饰,由甲基转移酶复合物(METTL3-METTL14-WTAP)催化,并被读者蛋白(如YTHDF2)识别以介导降解。PCBP2敲低增加METTL3/METTL14/WTAP在PARP1 mRNA 3′ UTR的招募,增强m6A修饰,促进YTHDF2介导的降解。使用dCas13-ΔMETTL3系统靶向恢复m6A修饰可部分逆转PCBP2过表达引起的PARP1上调和耐药性。

YTHDF2依赖的PARP1 mRNA稳定性调控奥拉帕尼敏感性

YTHDF2(而非YTHDF1)是介导m6A依赖性PARP1 mRNA降解的关键读者。敲低YTHDF2可恢复PCBP2敲低引起的PARP1 mRNA不稳定性和奥拉帕尼敏感性。靶向招募YTHDF21–400至PARP1 mRNA 3′ UTR可加速其降解,逆转PCBP2过表达效应。

PCBP2–m6A–PARP1耐药轴的临床相关性

乳腺癌患者样本分析显示,奥拉帕尼耐药组中PCBP2和PARP1蛋白表达显著升高,γH2AX水平降低,而METTL3和YTHDF2表达无显著变化,与体外结果一致,证实PCBP2通过抑制m6A修饰稳定PARP1 mRNA的临床意义。

讨论

本研究揭示了PCBP2作为RBP通过抑制m6A甲基化稳定PARP1 mRNA的新机制,促进了BRCA突变乳腺癌的奥拉帕尼耐药。靶向PCBP2或m6A调控轴可能成为克服PARPi耐药的有效策略。未来研究应探索PCBP2抑制剂与m6A调节剂的联合治疗潜力。

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